N1c1(L708+;Y9022+)

[Nimissin]

Сделал калибровку средней скорости мутаций для 427-маркерного гаплотипа из данных по Y-STR группы YFull. Возраст гаплогруппы N-Р298
(http://www.yfull.com/tree/N/), объединяющей якутскую ветвь N-M2019 и различные ветви N-L1026 оценивается в 4900 лет одновременно по SNP серии М (Poznik et al., 2013) и 111-маркерным STR гаплотипам (на самом деле в расчете 91 маркер). Тогда средняя скорость мутаций для гигантской панели из 427 микросателлитов YFull будет составлять
0.00202 на локус на поколение 31.5 лет.

Применение этой скорости для расчета возраста общего предка ананьинской ветви (образец 266916) и ветви N-L1026 (12 образцов) дает
6000 +/- 700 лет. Расчет сделан по 414 локусам.

TMRCA образцов 266916 (ананьинская ветвь) и 119747 (якутская ветвь) около 5100 +/- 600 лет. Оценено по тем же 414 STR локусам.

В пределах погрешности оценки (6000 и 5100) совпадают, как и должно быть. По снипам серии М я получил время расхождения ананьинской ветви и объединенной ветви N-P298 около 5700 лет. Это наиболее точная оценка.

[dars]

Сделал калибровку средней скорости мутаций для 427-маркерного гаплотипа из данных по Y-STR группы YFull. Возраст гаплогруппы N-Р298
(http://www.yfull.com/tree/N/), объединяющей якутскую ветвь N-M2019 и различные ветви N-L1026 оценивается в 4900 лет одновременно по SNP серии М (Poznik et al., 2013) и 111-маркерным STR гаплотипам (на самом деле в расчете 91 маркер). Тогда средняя скорость мутаций для гигантской панели из 427 микросателлитов YFull будет составлять
0.00202 на локус на поколение 31.5 лет.

Применение этой скорости для расчета возраста общего предка ананьинской ветви (образец 266916) и ветви N-L1026 (12 образцов) дает
6000 +/- 700 лет. Расчет сделан по 414 локусам.

TMRCA образцов 266916 (ананьинская ветвь) и 119747 (якутская ветвь) около 5100 +/- 600 лет. Оценено по тем же 414 STR локусам.

В пределах погрешности оценки (6000 и 5100) совпадают, как и должно быть. По снипам серии М я получил время расхождения ананьинской ветви и объединенной ветви N-P298 около 5700 лет. Это наиболее точная оценка.

как же давно!

[Nimissin]

Провел сравнение снипов образца 266916 (ананьинская ветвь) и образца HGDP00883 (ананьинская ветвь).
Из-за относительно маленькой области секвенирования HGDP00883 (0.5 Mbp) удалось сравнить только 11 позиций:
7557581 А С: 266916 C, HGDP00883 C
8542849 C G: 266916 G, HGDP00883 C
16697327 C A: 266916 A, HGDP00883 C
17493872 G T: 266916 T, HGDP00883 T
15585553 T G: 266916 G, HGDP00883 G
17461498 G A: 266916 A, HGDP00883 G
19146799 C T: 266916 T, HGDP00883 C
21905966 T G: 266916 G, HGDP00883 G
7633708 G T: 266916 T, HGDP00883 G
8414346 T G: 266916 G, HGDP00883 G
23762152 C T: 266916 T, HGDP00883 C
В образце HGDP00883 только 5 мутаций из 11, обнаруженных у 266916.
С учетом возраста ананьинской ветви 5700 лет получаем оценку TMRCA образцов 266916 и 00883 около 3100 лет.
Делаем проверку по Y-STR локусам. Есть одновременно данные по 54 маркерам. Скорость Хейнилы 0.002045 на локус на поколение 31.5 лет.
По методу ASD получаем 2850 +/- 870 лет. Расчеты по SNP и STR хорошо согласуются друг с другом.

[Nimissin]

Sandaraev 203300
F4133+, M2019+, M2119+.
Образец относится к той же большой ветви с возрастом около 5 тыс. лет, что и якуты N1c1.

[Dimitri]

Также эти известные YFULL снипы YFULL считает приватными и их нет у других участников группы N:
S17902, S25974, P65_3, PF4014, PF6588, S25973, PF3262, S13339, PF3523/Y1867, K465, Y1796, S25969, Z5347, PF397, PF412, PF453, PF454, PF396, PF6730, PF4281, PF6729, CTS5022, PF390, PF3676, S21353

Что делать дальше - не знаю

Я заказал себе Big Y. Надеюсь, после анализа моего результата хотя бы один из найденных у Вас снипов перестанет быть приватным и начнет официально маркировать нашу ветвь

[Dimitri]

В пределах погрешности оценки (6000 и 5100) совпадают, как и должно быть. По снипам серии М я получил время расхождения ананьинской ветви и объединенной ветви N-P298 около 5700 лет. Это наиболее точная оценка.

Спасибо за оценку!
Но вот что меня в ней беспокоит: она относится к периоду, когда уральская языковая общность уже распалась, а финно-угорская - еще нет. Получается, родоначальник "ананьинской" ветки, расставшись со своими сородичами, унес с собой финно-угорский праязык. Как же получилось, что его потомки заговорили на пермских языках, которые выделились из финно-пермского праязыка значительно позже распада финно-угорского (4000 лет назад)? В то, что "ананьинцы" были полностью ассимилированы носителями родственного языка, мне не верится. Или лингвисты ошибаются в своих оценках?
Возможно, мой Big Y поможет внести ясность в этот вопрос.

[Nimissin]

В пределах погрешности оценки (6000 и 5100) совпадают, как и должно быть. По снипам серии М я получил время расхождения ананьинской ветви и объединенной ветви N-P298 около 5700 лет. Это наиболее точная оценка.

Спасибо за оценку!
Но вот что меня в ней беспокоит: она относится к периоду, когда уральская языковая общность уже распалась, а финно-угорская - еще нет. Получается, родоначальник "ананьинской" ветки, расставшись со своими сородичами, унес с собой финно-угорский праязык. Как же получилось, что его потомки заговорили на пермских языках, которые выделились из финно-пермского праязыка значительно позже распада финно-угорского (4000 лет назад)? В то, что "ананьинцы" были полностью ассимилированы носителями родственного языка, мне не верится. Или лингвисты ошибаются в своих оценках?
Возможно, мой Big Y поможет внести ясность в этот вопрос.

Будем ждать Ваш BigY. Занимаюсь сейчас уточнением средней скорости SNP мутаций. Датировки по снипам могут немного подвинуться.

Также эти известные YFULL снипы YFULL считает приватными и их нет у других участников группы N:
S17902, S25974, P65_3, PF4014, PF6588, S25973, PF3262, S13339, PF3523/Y1867, K465, Y1796, S25969, Z5347, PF397, PF412, PF453, PF454, PF396, PF6730, PF4281, PF6729, CTS5022, PF390, PF3676, S21353

Что делать дальше - не знаю

Я заказал себе Big Y. Надеюсь, после анализа моего результата хотя бы один из найденных у Вас снипов перестанет быть приватным и начнет официально маркировать нашу ветвь

По опыту обработки "приватных" снипов. В указанном случае (первый образец BigY для ананьинской ветви) подавляющее большинство известных ранее снипов не пройдут фильтры для отсеивания неправильного маппирования и ошибок чтения.

[Yurgan]

В пределах погрешности оценки (6000 и 5100) совпадают, как и должно быть. По снипам серии М я получил время расхождения ананьинской ветви и объединенной ветви N-P298 около 5700 лет. Это наиболее точная оценка.

Спасибо за оценку!
Но вот что меня в ней беспокоит: она относится к периоду, когда уральская языковая общность уже распалась, а финно-угорская - еще нет. Получается, родоначальник "ананьинской" ветки, расставшись со своими сородичами, унес с собой финно-угорский праязык. Как же получилось, что его потомки заговорили на пермских языках, которые выделились из финно-пермского праязыка значительно позже распада финно-угорского (4000 лет назад)? В то, что "ананьинцы" были полностью ассимилированы носителями родственного языка, мне не верится. Или лингвисты ошибаются в своих оценках?
Возможно, мой Big Y поможет внести ясность в этот вопрос.

Думаю, ананьинцы говорили на каком-то языке, не совсем близком к языку жителей Прикамья, но именно внедрение другого языка привело к формированию именно финно-пермских языков.

[Nimissin]

Заказаны снипы М2019, М2119, F4133 Немаричу N92307.
Гаплотипы Немарича, Сандараева и Адамова образуют равносторонний треугольник по генетическому расстоянию. Между каждой парой около 20 мутационных шагов на 37 маркеров.
Родство на уровне 3000 лет. Между хакасом и якутом - вполне логичное. А вот происхождение хорвата надо обдумывать. Пока в голову приходят только авары и гунны.
Напомню, что образцы 119747 (Адамов) и 203300 (Сандараев) показали мутации М2019, М2119, F4133.

[mouglley]

А вот происхождение хорвата надо обдумывать. Пока в голову приходят только авары и гунны.

Может быть, накладывается то же влияние, которое дало преобладание гаплогруппы Q на одном из хорватских островов (не вспомню каком, то ли Крк - ударение на "р")?

[dars]

Я заказал себе Big Y. Надеюсь, после анализа моего результата хотя бы один из найденных у Вас снипов перестанет быть приватным и начнет официально маркировать нашу ветвь

Когда ожидается результат?

[Dimitri]

Когда ожидается результат?

"1-2 weeks".
Впрочем, этому обещанию уже недели три.

[Mukovnikov]

Когда ожидается результат?

"1-2 weeks".
Впрочем, этому обещанию уже недели три.

Сегодня получен результат BigY 338574 (Savo branch). Тоже 586 батч. Видимо, ждать осталось недолго.

[Mukovnikov]

Когда ожидается результат?

"1-2 weeks".
Впрочем, этому обещанию уже недели три.

Результат готов.

[Dimitri]

Ага, только что получил письмо от FTDNA.
Конечно, сразу полез в BigY Matches и ожидаемо увидел там уважаемого thenuad:

• 220 Shared Novel Variants
• 1 Known SNP Difference
• Non-Matchning Known SNPs: PF3676
• Matching SNPs: 24 894

Попросил BAM-файл для YFull.