Еще посмотрел вот этих недотипированных:
VK16 Russia_Ladoga_5680-2
VK23 Russia_Ladoga_5680-9
VK410 Russia_Ladoga_5680-15
VK539 Ukraine_Shestovitsa-8870-97
Нет, не наши, снипы уровня z73 в минусах.
По VK492,VK555,VK552, VK146,VK515,VK524 попробую еще их через BAM Analysis Kit пропустить, может удастся всё таки выявить у них подветку, может я что упустил.
UPD: Нет, ничего по ним нового не нашел. Видимо они с ветвей которые пресеклись и до наших времен не дожили.