АвторТема: Помогите определить субклад  (Прочитано 37818 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн wbullАвтор темы

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #45 : 17 Апрель 2012, 14:53:01 »
Генетические дистанции на 37 маркёрах:

13: Commisso (E-V22*-Misc, Unknown),  Hunt (E-V22*-B, England), Straub (E-V13, Germany),
14: Richards (E-V13, Unknown)

Как видим, V13 тоже недалеко, да и косвенная близость - германцы, Ричардс.


На приведенном выше филогенетическом древе:

Comisso - V22*Misc_3
Hunt - V22*B_1
Straub - V13_2
Richards - V13_4
 
Как видите, TNT на древе поместило их довольно далеко от меня.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 17192
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #46 : 17 Апрель 2012, 15:16:25 »
Не верьте деревьям, они не стабильны. Стоит только добавить/убавить один гаплотип, как топология меняется. Важнее фактические совпадения, а не древообработка. Она скорее годится для филогенетических выявлений кластеров/субкладов (т. е. заведомо огромной толпы близких гаплотипов)

Оффлайн wbullАвтор темы

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #47 : 17 Апрель 2012, 15:40:26 »
Во что же тогда верить? Все зыбко и неопределенно. :(
Я тут где то более месяца назад на перпендикулярном форуме в разделе "Новички задают вопросы" задал совершенно невинный на мой тогдашний взгляд  вопрос. Я спросил, что вот Вы рекомендуете для определения места на древе делать 67 маркерный тест, а FTDNA советует Deepclade тест, что же лучше? К моему большому удивлению реакция была весьма агрессивная. Даже мне сказали, что в науке дальше лаборанта мне ничего не светит... Чем весьма меня посмешили. :)
Однако теперь я понял, что вопрос то был один из самых больных. ;D

Оффлайн Agni

  • Сообщений: 699
  • Рейтинг +30/-56
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #48 : 17 Апрель 2012, 16:29:53 »
Я тут где то более месяца назад на перпендикулярном форуме в разделе "Новички задают вопросы" задал совершенно невинный на мой тогдашний взгляд  вопрос. Я спросил, что вот Вы рекомендуете для определения места на древе делать 67 маркерный тест, а FTDNA советует Deepclade тест, что же лучше? К моему большому удивлению реакция была весьма агрессивная. Даже мне сказали, что в науке дальше лаборанта мне ничего не светит...
Родство.ру? Такое поведение типичное для них, они там всех так кроют, могут и матом, а унижать для них честь, кто лучше унизит новичка тот более выдающийся академик...


Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 17192
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #49 : 18 Апрель 2012, 07:43:04 »
Цитировать
Вы рекомендуете для определения места на древе делать 67 маркерный тест, а FTDNA советует Deepclade тест, что же лучше?
Для такой феерической гаплогруппы как E1b1b1 - снипы первичны. Я не берусь судить другие гаплогруппы - там возможна весьма точная предикция по 67 маркёрам. У нас - нет. Из личного опыта: я сразу заказал 67 маркёров. Ребята предсказали - E-V22 или E-M84. На самом деле у меня E-M34. При наличии совпаденцев 11/12 как среди E-V22, так и среди E-M84.

Оффлайн wbullАвтор темы

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #50 : 18 Апрель 2012, 12:08:23 »
Цитировать
Вы рекомендуете для определения места на древе делать 67 маркерный тест, а FTDNA советует Deepclade тест, что же лучше?
Для такой феерической гаплогруппы как E1b1b1 - снипы первичны. Я не берусь судить другие гаплогруппы - там возможна весьма точная предикция по 67 маркёрам. У нас - нет. Из личного опыта: я сразу заказал 67 маркёров. Ребята предсказали - E-V22 или E-M84. На самом деле у меня E-M34. При наличии совпаденцев 11/12 как среди E-V22, так и среди E-M84.
Все же уменя сложилось мнение, что рассчитываемые деревья очень субъективны. К сожалению, они многовариантны и всегда можно выбрать то, что хочется получить расчетчику. Особенно, если поиграть весами, длинами, укоренением....  :)   Хотя может быть я  и не прав, так как только начинаю считать. ;D
Хотя на родстве.ру Igor61 дал мне кажется очень хороший ответ на мой вопрос о соотношении Deep Clade test и STR маркеров:
"Для цели оптимального (точного не существует) позиционирования на древе Deep Clade test (т.е. анализ нескольких снипов по скидочной цене) реально работает только для гаплогрупп E1b, J2 и R1b. Для всех остальных он бесполезен, поскольку там анализируются или слишком общие снипы, на уровне всей гаплогруппы, или те, что у всех без исключения отрицательны. Это наследство работ попгенетики 5-6-7-летней давности, когда субклады щедро кроили по единичным снипам. Как оказалось, многие из них были частными, т.е. встречались у единичных образцов. К сожалению, в вопросе обновления этого скидочного пакета фирма оказалась на удивление неповоротливой. Клиенты ловятся на эту удочку и платят, зачем что-то менять?
Снипы, что действительно полезны для филогении, приходится, как правило, заказывать в индивидуальном порядке. Какие именно, можно предположить из STR маркеров, желательно в формате 37 и более. Так что все взаимосвязано. Если Вы или Ваши знакомые не относятся к упомянутой выще тройке гаплогрупп, забудьте о Deep Clade - это разновидность бесплатного сыра. В нынешнем его состоянии, во всяком случае."


Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 17192
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #51 : 18 Апрель 2012, 13:31:10 »
Цитировать
рассчитываемые деревья очень субъективны. К сожалению, они многовариантны и всегда можно выбрать то, что хочется получить расчетчику. Особенно, если поиграть весами, длинами, укоренением....     Хотя может быть я  и не прав, так как только начинаю считать.
Не совсем. Кластеры близких родственников будут устойчивыми на всех вариантах.

Касаемо мнения Игоря Рожанского:
Цитировать
Deep Clade test (т.е. анализ нескольких снипов по скидочной цене) реально работает только для гаплогрупп E1b, J2 и R1b.
на сегодняшний день даже для E1b1b1 DCT тоже излишен, т. к. по 67 маркёрам можно определить наиболее вероятный снип и сразу заказывать именно его.

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #52 : 18 Апрель 2012, 14:58:07 »
Для подавляющего большинства J2 заказ Deep Clade теста - очень неудачная трата денег. Я бы не стал назвать "бесплатным" сыр за 139$, особенно учитывая, что в период скидок за 148$ можно сделать апгрейд с 12 до 67.
Видимо, благодаря советчикам, не разбирающимся в J2, люди и заказывают Deep Clade, хотя можно обойтись 1-2 снипами.

Оффлайн wbullАвтор темы

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #53 : 18 Апрель 2012, 17:27:18 »
Но у меня 37 маркеров и даже на них ближайшие родственники на 13 GD, те совсем даже не родственники. :(

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 17192
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #54 : 19 Апрель 2012, 08:03:16 »
Цитировать
37 маркеров и даже на них ближайшие родственники на 13 GD
Это нормальная ситуация для северных E1b1b1.

Оффлайн wbullАвтор темы

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #55 : 20 Апрель 2012, 13:17:20 »
Уважаемый Farroukh
Вы не знаете дает ли чего нибудь полезное присоединение к геногеографическому проекту, которое предлагает FTDNA за 15 баксов?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 17192
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #56 : 20 Апрель 2012, 13:21:38 »
Брат, я и сам не знаю. Для наших узкоспециализирвоанных гаплоцелей достаточно быть в ysearch.org и haplozone.net.

Оффлайн wbullАвтор темы

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #57 : 05 Май 2012, 11:47:53 »
Сегодня получил ответ из FTDNA V22-, так что египтянина из меня не вышло. ;D
И куда же теперь? ???

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6778
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #58 : 05 Май 2012, 11:49:47 »
Сегодня получил ответ из FTDNA V22-, так что египтянина из меня не вышло. ;D
И куда же теперь? ???
А V13 заказали?

Оффлайн wbullАвтор темы

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Помогите определить субклад
« Ответ #59 : 05 Май 2012, 17:56:07 »
Сегодня получил ответ из FTDNA V22-, так что египтянина из меня не вышло. ;D
И куда же теперь? ???
А V13 заказали?

Нет, поскольку предиктор Вадима Урасина предсказал мне V22. Специалисты же с гаплозоны, отнесшие меня сначало к V13 candidate, когда просмотрели все 37 маркеров сказали, что на V13 не похоже, перевели меня в V22 candidat и посоветовали заказать V22 снип, что я и сделал.
Так, что все гадалки ошиблись. ;D
Теперь какой то новичок на гаплозоне советует мне сначала заказать снипы Z1919/1920, так как они родительские для V13 и V22.
Только не понимаю, а какой в этом смысл. :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.