Оценки условной вероятности перехода из одного состояния в другое, например, для пары отец-сын и иных, без привязки к разным гаплогруппам (последнее есть искусственное, надуманное, условное разделение), вполне может быть осуществлено и использовано для исследования мутаций, как марковского процесса.
Я предполагаю, что это уже сделано или делается.
Вы меня поражаете.
1. Вы так много фантазируете - кто что сделал - тут не фантазировать, а знать надо. Особенно про сотни тысяч оттестированных семей
2. Никто не доказал что он марковский, или еще какой-то, это лишь ваши фантазии. Которые вы выдаете за утверждения.
3. Чтоб посчитать вероятности перехода нужно еще больше, намного намного больше, оттестированных, чем простые вероятности. Потому-что там величины входят в произведения. Плюс надо доказать что эти переходные вероятности имеют под собой основания, а не просто случайно получены из-за статистической выборки - так что миллионы и миллионы тестируемых вам светит.
4. Если мы хотим использовать простую цепь Маркова, то нам нужна полная матрица переходов, неполную нельзя, а вот это-то нам и несветит никогда, поскольку по определению всех значений СТР нет ни в какой выборки, и построить такую матрицу просто невозможно (во всяком случае для людей).
5. Ну и наконец, никто не доказал что это простой марковский процесс, а не высших порядков. Например, в м.п. постулируется что переходная вероятность зависит только от текущего значения СТР, но эпигенетика говорит что экспрессия генов зависит от предыдущего поколения, то есть вероятность мутации СТР может зависеть от того когда произошла предыдущая мутация. Неизвестен механизм мутации СТР, его причины, как на него влияют пред. мутации, то есть мутация СТР имеет эпигенетическую или генетическую природу.
6. И наконец, все эти цепи маркова имеют большую вычислительную неустойчивость, посчитать все это чрезвычайно сложно, и практической пользы может не быть никакой.