АвторТема: BGA калькулятор профессора Макдональда  (Прочитано 68901 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #195 : 05 Ноябрь 2012, 15:42:27 »
Действительно,он и сам как то говорил про неточность X хромосом анализы.
Мое замечание, South Asia часто путаеться с West Asia(Caucasus) в алгоритмах.Скорее всего это и есть причина. А то я вижу что у британцев часто South Asian всплывает в X хромосоме. Многие из них тоже отрицают цыганские корни.
Вот именно, что West Asia, потому как часть населения Индии, имеющие т.н. ариийские корни и есть потомки выходцев из Западной Азии - Иран и т.д. Т.е. цыгане тут не причём и калькулятор так откровенно врать не может. Родовые и культурные связи Ирана и Индии уже давно известны.
У британцев да, а вот у чувашей, удмуртов, казахов некоторые количества South Asian / Indian типичны. Примеры (среднее по выборке):
Eurogenes JTest Udmurd South Asian 2,16, Kazakh South Asian 4,59
MDLP World-22 Chuvash Proto-Indo-Iranian 1,3 + Indian 0,6, Kazakh 2,1+1,1

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 5838
  • Страна: ru
  • Рейтинг +408/-17
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3127
  • мтДНК: V16
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #196 : 05 Ноябрь 2012, 17:07:59 »

У британцев да, а вот у чувашей, удмуртов, казахов некоторые количества South Asian / Indian типичны. Примеры (среднее по выборке):
Eurogenes JTest Udmurd South Asian 2,16, Kazakh South Asian 4,59
MDLP World-22 Chuvash Proto-Indo-Iranian 1,3 + Indian 0,6, Kazakh 2,1+1,1
Ну о чём же речь? Вот вам пожалуйста - Западная Азия и британцы тут не причём.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #197 : 05 Ноябрь 2012, 19:41:28 »
У британцев да, а вот у чувашей, удмуртов, казахов некоторые количества South Asian / Indian типичны. Примеры (среднее по выборке):
Eurogenes JTest Udmurd South Asian 2,16, Kazakh South Asian 4,59
MDLP World-22 Chuvash Proto-Indo-Iranian 1,3 + Indian 0,6, Kazakh 2,1+1,1
Дело в том, что на данный момент известно очень мало геномов чувашей.
Один из которых (возможно) геном уважаемого Wertner.
Я очень удивлён тем, что у уважаемого Wertner. южноазиатский кластер столь широко представлен (хотя и доверяю анализу наших генетических гуру).
По внешнему виду, я думаю, я выгляжу, по крайней мере, не меньшим южноазиатом, чем уважаемый Wertner. Хотя по геному - типичный северный славянин.

Для меня это - полная загадка.
Поэтому, связь жителей Поволжья с Южной Азией, я считаю, нуждается в очень подробном исследовании, а не в моих домыслах.

Необходимо привлекать больше чувашей и, наверное, удмуртов к генетическим обследованиям.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #198 : 02 Январь 2013, 12:22:36 »
Для меня это - полная загадка.
Поэтому, связь жителей Поволжья с Южной Азией, я считаю, нуждается в очень подробном исследовании, а не в моих домыслах.
Вот исследование DNA Tribes, частично затрагивающее эту тему: http://www.dnatribes.com/dnatribes-digest-2013-01-02.pdf (взято из блога Поляко http://eurogenes.blogspot.ru/2012/12/evidence-for-early-migrations-to-europe.html). Обнаружено высокое содержание STR-компонента Indus Valley в популяциях Urals и Finnic. В популяции Celtic обнаружен компонент Balochi. Их теории насчет источника Indus valley в Европе:
Indus Valley genetic components (related to Burusho, Tajik, Afghan, and Pathan populations)
are identified in two parts of Europe: first, in the Urals (19.4%) and Finnic (6.3%) sub-regions of
Northeastern Europe. These Indus Valley genetic links might reflect genetic traces of links between
Central Asia, Western Siberia, and Northeastern Europe dating to the Mesolithic period and Bronze
Age.15 Notably, the Uralic languages (spoken in both the Urals and Finnic sub-regions) retain traces of
direct contacts with Indic languages that are primarily associated with the Indian Subcontinent.16
Second, Indus Valley links are also identified for Romani (18.3%) and the Thracian (9.1%) subregion
(Eastern Balkan Peninsula). These links might reflect a separate Romani migration to Europe,
usually thought to have taken place during the medieval period, when Turkic Ghaznavid and Seljuq
expansions were transforming the cultural landscape of Asia.

(Мой краткий перевод) Связи уральских и финских популяций с долиной Инда могут отражать связь между Центральной Азией, Западной Сибирью и Северо-Восточной Европой в периоды мезолита и бронзового века (15). Уральские языки обнаруживают следы прямых контактов с языками, в первую очередь связанными с индийским субконтинентом (16).

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6777
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #199 : 28 Февраль 2013, 13:21:36 »
Профессор принимает  :).
Насчет Гено 2,0 - не знаю - думаю тоже.
Его адрес на первых страницах.
Шаблона нет.
Но ему нужен ро-файл.
Информация о нации отца и матери.

Оффлайн kbg

  • Сообщений: 752
  • Страна: ua
  • Рейтинг +109/-0
  • Днипро
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #200 : 28 Февраль 2013, 13:24:10 »
... Шаблон для письма есть ?

Dear prof. McDonald,

may I ask you to analyze my DNA test data?
My Mother lines XX come from ...
My father lines XX come from ...

Regards

подпись

Оффлайн kbg

  • Сообщений: 752
  • Страна: ua
  • Рейтинг +109/-0
  • Днипро
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #201 : 28 Февраль 2013, 15:24:49 »
yes, of course

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #202 : 28 Март 2013, 16:04:28 »
Цитировать
Most likely fit is 100% Europe (all Northeast Europe)

The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Finland= 0.468 Poland= 0.532 or
Lithuani= 0.684 Russian= 0.316 or
Finland= 0.398 Lithuani= 0.602 or
Finland= 0.648 Germany= 0.352 or
Finland= 0.437 Belorus= 0.563 or
Lithuani= 0.886 Chuvash= 0.114
Second most likely fit is 96.5% (+- 0.3%) Europe (all Northeast Europe)
and 3.5% (+- 0.3%) E. Asia (various subcontinents)

The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Lithuani= 0.967 Chukchi= 0.033 or
Lithuani= 0.967 Yakut= 0.033 or
Lithuani= 0.966 Buryat= 0.034 or
Lithuani= 0.960 Altai= 0.040 or
Lithuani= 0.964 MongolaC= 0.036

using a new beta test population comparison set
Its clearly some sort of Baltic area, at least roughly. The American
on the chromosomes is weak and not real: this means it and the E. Asian are likely
Siberian.

A custom fit gives excellent fits:

Poland 0.7311 Lithuania 0.1625 Finland 0.0661 Selkup 0.0403 or
Poland 0.7326 Lithuania 0.1670 Finland 0.0616 Ket 0.0388 or
Russian 0.0807 Poland 0.8391 Finland 0.0485 Selkup 0.0317 or
Poland 0.8906 Chuvash 0.0069 Finland 0.0653 Selkup 0.0372 or
Russian 0.0762 Poland 0.8469 Finland 0.0462 Ket 0.0307 or
Poland 0.8971 Chuvash 0.0052 Finland 0.0615 Ket 0.0362 or
Russian 0.1780 Poland 0.6660 Lithuania 0.1304 Selkup 0.0256 or
Russian 0.1690 Poland 0.6709 Lithuania 0.1348 Ket 0.0253

Doug McDonald




Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2050
  • Страна: 00
  • Рейтинг +542/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #203 : 28 Март 2013, 18:47:30 »
Моё:
Цитировать
Most likely fit is 100% Europe (all Northeast Europe)
 
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Belorus= 0.709  Russian= 0.291 or
Finland= 0.300  Belorus= 0.700 or
Belorus= 0.906  Chuvash= 0.094
 
See the green spot on the geographic map: this
looks Polish, Baltic, or Belorus.
 
Doug McDonald



Оффлайн obs_il

  • Сообщений: 35
  • Страна: be
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: R1a1a
  • мтДНК: H1a3
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #204 : 28 Март 2013, 19:40:41 »
Выкладывал уже в собственной теме, но на всякий случай выложу и сюда.

McDonald:

"Most likely fit is 22.1% (+- 11.9%) Europe (various subcontinents)
and 77.9% (+- 11.9%) Europe (all Northeast Europe)
which is 100% total Europe
 
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
   Irish= 0.337  Russian= 0.663 or
Hungary= 0.245  Finland= 0.755 or
Tuscan= 0.111  Finland= 0.889 or
English= 0.250  Russian= 0.750 or
Romania= 0.161  Finland= 0.839 or
French= 0.161  Finland= 0.839 or
Italian= 0.116  Finland= 0.884 or
English= 0.202  Finland= 0.798 or
Finland= 0.511  Belorus= 0.489 or
Spain= 0.113  Finland= 0.887
 
Look at the (green) spot on the geographic map. Its well
within range of what you expect. “Russian” above means
from the town of Volgoda."





Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2050
  • Страна: 00
  • Рейтинг +542/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #205 : 28 Март 2013, 19:58:06 »
По новому beta test population comparison set:
Цитировать
only difference:
 
Most likely fit is 100% Europe (all Northeast Europe)
 
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
  Poland= 0.617  Russian= 0.383 or
Chuvash= 0.134   Poland= 0.866 or
Finland= 0.359   Poland= 0.641

Т.е. вместо более специфичной Белоруссии появилась Польша, попутно отдав проценты другим компонентам. Но на общую картину это, видимо, никак не повлияло.
« Последнее редактирование: 28 Март 2013, 20:06:43 от FenriR »

Оффлайн galychanyn

  • Сообщений: 276
  • Страна: ua
  • Рейтинг +31/-0
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a1a (L260+, YP256+, YP254-)
  • мтДНК: H3g
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #206 : 29 Март 2013, 21:35:52 »
У меня все однозначно:
Цитировать
Most likely fit is 100% Hungary (Southeast Europe)
which is 100% total Europe
The location error = 0.005958 with 1 group
 
The following are possible populations,
most likely at the top:
 
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Hungary= 1.000
 
and it actually does look like that is it.
 
Doug McDonald




Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1179
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #207 : 23 Апрель 2013, 09:59:28 »
Цитировать
Note: I am now able to do files from the Genographic 2.0 project. These use only about 57800 SNPs and because of this are noisier and much less reliable than results from other files.
Doug McDonald
I am a former professor at the University of Illinois at Urbana-Champaign. This work is neither supported nor endorsed by the University.

Оффлайн TuLiss

  • Сообщений: 5
  • Рейтинг +0/-0
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #208 : 06 Май 2013, 17:03:23 »
Most likely fit is 83.4% (+- 25.8%) Europe (all Northeast Europe)
and 16.6% (+- 25.8%) Europe (various subcontinents)
which is 100% total Europe
 
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
   Finland= 0.381     Poland= 0.619 or
   Finland= 0.411      Irish= 0.589 or
    Poland= 0.666    Russian= 0.334 or
   Finland= 0.543    Germany= 0.457 or
   Finland= 0.325    Belorus= 0.675 or
   Finland= 0.578    English= 0.422 or
   Russian= 0.355      Irish= 0.645 or
   Belorus= 0.726    Russian= 0.274 or
   Chuvash= 0.111     Poland= 0.889 or
Lithuania= 0.618    Russian= 0.382
but a custom fit, usually more accurate, gives
 
     Belorus 0.6985      Finland 0.3015  or
     Belorus 0.9798    Nganassan 0.0202  or
     Russian 0.2485      Belorus 0.7515  or
     Belorus 0.9741        Altai 0.0259  or
     Belorus 0.9774         Tuva 0.0226  or
     Belorus 0.9731          Ket 0.0269  or
   Lithuania 0.9569        Altai 0.0431  or
     Belorus 0.9765  Mongola_Chinese 0.0235
 
which explains the Asian and (not real, actulaay Siberian) American spots on the chromosomes.
 
This fits what you expect.
 
Doug McDonald


Я новичок, кто то может помочь более детально все усвоить ? 

P.S. Не смог все прикрепить все файлы, пишет что файл upload переполнен. выложил все в dropbox.

https://dl.dropboxusercontent.com/u/315715/BGA2.jpg
https://dl.dropboxusercontent.com/u/315715/2BGA1.jpg
https://dl.dropboxusercontent.com/u/315715/52BGA3.jpg

Оффлайн Yurij

  • Сообщений: 82
  • Страна: ru
  • Рейтинг +44/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP1079
  • мтДНК: H
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #209 : 08 Июнь 2013, 22:20:04 »
Мои результаты:

Most likely fit is 86.4% (+-  4.7%) Europe (all Northeast Europe)
and 13.6% (+-  4.7%) Mideast (various subcontinents)
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Lithuania= 0.806    Adygei= 0.194 or
Lithuania= 0.829    Turkish= 0.171 or
Belorus= 0.917    Adygei= 0.083 or
Poland= 0.905    Adygei= 0.095
a custom fit gives
Russian 0.2898    Lithuania 0.5835    Georgian 0.1268 or
Chuvash 0.0844    Lithuania 0.7816    Georgian 0.1340 or
Russian 0.2201    Lithuania 0.6305      Adygei 0.1494 or
Chuvash 0.0625    Lithuania 0.7815      Adygei 0.1561
which of course is very very similar.
And it is close enough to what you expect.
Small Asian on the chromosomes is normal in Russians.





 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.