АвторТема: BGA калькулятор профессора Макдональда  (Прочитано 48913 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1137
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-4
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #210 : 23 Апрель 2013, 09:59:28 »
Цитировать
Note: I am now able to do files from the Genographic 2.0 project. These use only about 57800 SNPs and because of this are noisier and much less reliable than results from other files.
Doug McDonald
I am a former professor at the University of Illinois at Urbana-Champaign. This work is neither supported nor endorsed by the University.

Оффлайн TuLiss

  • Сообщений: 5
  • Рейтинг +0/-0
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #211 : 06 Май 2013, 17:03:23 »
Most likely fit is 83.4% (+- 25.8%) Europe (all Northeast Europe)
and 16.6% (+- 25.8%) Europe (various subcontinents)
which is 100% total Europe
 
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
   Finland= 0.381     Poland= 0.619 or
   Finland= 0.411      Irish= 0.589 or
    Poland= 0.666    Russian= 0.334 or
   Finland= 0.543    Germany= 0.457 or
   Finland= 0.325    Belorus= 0.675 or
   Finland= 0.578    English= 0.422 or
   Russian= 0.355      Irish= 0.645 or
   Belorus= 0.726    Russian= 0.274 or
   Chuvash= 0.111     Poland= 0.889 or
Lithuania= 0.618    Russian= 0.382
but a custom fit, usually more accurate, gives
 
     Belorus 0.6985      Finland 0.3015  or
     Belorus 0.9798    Nganassan 0.0202  or
     Russian 0.2485      Belorus 0.7515  or
     Belorus 0.9741        Altai 0.0259  or
     Belorus 0.9774         Tuva 0.0226  or
     Belorus 0.9731          Ket 0.0269  or
   Lithuania 0.9569        Altai 0.0431  or
     Belorus 0.9765  Mongola_Chinese 0.0235
 
which explains the Asian and (not real, actulaay Siberian) American spots on the chromosomes.
 
This fits what you expect.
 
Doug McDonald


Я новичок, кто то может помочь более детально все усвоить ? 

P.S. Не смог все прикрепить все файлы, пишет что файл upload переполнен. выложил все в dropbox.

https://dl.dropboxusercontent.com/u/315715/BGA2.jpg
https://dl.dropboxusercontent.com/u/315715/2BGA1.jpg
https://dl.dropboxusercontent.com/u/315715/52BGA3.jpg

Оффлайн Yurij

  • Сообщений: 74
  • Страна: ru
  • Рейтинг +35/-0
  • Y-ДНК: YP578+, R-CTS3402+, YP237+
  • мтДНК: H
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #212 : 08 Июнь 2013, 22:20:04 »
Мои результаты:

Most likely fit is 86.4% (+-  4.7%) Europe (all Northeast Europe)
and 13.6% (+-  4.7%) Mideast (various subcontinents)
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Lithuania= 0.806    Adygei= 0.194 or
Lithuania= 0.829    Turkish= 0.171 or
Belorus= 0.917    Adygei= 0.083 or
Poland= 0.905    Adygei= 0.095
a custom fit gives
Russian 0.2898    Lithuania 0.5835    Georgian 0.1268 or
Chuvash 0.0844    Lithuania 0.7816    Georgian 0.1340 or
Russian 0.2201    Lithuania 0.6305      Adygei 0.1494 or
Chuvash 0.0625    Lithuania 0.7815      Adygei 0.1561
which of course is very very similar.
And it is close enough to what you expect.
Small Asian on the chromosomes is normal in Russians.





Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 388
  • Страна: us
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #213 : 09 Июнь 2013, 00:53:57 »
Rezul'tati moei mami (korni iz Central'noj Ukraini):

The automated computer results are as follows.
Please read the attached .rtf file for an explanation of how to
interpret all the data and plots. Both can be misleading without interpretation.

Most likely fit is 81.3% (+- 29.1%) Europe (all Northeast Europe) and 18.7% (+- 29.1%) Europe (various subcontinents) which is 100% total Europe
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
    Poland= 0.713    Russian= 0.287 or
   Chuvash= 0.102     Poland= 0.898 or
   Russian= 0.300      Irish= 0.700 or
   Finland= 0.321      Irish= 0.679 or
  Belorus= 0.784    Russian= 0.216 or
   Finland= 0.508    English= 0.492 or
   Finland= 0.473    Germany= 0.527 or
   Finland= 0.293     Poland= 0.707 or
   Finland= 0.220    Belorus= 0.780 or
   Belorus= 0.930    Chuvash= 0.070

Second most likely fit is 97.5% (+-  0.5%) Europe (all Northeast Europe) and  2.5% (+-  0.5%) E. Asia (various subcontinents)
The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
    Poland= 0.973      Yakut= 0.027 or
    Poland= 0.972     Buryat= 0.028 or
    Poland= 0.967      Altai= 0.033 or
    Poland= 0.970 Mongola_Ch= 0.030 or
    Poland= 0.977    Chukchi= 0.023 or
   Belorus= 0.983      Yakut= 0.017 or
    Poland= 0.977  Mongolian= 0.023 or
    Poland= 0.979   Japanese= 0.021 or
    Poland= 0.977         Tu= 0.023 or
   Belorus= 0.979      Altai= 0.021

a custom fit to three populations gives:
       Irish 0.1596      Belorus 0.8177        Altai 0.0227  or
      Basque 0.0185       Poland 0.9467        Altai 0.0348  or
      Poland 0.9442      Finland 0.0239        Altai 0.0320  or
     Germany 0.0308       Poland 0.9347        Altai 0.0346  or
      Poland 0.9521        Spain 0.0135        Altai 0.0344  or
      Poland 0.9337      Hungary 0.0325        Altai 0.0338  or
       Irish 0.0169       Poland 0.9491        Altai 0.0340

which is saying Polish ... but with a clear Siberian influence.  This is perfectly compatible with what you expect, as the typical error is about 500 miles.

Doug McDonald

(chto-to foto ne vstavlyayutsya, govoritsya chto papka upload perepolnena. Chto luchshe delat? Kak vstavit'? )

[/img]
« Последнее редактирование: 21 Июнь 2013, 09:02:39 от Jonik »

Оффлайн grimsvotn

  • МЖМ Y-DNA: I1-L1248+ Y20842+ (South Scandinavia, Germanic tribes AD) RU-SE
  • Сообщений: 5344
  • Страна: england
  • Рейтинг +1162/-1
  • Neolithic Era
    • I1-L1248 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-FGC11555 (Eastern, BRY-TAM, RU), Prague-Korchak Culture / Western Ukraine (?)
  • мтДНК: T1a-T152C! RU-UA-IRL (Anatolian neolithic farmers)
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #214 : 09 Июнь 2013, 00:59:25 »
Ничего себе - какой обширный сегмент на Х хромосоме от Ближнего Востока, однако.
Лучше спросить у МакДональда - вероятно это неточность в алгоритме.
« Последнее редактирование: 09 Июнь 2013, 01:09:21 от grimsvotn »

Оффлайн eugene-march

  • Сообщений: 284
  • Рейтинг +41/-2
  • Y-ДНК: R1a1a
  • мтДНК: К1b2a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #215 : 25 Июнь 2013, 14:23:21 »
Мои данные (McDonald):

Most likely fit is 60.6% (+- 21.5%) Europe (various subcontinents)
and 39.4% (+- 21.5%) Europe (all Northeast Europe)
which is 100% total Europe

The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Irish= 0.718 Russian= 0.282 or
English= 0.534 Finland= 0.466 or
Germany= 0.579 Russian= 0.421 or
Poland= 0.722 Russian= 0.278 or
Finland= 0.432 Germany= 0.568 or
Irish= 0.725 Finland= 0.275 or
English= 0.548 Russian= 0.452 or
Chuvash= 0.099 Poland= 0.901 or
Irish= 0.907 Chuvash= 0.093 or
Belorus= 0.795 Russian= 0.205
Second most likely fit is 97.5% (+- 0.4%) Europe (various subcontinents)
and 2.5% (+- 0.4%) E. Asia (various subcontinents)

The following are possible population sets and their fractions,
most likely at the top
Poland= 0.974 Chukchi= 0.026 or
Poland= 0.974 Yakut= 0.026 or
Irish= 0.979 Chukchi= 0.021 or
Poland= 0.969 Altai= 0.031 or
Poland= 0.974 Buryat= 0.026 or
Irish= 0.978 Yakut= 0.022 or
Poland= 0.972 Mongola_Ch= 0.028 or
Belorus= 0.983 Chukchi= 0.017 or
Irish= 0.973 Altai= 0.027

a custom fit gives

Poland 0.6862 Chuvash 0.1083 Belorus 0.2056 or
Poland 0.7785 Chuvash 0.1139 Lithuania 0.1076 or
Chuvash 0.1181 Lithuania 0.7592 Sephardic 0.1227 or
Poland 0.8845 Chuvash 0.1112 Jewish 0.0043 or
Poland 0.8856 Chuvash 0.1114 Sephardic 0.0030 or
Chuvash 0.1149 Hungary 0.2929 Lithuania 0.5922 or
Romania 0.2173 Chuvash 0.1134 Lithuania 0.6693

which are agreeing: Poland or Belorus.










Оффлайн grimsvotn

  • МЖМ Y-DNA: I1-L1248+ Y20842+ (South Scandinavia, Germanic tribes AD) RU-SE
  • Сообщений: 5344
  • Страна: england
  • Рейтинг +1162/-1
  • Neolithic Era
    • I1-L1248 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-FGC11555 (Eastern, BRY-TAM, RU), Prague-Korchak Culture / Western Ukraine (?)
  • мтДНК: T1a-T152C! RU-UA-IRL (Anatolian neolithic farmers)
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #216 : 25 Июнь 2013, 17:31:28 »
Характерное для западного русского расположение :)

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5514
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2298/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #217 : 25 Июнь 2013, 17:59:39 »
Пора бы ему переименовать Russian в North Russian, сколько можно уже  :'(

Оффлайн eugene-march

  • Сообщений: 284
  • Рейтинг +41/-2
  • Y-ДНК: R1a1a
  • мтДНК: К1b2a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #218 : 25 Июнь 2013, 18:39:59 »
Пора бы ему переименовать Russian в North Russian, сколько можно уже  :'(
Да, непонятно- почему локализация в Польше? Должно быть на 700 км восточнее))

А так данные от Макдональда вполне типичны для  русского?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5514
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2298/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #219 : 25 Июнь 2013, 19:25:39 »
Да, непонятно- почему локализация в Польше? Должно быть на 700 км восточнее))

А так данные от Макдональда вполне типичны для  русского?
Да, вполне. Поляки и беларусы здесь ближе к большинству русских, чем используемые МакДональдом каргопольские/вологодские образцы Russian HGDP. Хотя, конечно, эти люди тоже представляют заметную часть русского народа, так что он не совсем уж неправ  :)

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 1958
  • Страна: 00
  • Рейтинг +503/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #220 : 25 Июнь 2013, 20:53:00 »
МакДональд многих русских "селит" к беларусам.
ЗЫ в каком случае он дает несколько плотов, когда есть несколько равноценных локализаций/использует различное разрешение? потому, что у меня плот был только один.

Оффлайн eugene-march

  • Сообщений: 284
  • Рейтинг +41/-2
  • Y-ДНК: R1a1a
  • мтДНК: К1b2a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #221 : 25 Июнь 2013, 21:13:07 »
А вот, что пишет Макдональд о геноме жены:

This is a very very tough case, one of the hardest I have seen.
I'm sending a custom fit:

        Poland 0.8108      Cypriot 0.1623    Nganassan 0.0269 or
      Poland 0.8125      Cypriot 0.1583        Yakut 0.0292 or
      Poland 0.8110      Cypriot 0.1553  Mongola_Chi 0.0338 or
      Poland 0.8256     Armenian 0.1505    Nganassan 0.0239 or
      Poland 0.8071      Cypriot 0.1566        Altai 0.0363 or
      Poland 0.8077      Turkish 0.1796    Nganassan 0.0127 or
      Poland 0.8160      Cypriot 0.1552    Mongolian 0.0287 or
      Poland 0.8266     Armenian 0.1474        Yakut 0.0261 or
      Poland 0.8077      Cypriot 0.1425       Hazara 0.0497 or
      Poland 0.8056      Cypriot 0.1431        Uygur 0.0512 or
      Poland 0.8171      Cypriot 0.1548    North_Han 0.0281 or
      Poland 0.8083      Turkish 0.1781        Yakut 0.0137 or
   Lithuania 0.7269      Cypriot 0.2439    Mongolian 0.0293 or
   Lithuania 0.7276      Cypriot 0.2437    North_Han 0.0286 or
   Lithuania 0.7242      Cypriot 0.2464        Yakut 0.0294 or
   Lithuania 0.7230      Cypriot 0.2501    Nganassan 0.0269 or
   Lithuania 0.7238      Cypriot 0.2423  Mongola_Chi 0.0339 or
   Lithuania 0.7215      Cypriot 0.2424        Altai 0.0361 or
   Lithuania 0.7119      Cypriot 0.2513          Ket 0.0367

I think its Eastern European plus some Siberian and ??? Mideastern???

I tried looking at the scatter plots but I simply can'y figure them out .... It
really does in this case absolutely require a computer! I'm not sending any
but the rotating one ... they are that confusing!






Оффлайн grimsvotn

  • МЖМ Y-DNA: I1-L1248+ Y20842+ (South Scandinavia, Germanic tribes AD) RU-SE
  • Сообщений: 5344
  • Страна: england
  • Рейтинг +1162/-1
  • Neolithic Era
    • I1-L1248 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-FGC11555 (Eastern, BRY-TAM, RU), Prague-Korchak Culture / Western Ukraine (?)
  • мтДНК: T1a-T152C! RU-UA-IRL (Anatolian neolithic farmers)
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #222 : 25 Июнь 2013, 21:27:09 »
Ого!
Балканские корни у Вашей жены есть?

Оффлайн grimsvotn

  • МЖМ Y-DNA: I1-L1248+ Y20842+ (South Scandinavia, Germanic tribes AD) RU-SE
  • Сообщений: 5344
  • Страна: england
  • Рейтинг +1162/-1
  • Neolithic Era
    • I1-L1248 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-FGC11555 (Eastern, BRY-TAM, RU), Prague-Korchak Culture / Western Ukraine (?)
  • мтДНК: T1a-T152C! RU-UA-IRL (Anatolian neolithic farmers)
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #223 : 25 Июнь 2013, 21:30:11 »
В принципе калькулятор К36 это показывает:

10.35% East_Balkan
7.02% Central_Euro
6.44% Italian
5.13% Iberian

Весьма значительный процент.

Оффлайн eugene-march

  • Сообщений: 284
  • Рейтинг +41/-2
  • Y-ДНК: R1a1a
  • мтДНК: К1b2a
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #224 : 25 Июнь 2013, 21:59:39 »
Ого!
Балканские корни у Вашей жены есть?
Ответил в ЛС. Происхождение, действительно, полиэтничное.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100