АвторТема: BGA калькулятор профессора Макдональда  (Прочитано 45586 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн napobo3Автор темы

  • Сообщений: 1347
  • Страна: il
  • Рейтинг +332/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
BGA (BioGeographical Ancestry) калькулятор на данный момент является одним из самых точных этно-популяционных обработчиков SNP данных.
Принимает данные от 23andme, Decodeme, PGP.
Выдает текстовый файл с комментариями профессора и диаграммы (примеры).
Недоступен для публики, единственный способ получить результаты - послать письмо профессору с просьбой.
Результаты собираются здесь:
http://spreadsheets.google.com/ccc?key=rraoyYa5YAZVfiDAcyF6QsQ
« Последнее редактирование: 06 Июль 2009, 08:38:41 от napobo3 »

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31580
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2374/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #1 : 06 Июль 2009, 19:10:53 »
Вот это новость, так новость!
Спасибо огромное, дорогой парово3.
Хорошо бы если протестированные поделились своими выкладками в этой теме.

Оффлайн Trish

  • Сообщений: 60
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: 1:R1a1a*, 2:R1a1, 4:G2a, 6:G2a
  • мтДНК: Н - и у мамы и у папы
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #2 : 13 Август 2009, 23:55:15 »
Очень интересно!
Но, к сожалению, не владею настолько и языком и темой, чтобы написать профессору. Буду признательна за посредничество! :)

Оффлайн napobo3Автор темы

  • Сообщений: 1347
  • Страна: il
  • Рейтинг +332/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #3 : 20 Август 2009, 14:34:11 »
Просьба всем, кого оттестировал профессор, добавить результаты в эту таблицу.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31580
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2374/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #4 : 20 Август 2009, 18:54:00 »
Просьба всем, кого оттестировал профессор, добавить результаты в эту таблицу.
Добавил.

Оффлайн napobo3Автор темы

  • Сообщений: 1347
  • Страна: il
  • Рейтинг +332/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #6 : 20 Август 2009, 19:00:05 »
Михаил, простите за любопытство зачем Вы включили "Finno-Ugrian"? Это документировано?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31580
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2374/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #7 : 20 Август 2009, 19:10:39 »
Михаил, простите за любопытство зачем Вы включили "Finno-Ugrian"? Это документировано?
Судите сами. На мою ремарку моей маме о том, что наш митосубклад присущ "мордве" и о преобладании финно-угорских мотивов в анализе по STR аутосомам у моей сестры, она сказала: "Ничего удивительного, бабку Агафью (моя прабабушка по материнской линии) в селе за глаза звали мордвой".
Поэтому не вдаваясь в детали (эрзя, мокша), просто обозначил присутствие угро-финской компоненты.
 :)

Оффлайн napobo3Автор темы

  • Сообщений: 1347
  • Страна: il
  • Рейтинг +332/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #8 : 21 Август 2009, 08:47:07 »
Очень интересно!
Но, к сожалению, не владею настолько и языком и темой, чтобы написать профессору. Буду признательна за посредничество! :)
Послал Вам письмо для профессора.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #9 : 21 Август 2009, 11:00:58 »
ОК. Простите что заподозрил Вас в наивности - типа раз Рязань :)

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19291
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1354/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #10 : 21 Август 2009, 11:10:19 »
А в чем наивность, если топонимика и данные днк говорят об одном и том же.)))

Оффлайн Trish

  • Сообщений: 60
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: 1:R1a1a*, 2:R1a1, 4:G2a, 6:G2a
  • мтДНК: Н - и у мамы и у папы
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #11 : 21 Август 2009, 16:11:36 »
Очень интересно!
Но, к сожалению, не владею настолько и языком и темой, чтобы написать профессору. Буду признательна за посредничество! :)
Послал Вам письмо для профессора.

Премного Вам благодарна!!!

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31580
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2374/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Финны
« Ответ #12 : 21 Август 2009, 18:44:35 »
Кстати, по финнам интересно - у меня с ними порядок распределения величин в первой табличке (которая по сути является самой точной) совпадает.

Оффлайн Trish

  • Сообщений: 60
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: 1:R1a1a*, 2:R1a1, 4:G2a, 6:G2a
  • мтДНК: Н - и у мамы и у папы
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #13 : 23 Август 2009, 00:11:14 »
Уже получила ответ от профессора!

"I'm happy to send you the
results. I add that I do not share the files with anyone else
other than who sends it to me.

We do two tests. One is exactly the same as 23andme's
"Advanced Global Similarity" except we do more dimensions. You
fit in both Europe and and World views right of the edge of
Russia (which is a comparison group) in the direction of the
heart of Europe. Perhaps this means you are from far western Russia.

We also do quantitative tests, with and without the Mideast and
Pakistan as comparison. Here are the results. Note that the random error
is 1 to 2%.

The things below are the three different runs.

Europe    93.4%
Oceania    0.6%
America    2.6%
Africa     0.8%
E. Asia    2.7%


Europe    85.7%
S. Asia   11.2%
Oceania    0.1%
America    2.2%
Africa     0.3%
E. Asia    0.8%

Europe    83.3%
Mideast    3.4%
S. Asia   10.5%
Oceania    0.0%
America    2.2%
Africa     0.0%
E. Asia    0.8%

These are typical for Russians. They are different from western
Europeans who test, on the middle one, 8% S. Asian, just because
of ancient mixing between those regions (e.g. Alexander teh great's army,
plus through Persia. On the bottom one western Europeans test 4.4% Midest
and 9% S. Asian. The small apparently American part is also typical,
and is even more pronounced in Finns. We have no good explanation for it."

Оффлайн napobo3Автор темы

  • Сообщений: 1347
  • Страна: il
  • Рейтинг +332/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: BGA калькулятор профессора Макдональда
« Ответ #14 : 13 Октябрь 2009, 18:20:32 »
Еще одна группа разработчиков занялась использованием Рrincipal Сomponents Аnalysis для анализа данных 23андме.
Просят присылать данные для отладки.

From: Raphael PETIT [mailto:raphaelpetit@wanadoo.fr]
Sent: Friday, October 09, 2009 9:50 AM
Subject: Fw: Structure program using 23andme data

> Hi,
>
> I think you could be interested by the following analysis we are doing
> with some members of DnaFroums that have tested with 23andme. We run our
> 23andme data through the STRUCTURE program that allow us to know the
> different component of our ancestry. This is based on 3516 SNP that are
> especially selected for European and Middle-Eastern ancestry.
>
> http://dna-forums.org/index.php?showtopic=8204&st=320
>
> So if you want to participate it would be great

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100