АвторТема: Общая информация о субкладе I2a1 (М26)  (Прочитано 7928 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Кен Нордведт сообщает о трех новых SNP-мутациях (по номенклатуре FTDNA L158, L159, L160), которые ассоциируются с гаплогруппой
I2a1 M26+. Эта ветвь  отделилась от основного древа I2а примерно 20000 лет назад.

Цитировать
From: "Ken Nordtvedt" <knordtvedt@bresnan.net>
Subject: [yDNAhgI] 3 New I2a1 SNPs
Date: Mon, 15 Jun 2009 07:51:00 -0600

The I2a1 M26+ "Sardinian" haplogroup just got three SNPs from a walk the y search over 118,000 nucelotide sites.

FTDNA has named them L158, L159, L160

I urge members of this clade --- I2a1 --- to test for these snps at FTDNA advanced lab. Price should be the normal snp price in their catalog, I believe.

That will enable us to find out for each of these snps whether they are: A) phylogenetically equivalent to M26, B) robustly divide I2a1 into sub-haplogroups, or C) are private-like and derived only for a recent family group? The odder your I2a1 haplotype the better. I2a1 haplotypes are the ones which normally have that strangely low 11 at YCAIIa and most often the 12-12 at DYS385.

I2a1 is an old clade and broken up into a good number of mini-clades based on STR haplotype motifs. But it has no strong clade divisions based on STRs. It's geography ranges from its stronghold in the western Mediterranean, up through France, and into northwest Europe and British Isles. It is quite rare in Scandinavia. Since the person's dna of the discovery of these three snps was from northern Europe background, Iberian, Italian, or French members of this clade are especially urged to test for these snps.
One of the goals of more snps for I2a1 M26+ is to figure out when and how often I2a1 folks moved north along the Atlantic seaboard from the western Mediterranean after the LGM.

I2a1 branch line left the rest of the y tree 20,000 years ago. So it was a favorable place to search for new snps (chances of success are proportional to branch length of tree being searched over). At the other extreme, some searches are going on in haplogroup I1. This haplogroup's MRCA is only abourt 4000 years old. So expectations in those I1 searches should be restrained by comparison
.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Три новых SNP
« Ответ #1 : 15 Июнь 2009, 23:00:21 »
Это "дублирующие снипы"? Они не разделяют I2a1 на субклады?

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Три новых SNP
« Ответ #2 : 15 Июнь 2009, 23:24:52 »
Это вопрос на миллион долларов. Как пишет Нордведт, неизвестно являются ли эти SNP филогенетическимb аналогами базового SNP M26+, дополнительными SNP, которые разделяют этот субклад на новые подсубклады, или же это - "семейные" или "приватные" SNP,имеющие сугубо генеалогическую ценность. Вот поэтому он и бросил клич ко всем I2a1 (а если такие в России? :)) срочно тестироваться на SNP.

PS. Меня порой поражает энтузиазм КН  :)

Это "дублирующие снипы"? Они не разделяют I2a1 на субклады?

Оффлайн Pererva

  • Сообщений: 30
  • Рейтинг +20/-0
  • Y-ДНК: I2a2* ( M423+ P41.2- ) I-M423
  • мтДНК: H11
Три новых SNP
« Ответ #3 : 16 Июнь 2009, 13:07:13 »
Получил письмо и ничего не понял, кто нибудь может прокоментировать второе предложение.

Greetings,
It's time for an update of the I2a SNP searches.
 
Wil Husted and John O'Grady's WTY SNP searches are completed and there
are four new SNP's discovered. Three from Wil's WTY and one from John's.
Wil is I2a1-M26-A and John is I2a2-M423-Isles-D2.
Ken emailed me that O'Grady's SNP is ancestral for Husted & Husted's
three are ancestral for O'Grady so that places all four downstream of
the I2a1 split from I2a2.

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Три новых SNP
« Ответ #4 : 18 Июнь 2009, 01:50:16 »
офф
Цитировать
L158, L159, L160
лихо ребята развернулись. 160 снипов за полгода, по-моему.

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Три новых SNP
« Ответ #5 : 18 Июнь 2009, 01:53:02 »
Ув. вертнер,

Откуда такие сведения?

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Общая информация о субкладе I2a1 (М26)
« Ответ #6 : 29 Июнь 2009, 02:58:03 »
Обсуждение

Делеция DYS425=0 клада I2a-M26-France
« Последнее редактирование: 03 Октябрь 2009, 20:18:23 от Vadim Verenich »

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Гаплогруппа I2a1
« Ответ #7 : 16 Сентябрь 2009, 20:48:56 »
Барахоевы I2a1
 http://genofond.ru/default3.aspx?s=0&p=677

Я так понимаю это именно эти ингуши http://www.molgen.org/index.php?name=News&file=article&sid=144
« Последнее редактирование: 17 Сентябрь 2009, 07:56:17 от Аббат Бузони »

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: Гаплогруппа I2a1
« Ответ #8 : 17 Сентябрь 2009, 14:07:20 »
В однофамильцах есть еще один I2a1 Фурсов. Вот этот может быть потомком француза из армии Наполеона.

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Три новых SNP
« Ответ #9 : 17 Сентябрь 2009, 22:45:17 »
Кен Нордведт (он же(?) reality на dna-forums.org) поделился своим разочарованием по поводу результатов проекта WTY гаплогруппников I. Из десятка новых обнаруженных SNP-ов, только один - L160 -оказался полезным в филогенетическом плане, так как очевидно, что  он маркирует точку рассхождения двух популяционных кладов внутри пресловутой "сардинской" гаплогруппы I2a1 (M26).

Цитировать
Walk the Y has been a monumental flop in haplogroup I.For many thousands of dollars of customer expenditures only a single useful new SNP, L160, has been found to divide clade populations of I2a1 so far. There are some haplogroup I orders for WTY still outstanding, and maybe they will yet change the cost/reward ratio for the better? Only time will tell.

Посетовав на то, что только время покажет , Кен вернулся к своей любимой теме -агитацией заказов FTDNA-вских Kittler тестов для определения точного положения повторов в локусах DYS385. По его мнению, эти более дешевые тесты могут выявить дополнительную важную в филогенетических целях информацию.

Цитировать
So if your DYS385 = 12-12 or 13-13 or 14-14 or 15-15 or 16-16 DO NOT order a Kittler test

But if your DYS385 = 12-13 or 11-12 or.... 14-15 or ...... 16-17, etc., and many other haplotypes of your clade are of the equal repeats form, please consider ordering a Kittler test

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Три новых SNP
« Ответ #10 : 18 Сентябрь 2009, 00:49:54 »
Ув. вертнер,

Откуда такие сведения?
Сделал вывод из номера снипа L160.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Три новых SNP
« Ответ #11 : 18 Сентябрь 2009, 00:52:48 »

Сделал вывод из номера снипа L160.
Да. 160 - это по всем проектам и гаплогруппам. Там половина только в R1b1b2  :)

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Субклад I2a1 +M26 (Сардиния,Пиринеи,Франция)
« Ответ #12 : 03 Октябрь 2009, 20:16:14 »
Общая информация о субкладе I2a1 (М26)

Источник "Y-Haplogroup I2a Project"

Субклад I2a1-M26.

SNP-мутация M26 был обнаружена в 2004 году. В научной литературе субклад возраст I2a1-M26  датируется периодом пост-ледникового перезаселения окраины  западной Европы. (Источник: Возраст сардинского клада M26)
Кен Нордведт выделил в субкладе I2a1-M26 четыре разновидности: A,B,C & France (Франция). Эти разновидности отличаются только значениями DYS маркеров, что и показано ниже.

Комментарии Кена Нордведта: "Родоначальник хромосомной линии I2a1 предположительно имел следущие локусные значения в маркере DYS385a,b : 12-12. Если в Вашем гаплотипе значения маркеров DYS385 и DYS385b отличаются от исходных, то настоятельно рекомендуется заказать недорогой Kittler тест в  лабораториях FTDNA. Две копии DYS385 расположенны на двух разный сайтах y-хромосомы (A и B). Тест Kittler  покажет, в какой именно из копий DYS385 произошла мутация базовых значений 12-12 (что невозможно определить по обычным результатам тестирования DYS385). Эта дополнительная информация, полученная с помощью теста Kittler, поможет точнее проанализировать историю I2a1 с момента появления этой хромосомной линии, а также точнее позиционировать расстояние между двумя отдельными  I2a1 гаплотипами, поскольку будет ясно, действительно ли совпадают значения DYS385 или же они разделенны двухшаговой мутацией. С вопросами по поводу Kittler теста обращаться к Кену Нордведту (knordtvedt@bresnan.net)"

Распространение субклада I2a1-M26 в континентальной Европе (на карте снип-мутаций гаплогруппы I)


Дальнейшая информация о M26 (на английском языке):
Гаплогруппа I и ее субклады (Википедия)
История I2 (эссе Нордведта)
Решение загадки  Y-хромосомной SNP-мутации M26
March 18, 2008: Линия M26+ ответвилась от древа гаплогруппы I до возникновения M423+ мутации
Sept 19, 2008: Является ли "северная" подгруппа субклада M26 более старой?
Oct 13, 2008: Возраст субклада M26
Jan 09, 2009: Статья "Сардиния и M26"
Jan 29, 2009: Kittler тест для I2a1-M26
Mar 10, 2009: Ранняя история популяций I (часть 1)
Mar 10, 2009: Ранняя история популяций I (часть 2)
Feb 28, 2009: "Французский" субклад of M26
April 6, 2009: Wil Husted объявляет об участии в WTY (проект по поиску новых SNP мутаций)  
April 26, 2009: Wil Husted (I2a1-M26) начинает тестирование в проекте "Walk Through the Y" SNP search.
June 12, 2009  Авторы статии в AJHG выдвигают версию, что Италия (наряду с Сардинией) была убежищем для предковой популяции I2a1-M26 во время последнего ледникового периода и что в Сардинии, mtDNA U5b3 и yDNA M26 являются доказательством "эфекта основателя", маркирующем женские и мужские линии. Статья в AJHG
June 12, 2009 По результатам тестирования Wil Hustedа в проекте WTY обнаруженно три новых SNP.
June 15, 2009: 3 новых I2a1 SNP-мутации. Кен Нордтведт призывает всех представителей I2a1 тестироваться на новые SNP.
July 8, 2009: Субклад I2a1-France в Ирландии -свидетельство нормандского/континентального происхождения?

Деривативные (предковые) SNP-мутации субклада I2a1-M26: M170+ M258+ P19+ P38+ P212+ U179+ L68+ P215+ P37.2+
Определяющая субклад  I2a1-M26 SNP-мутация: M26+

Определяющие разновидность субклада I2a1-M26 значения DYS  маркеров, в сравнении с другими I2a субкладами:
DYS# ------M26 разновидности--
...........A...B...C...France(Франция)
(3)19....17 16 16 17
(4)391...10 10 10-11 09
(6)385b..12 12 13 12
(9)439...11 12 12 14
12)389ii.28 29 28 28
27)H4....11 11 11 11
28)IIa...11 11 11 11
47)511...07 07 07 07
52)594...11 11 11 11
55)534...13 13 13 13
61)617...13 13 13 13
65)640...12 12 12 12

Значения DYS маркеров, используемые для определения разновидности I2a1-M26:
DYS......A..B..C..France (Франция)
(3)19...17 16 16 17
(4)391..10 10 10-11 09
10)389i.13 14 13 14
12)389ii 28 29 28 28
18)447..25 25-7 24 24
20)448 21 21 20 21
36)442..13 12 12 13
« Последнее редактирование: 04 Октябрь 2009, 17:07:40 от Vadim Verenich »

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
I2a1a-M161+ пуэрто-риканский субклад I2a1a
« Ответ #13 : 04 Октябрь 2009, 17:06:54 »
Cубклад I2a1a-M161+

Этот субклад (субгаплогруппа) определяется входящей SNP-мутацией M161+. I2a1a-M161+ является субгаплогруппой  I2a1-M26..

В настоящий момент известен  только один представитель I2a с позитивным тестом на M161+. Самый ранний известный предок  по мужской линии этого человека жил в 1869 году на о.Пуэрто-Рико (куда его предки прибыли из Испании (отсюда название субгаплогруппы -пуэрто-риканская, хотя возможно в будущем название поменяется на "испанская").

Miguel Torres Rodriguez ~1869 Mayaguez, PR    I2a1a   
13   23   17   10   12   12   11   13   11   13 11   28   17   8   9   11   11   25   15   21   29   11   14   14   15   10   11   11   21   14   12   17   18   33   34   12   10   

Информация
March 31, 2008: Первый M161+

Деривативные (предковые) SNP: те же, что и у M26
Определяющая субклад SNP-мутация: M161+

Определяющие субклад DYS маркеры: те же, что и у M26

Значение DYS маркеров субклада M161 (в сравнении с "разновидностями" I21a-M26)
from Modal M26 varieties:
--------------------M26 разновидности---
DYS#..M161....A...B...C....France (Франция)
(3)19....17.....17 16 16 17
(9)439...11.....11 12 12 14
10)389i...13....13 14 13 14
12)389ii..28....28 20 28 28
15)459b..09....10 10 09 10
18)447...25....25 25*27 24 24


Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
дополнительное тестирование Барахоева -I2a1
« Ответ #14 : 04 Октябрь 2009, 17:29:52 »
Принимая во внимание нижесказанное:

Цитировать
сли в Вашем гаплотипе значения маркеров DYS385 и DYS385b отличаются от исходных, то настоятельно рекомендуется заказать недорогой Kittler тест в  лабораториях FTDNA. Две копии DYS385 расположенны на двух разный сайтах y-хромосомы (A и B). Тест Kittler  покажет, в какой именно из копий DYS385 произошла мутация базовых значений 12-12 (что невозможно определить по обычным результатам тестирования DYS385). Эта дополнительная информация, полученная с помощью теста Kittler, поможет точнее проанализировать историю I2a1 с момента появления этой хромосомной линии, а также точнее позиционировать расстояние между двумя отдельными  I2a1 гаплотипами, поскольку будет ясно, действительно ли совпадают значения DYS385 или же они разделенны двухшаговой мутацией.

Цитировать
Кен Нордведт сообщает о трех новых SNP-мутациях (по номенклатуре FTDNA L158, L159, L160), которые ассоциируются с гаплогруппой
I2a1 M26+. Эта ветвь  отделилась от основного древа I2а примерно 20000 лет назад.

Цитировать
Из десятка новых обнаруженных SNP-ов, только один - L160 -оказался полезным в филогенетическом плане, так как очевидно, что  он маркирует точку рассхождения двух популяционных кладов внутри пресловутой "сардинской" гаплогруппы I2a1 (M26)...So if your DYS385 = 12-12 or 13-13 or 14-14 or 15-15 or 16-16 DO NOT order a Kittler test

But if your DYS385 = 12-13 or 11-12 or.... 14-15 or ...... 16-17, etc., and many other haplotypes of your clade are of the equal repeats form, please consider ordering a Kittler test

Я настойчиво рекомендую г-ну Барахоеву (номер SR0027 в сводной таблице Генофонда http://genofond.ru/default3.aspx?s=0&p=677), с предсказанной по STR-предиктору гаплогруппой I2a1-M26 (гаплотип приведен ниже; по значениям маркеров, определяющим разновидность I2a1,он принадлежит либо к B, либо к С)

13 29 25 15 16 [b]12    13[/b] 18 14 10 22 11 10 11 13 10 21
сделать - для точного соотнесения своего гаплотипа в структуре древа I2a1 - минимум три вещи:

1) заказать 67 маркерный тест в FTDNA (он включает в себя все "профильные" для I2a1 маркеры)
2) заказать в FTDNA киттлероский тест, поскольку значения DYS385a и DYS385b у него в гаплотипе не совпадают (12 и 13)
3.заказать там же тест на наличие/отсутствие снип-мутаций L158, L159, L160 (первые два \ наиболее важны, так как L160+ выявлен только у I2a1-M26-A)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.