Вот этот же участок у 117443 Setälä, Finland N1b
AGATTTAGATAATTCTGAAAAGC
Т.е. показана мутация C на A.
А вот тот же участок у 154501 Shikalov, Russia – карельская ветвь N1c1
AGCTTTAGATAATTCTGAAAAGC
Т.е. LLY22g_2 C- - мутации нет.
У других представителей финно-карельской ветви, протестированных по WTY (N25747 Pyykkonen, Finland и 141818 Wayrynen, Finland) эти участки в финче не показываются, поэтому непонятно, что там и больше из этой ветви никто непроверялся.
Из всех тестированных на финче выложены:
183394 (GRC11055225)
LLY22g_1 T+
LLY22g_2 A+
73958 (GRC012523)
LLY22g_2 A+
То есть, эти снипы довольно-таки непостоянные.
Очень странно.
Везде в проектах показано, что Shikalov LLY22g+
А он однозначно LLY22g-
154501 Shikalov, Russia – карельская ветвь N1c1
Предковый вариант
AG
CTTTAGATAATTCTGAAAAGC
Из всех, прошедших WTY, однозначно LLY22g+ только у
117443 Setälä, Finland N1b
AG
ATTTAGATAATTCTGAAAAGC
У боьшинства, в том числе 73958 (GRC012523)
там стоит M, K или вообще WK
Это означает, что какая-то мутация есть, но какая конкретно замена не ясно и совсем не означает, что это точно такая же мутация, как у N1b, где четко виден переход C – A, или G – T.
Но у уважаемого Eugene 183394 (GRC11055225) действительно LLY22g+
AG
ATTTAGATAATTCTGAAAAGC
Там же рядом находится снип L593_2 ChrY:22432111..22432111
У всех там стоит W, а Setälä – A или T
Финч уважаемого Валихана так и не показывает.
Уважаемый Juhani должен запросить ФТДНА, почему этот участок он не может увидеть в своем финче.