АвторТема: С-M407  (Прочитано 42265 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5364
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1823/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: С-M407
« Ответ #120 : 28 Октябрь 2020, 21:47:14 »
Получил свои полногеномные данные от Небулы :)

Поздравляю тебя!
На YFull пошлешь ведь?
« Последнее редактирование: 28 Октябрь 2020, 23:19:47 от Lesla »

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: С-M407
« Ответ #121 : 28 Октябрь 2020, 23:27:45 »
Меня смело можно относить к Бурятской ветви M407, но у меня вероятно другой субклад. B99 и B100 отрицательные.
Поздравляю с окончанием теста!
А остальные под F8465 снипы? SK1028, B97, F8536?

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #122 : 29 Октябрь 2020, 05:13:34 »
Получил свои полногеномные данные от Небулы :)

Поздравляю тебя!
На YFull пошлешь ведь?

Спасибо!)
Да, отправлю. Подскажите мне, надо будет подкраить весь геном, вырезать только Y+mtDNA и загрузить его на YFull? Или можно YFull дать временные пароли для загрузки и они сами закачают? Просто объемы файлов для всего генома просто огромные ведь. А чисто Y хромосомные bam куда легче по весу.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #123 : 29 Октябрь 2020, 05:20:05 »
Меня смело можно относить к Бурятской ветви M407, но у меня вероятно другой субклад. B99 и B100 отрицательные.
Поздравляю с окончанием теста!
А остальные под F8465 снипы? SK1028, B97, F8536?

Спасибо!) Наконец получил результаты.

Можете подсказать расположение SK1028 и F8536 по 38 build? Я проверю их.

А B97 без мутации вышел.
« Последнее редактирование: 04 Сентябрь 2021, 18:14:08 от Saken »

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #124 : 29 Октябрь 2020, 07:21:34 »
Получил свои полногеномные данные от Небулы :)

Начал понемногу разбираться что к чему. Через Genome Browser проверил субкладные адреса по 38 референсу. Так вот, у меня 100% C-Z4328.

Но все остальные субклады ниже от F3850, которые есть на дереве С от 2019, не совпали с моими! ::)

Меня смело можно относить к Бурятской ветви M407, но у меня вероятно другой субклад. B99 и B100 отрицательные.


Параллельный к C-Z4328 снип F20989 тоже положительный.
« Последнее редактирование: 04 Сентябрь 2021, 18:16:41 от Saken »

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5364
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1823/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: С-M407
« Ответ #125 : 29 Октябрь 2020, 08:34:00 »
Получил свои полногеномные данные от Небулы :)

Поздравляю тебя!
На YFull пошлешь ведь?

Спасибо!)
Да, отправлю. Подскажите мне, надо будет подкраить весь геном, вырезать только Y+mtDNA и загрузить его на YFull? Или можно YFull дать временные пароли для загрузки и они сами закачают? Просто объемы файлов для всего генома просто огромные ведь. А чисто Y хромосомные bam куда легче по весу.

А, в от увидл ответ :).  Спасибо! Надо спросить у Владимира Семаргл а в соответствующей теме. Найдёте сами? Я смогу позже ссылку на неё дать. Это тут на в форуме.

http://forum.molgen.org/index.php/topic,5782.msg504423.html#msg504423
« Последнее редактирование: 29 Октябрь 2020, 08:40:46 от varang »

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: С-M407
« Ответ #126 : 29 Октябрь 2020, 10:19:34 »
Можете подсказать расположение SK1028 и F8536 по 38 build? Я проверю их.
SK1028
16609403 G в A

F8536
3070640 C в T

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #127 : 29 Октябрь 2020, 15:17:25 »
Можете подсказать расположение SK1028 и F8536 по 38 build? Я проверю их.
SK1028
16609403 G в A

F8536
3070640 C в T

Проверил оба снипа, они отрицательные на SK1028 и F8536.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: С-M407
« Ответ #128 : 29 Октябрь 2020, 15:24:19 »
Проверил оба снипа, они отрицательные на SK1028 и F8536.
Тогда это что-то новенькое) Поздравляю!

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5364
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1823/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: С-M407
« Ответ #129 : 29 Октябрь 2020, 16:54:21 »
Получил свои полногеномные данные от Небулы :)

Поздравляю тебя!
На YFull пошлешь ведь?

Спасибо!)
Да, отправлю. Подскажите мне, надо будет подкраить весь геном, вырезать только Y+mtDNA и загрузить его на YFull? Или можно YFull дать временные пароли для загрузки и они сами закачают? Просто объемы файлов для всего генома просто огромные ведь. А чисто Y хромосомные bam куда легче по весу.

А, в от увидл ответ :).  Спасибо! Надо спросить у Владимира Семаргл а в соответствующей теме. Найдёте сами? Я смогу позже ссылку на неё дать. Это тут на в форуме.

http://forum.molgen.org/index.php/topic,5782.msg504423.html#msg504423

Saken,

Очень жду увидеть налкнец на YFull. Они же быстро проанализируют. Если попросишь Semargl, он сразу тебе скажет расклад даже, если пока на древе не будет в окончательном месте.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #130 : 29 Октябрь 2020, 18:29:55 »
Saken,

Очень жду увидеть налкнец на YFull. Они же быстро проанализируют. Если попросишь Semargl, он сразу тебе скажет расклад даже, если пока на древе не будет в окончательном месте.

Написал Semargl, попросил закачать файлы с кабинета Небулы. Жду ответа.
« Последнее редактирование: 01 Ноябрь 2020, 16:55:47 от Saken »

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #131 : 31 Октябрь 2020, 17:09:52 »

Saken,

Очень жду увидеть налкнец на YFull. Они же быстро проанализируют. Если попросишь Semargl, он сразу тебе скажет расклад даже, если пока на древе не будет в окончательном месте.

Написал Semargl, попросил закачать файлы с кабинета Небулы. Жду ответа.

Все ок. Процесс пошел ;)
« Последнее редактирование: 01 Ноябрь 2020, 16:52:05 от Saken »

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #132 : 01 Ноябрь 2020, 16:34:14 »
Ох уж эти научные статьи и образцы из них. Всегда вопросы остаются. То ли дело образец в YFull. Жаль, что Брянский туда не отправил свои данные(
А Доржиев точно B99. Этот снип у него пока в приватных. До тех пор пока с таким же снипом образец до YFull не доберется.

У меня 2 приватных снипа Доржиева на YFull тоже вышли положительными.

11394021+ Y180055
12676951+ Z33001

« Последнее редактирование: 04 Сентябрь 2021, 18:15:34 от Saken »

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #133 : 01 Ноябрь 2020, 16:42:10 »
Анализ снипов в ветви B99. Правильно понимаю, что Z33001 предковый для B99, но ниже от C-Z4328?
« Последнее редактирование: 04 Сентябрь 2021, 18:17:32 от Saken »

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: С-M407
« Ответ #134 : 02 Ноябрь 2020, 13:24:34 »
На YFull добавили меня. Анализ в обработке.




 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.