АвторТема: Казахи С3-старкластер  (Прочитано 37823 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн asan-kaygyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #105 : 23 Ноябрь 2012, 13:51:09 »
Нельзя все знать, дерево снипов переодически пересматривается, и там очень часто обнаруживаются ошибки.

Оффлайн Migifbug

  • Сообщений: 390
  • Страна: kz
  • Рейтинг +50/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #106 : 23 Ноябрь 2012, 13:56:30 »
Все равно как-то они слишком небрежно подходят к изучению на мой взгляд...
Уж проверить по 1-му человека с субклада хотя бы для них легко...
А они пренебрегают совсем, плохо так работать... В репутацию минус им за это...

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 224
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #107 : 23 Ноябрь 2012, 14:48:18 »
За-то у нас есть такая возможность тогда... )

Не стоит тратить деньги на проверку С3с. По результату WTY будет известно.   

Оффлайн asan-kaygyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #108 : 23 Ноябрь 2012, 15:02:30 »
Про это забыл.

Оффлайн Migifbug

  • Сообщений: 390
  • Страна: kz
  • Рейтинг +50/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #109 : 23 Ноябрь 2012, 16:33:31 »
За-то у нас есть такая возможность тогда... )

Не стоит тратить деньги на проверку С3с. По результату WTY будет известно.   
А разве WTY проверяет все СНИПы? Там же вроде бы один случайно выбранный участок размером 100 или 180 Кб? Или какая там система?

И что касается C3c, в статье следующее написано:
Цитировать
Most of the SNPs and fragment length polymorphisms were characterized by custom TaqMan assays read on an ABI Prism 7900 HT Real-Time PCR System (Applied Biosystems). These polymorphisms included L53, L54, L55, L56, L57, L213, L329, L330, L331, L332, L333, L365, L400, L456, L472, L474, L475, L476, L528, LLY22g, M3, M9, M12, M15, M18, M20, M25, M35, M45, M55, M56, M69, M70, M73, M81, M86, M89, M93, M96, M102, M117, M119, M120, M122, M123, M124, M128, M130, M134, M143, M147, M157, M162, M170, M172, M173, M174, M178, M186, M201, M204, M207, M214, M217, M223, M230, M242, M253, M265, M267, M269, M285, M304, M323, M335, M346, M410, M417, M434, M458, P15, P25, P31, P36.2, P37.2, P47, P60, P63, P105, P215, P256, P261, P297, and PK2. Additional markers were detected through direct sequencing (L191, L334, L401, L527, L529, M17, M46 [Tat], M343, M407, MEH2, P39, P43, P48, P53.1, P62, P89, P98, P101, PageS000104, and PK5) and by PCR-RFLP analysis (M175).
И вот что написано:
Цитировать
Northern Altaian populations were composed largely of haplogroups Q and N-P43, whereas southern Altaians had a higher proportion of R-M417, C-M217/PK2, C-M86, and D-P47.
Я по логике так понял, что на PK2 проверяли всех M217, и всех их проверяли на M86 так же… По логике...
Выходит вероятней всего PK2 у C3-хазарейцев, C3-южно-алтайских казахов и, вероятно, что так же у C3c...
Поэтому интересно было бы проверить на PK2 ещё C3c и неплохо бы ещё C3d...

А по хазарейцам вот исследование:
http://www.nature.com/jhg/journal/v51/n4/pdf/jhg200655a.pdf
Цитировать
The PK2 polymorphism was
observed in clade C3 Y-chromosomes in the Hazara
and Burusho populations at frequencies of 43% and
9%, respectively
А тут есть STR типы Хазарейцев:
http://www.yhrd.org/YP000309
Там большая часть (около 40%) похожа на C3c
Возможно 43% были C3c, тогда PK2 — C3c мутация, а не старкластера...
Ну и C3d интерес проверить все равно останется тогда...
« Последнее редактирование: 23 Ноябрь 2012, 18:36:39 от Migifbug »

Оффлайн asan-kaygyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #110 : 05 Январь 2013, 11:18:49 »
PK2 убрали из классификации Исогга
•    C3   M217, P44, Z1453
•   •    C3*   -
•   •    C3a   M93
•   •    C3b   P39
•   •    C3c   M48
•   •    •    C3c*   --
•   •    •    C3c1   M77, M86
•   •    C3d   M407
•   •    C3e   P53.1
•   •    C3f   P62
•   •    C3g   Z1338
•   •    •    C3g*   -
•   •    •    C3g1   Z1300

Оффлайн asan-kaygyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #111 : 05 Январь 2013, 11:23:03 »
М407 не включен в состав
C3g Z1338
Хотя результаты Гено 2 говорят  об этом.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2400
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #112 : 05 Январь 2013, 12:44:23 »
PK2 убрали из классификации Исогга
•    C3   M217, P44, Z1453
•   •    C3*   -
•   •    C3a   M93
•   •    C3b   P39
•   •    C3c   M48
•   •    •    C3c*   --
•   •    •    C3c1   M77, M86
•   •    C3d   M407
•   •    C3e   P53.1
•   •    C3f   P62
•   •    C3g   Z1338
•   •    •    C3g*   -
•   •    •    C3g1   Z1300
Это хорошо. Но все равно с этим маркером (РК2) надо разбираться.

Оффлайн asan-kaygyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #113 : 05 Январь 2013, 13:13:19 »
Я 5 старкластерам это снип заказал.

Оффлайн asan-kaygyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #114 : 20 Февраль 2013, 18:09:23 »
PK2 отрицателен у старкластеров.

Оффлайн asan-kaygyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #115 : 20 Февраль 2013, 18:10:12 »
Судя по всему тут техническая проблемма с этим маркером, в ФТДНА не правильно подобраны праймеры либо была ошибка еще у Мухиддина.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2400
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #116 : 17 Март 2013, 06:54:52 »
Результаты от FTDNA:
Belesov 170991 P53.1+
Abdymashitov 181171 PK2-

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 224
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #117 : 17 Март 2013, 11:53:27 »
Belesov 170991 P53.1+

В своём исследовании С3е, скора пойму модель этого кластера. Вряд ли такой древний субклад имеет некую устойчивость относительно стракластера. 

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2400
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #118 : 17 Март 2013, 12:29:10 »
Почему С3е - древний субклад? Он незначительно отличается от гаплотипов старкластера. Возраст предка ныне живущих носителей старкластера - около 1200 лет.

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 224
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: Казахи С3-старкластер
« Ответ #119 : 17 Март 2013, 12:35:45 »
Почему С3е - древний субклад? Он незначительно отличается от гаплотипов старкластера. Возраст предка ныне живущих носителей старкластера - около 1200 лет.

Относительно к кластерам С3е найденных у немцев.

http://www.familytreedna.com/public/Chaplogroup/default.aspx?section=yresults

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.