АвторТема: 23andme - анализ родства  (Прочитано 196851 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #15 : 29 Апрель 2009, 18:01:32 »
Цитата: Trish
А я получила сегодня из 23andme поздравления:
Congratulations! Data for the person listed above are now available on the 23andMe website.

Не совсем поняла, есть там что-то уже конкретное именно по мне? Или только теория?

Оказывается есть и про меня!

А совпадение с Михаилом на 74.36%..

Мои поздравления!
Вот для начала люди, имеющие с Вами общего предка хотя бы по одной из линий на глубине где-то около 9 ± 2 поколений










Отмечу пока только то, что Роман Татусов - россиянин.
« Последнее редактирование: 30 Апрель 2009, 16:55:36 от Mich Glitch »

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #16 : 07 Май 2009, 21:28:40 »
napobo3, вот Вам еще тройка УПСовых родственников:





Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #17 : 17 Май 2009, 18:12:12 »
Считалочки по используемой приблизительной формуле дают следующее:

-ln(0.39/2.99) / ln2 = 2.94

Т.е., если бы мы не знали истинного родства, то сказали, что общий предок для двух товарищей отстоит на три поколения. Иными словами они троюродные братья с общим прадедом или прабабкой.

На деле же имеем 2.5 поколения. Т.е. у господина слева до предка три поколенных перехода (это его прадед, или прабабка), а у мадам справа 2 (это дед, или бабка).
« Последнее редактирование: 17 Май 2009, 18:13:57 от Mich Glitch »

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #18 : 17 Май 2009, 18:23:49 »
Пример двоюродного племяника от парово3:

Впечатляет. Почти полностью вся 4 хромосома!

Кстати, napobo3 рассматривает сейчас очень интересный случай по четвертой хромосоме.
Общий предок на интервале 5-6 поколений.
Немного подозрительно, что только один большой УПС на одной только хромосоме.
Подождём его выводов.

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1336
  • Страна: il
  • Рейтинг +337/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #19 : 19 Май 2009, 01:22:18 »
Пока ждал информации от одного из двух мега-совпаденцев пришли данные от двух других, имеющих УПС на 10й хромосоме (картинку прилагаю).
Обсчет их данных выдал:
HIR (Half-Identical Region): 8373775 bp,  1119 SNPs
Range: 43302396 - 51676171
При изучении семейных древ было найден общий предок, с одной стороны 10, а с другой - 11 поколений назад.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #20 : 19 Май 2009, 01:36:32 »
Цитировать
При изучении семейных древ было найден общий предок, с одной стороны 10, а с другой - 11 поколений назад.
По каким линиям, если не секрет?

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #21 : 19 Май 2009, 03:08:48 »
Цитировать
При изучении семейных древ было найден общий предок, с одной стороны 10, а с другой - 11 поколений назад.
По каким линиям, если не секрет?
Думаю, это люди из этой ветки ссылка, кликайте!

А теперь считалочки::)
Уважаемый парово3 высчитал размеры УПСа - 0.0084 Gb.

Производим расчёт поколений для пары:
-ln(0.0084/2.99) / ln(2) = 8.5 поколений.  На деле же имеем 10.5 поколений.

Об этом я уже писал выше, ссылка:
Цитировать
Поколение до общего предка. УПС.
1 ...................................................... 2.99 Gb (Братья-сёстры.)
2 ...................................................... 1.50 Gb (Двоюродные братья.)
3 ...................................................... 0.75 Gb (Троюродные братья.)
4 ...................................................... 0.37 Gb (Четвероюродные и т. д.)
5 ...................................................... 01.9 Gb
6 ...................................................... 0.09 Gb
7 ...................................................... 0.05 Gb
8 ...................................................... 0.02 Gb
9 ...................................................... 0.01 Gb
10 .................................................... 0.01 Gb
11 .................................................... 0 Gb (округленный 0, который еще отображается на диаграмме голубым цветом)

Табличка хороша и подкупает своей простотой, но в реальной жизни чаще всего не совпадает с действительными результатами.
Полученые значения УПС с 1 по 4 поколение много меньше.
В районе 5 - 7 поколений наблюдается примерное соответствие.
С 8 по 11 поколение действительные размеры УПС превосходят "идеальные".

Всему есть простые и понятные объяснения. Но так как речь идёт о вероятностном распределении, мы с уважаемым napobo3 стараемся особо не теоретизировать, а просто собираем и обсчитываем реальные случаи.

Единственная серьезная поправка, последнее время сбором и обработкой данных занимается один уважаемый napobo3.

Кстати, его англоязычное сокращение HIR (half-identical region), т.е. по-русски (от него же) УПС (участок половинного совпадения) прижилось и зазвучало на англоязычных форумах.

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1336
  • Страна: il
  • Рейтинг +337/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #22 : 19 Май 2009, 13:57:11 »
А вот и данные по мега-совпаденцам :HIR: 38864544 bp,  6397 SNPs
Range is: 102477407 - 141341951
Подробности - здесь.
Оценка нижней границы числа поколений то общего предка:-ln(0.038/2.99) / ln(2) = 6.3 На самом деле: (хотел бы я знать ::) ...совпаденцы копаются в бумагах...пожелаем им успеха!)

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1336
  • Страна: il
  • Рейтинг +337/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #23 : 20 Май 2009, 17:46:14 »
Более внимательное рассмотрение снипов двух совпаденцев показало, что рядом с описанным выше УПСом соседствует еще один, солидный - 18 Мегабп, а разделяет два УПСа всего один не совпадающий снип. Так как 23andme измеряя УПСы придерживается правила "один несовпадающий снип не считается", учтем это и получаем следующие параметры мега-УПСа:HIR : 57453486 bp,  9782 SNPs
Range : 83888465 - 141341951

57453486 бп вполне соответствует оценке 23andme: 0.05gb

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #24 : 20 Май 2009, 17:54:11 »
Более внимательное рассмотрение снипов двух совпаденцев показало, что рядом с описанным выше УПСом соседствует еще один, солидный - 18 Мегабп, а разделяет два УПСа всего один не совпадающий снип. Так как 23andme измеряя УПСы придерживается правила "один несовпадающий снип не считается", учтем это и получаем следующие параметры мега-УПСа:HIR : 57453486 bp,  9782 SNPs
Range : 83888465 - 141341951

57453486 бп вполне соответствует оценке 23andme: 0.05gb
Заметил, что 23эндМи обычно выдает меньшие размеры УПСов.
Я думаю что, допустим, имеем один снип на 5000 баз. Положим он не совпадает. 23эндМи голубую зону рисует непрерывно, а вот при отражении размеров УПСа эти несовпадающие базы из общей суммы выбрасывает. Поэтому и получается по Вашему методу, скажем 0.057, а 23эндМи дает 0.05. Хотя по логике должны были бы иметь округленно 0.06.

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19613
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #25 : 21 Май 2009, 17:25:05 »
Мич, а что показало сравнение с Илмари?
http://dna-forums.org/index.php?showtopic=6907&st=0&#entry99126

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #26 : 21 Май 2009, 17:34:38 »
Мич, а что показало сравнение с Илмари?
http://dna-forums.org/index.php?showtopic=6907&st=0&#entry99126
УПСов у нас с ним нет.

А по общему совпадению картина следующая (он в самом низу списка):

John Cullen 74.63%
Piotr Janicki 74.63%
Boris Debic 74.61%
Attila Csordas 74.59%
Chris Vesey 74.55%
David Michael 74.52%
E N 74.52%
Ian Gammage 74.50%
Margus Linnamae 74.49%
Eero Kyt? 74.46%
Joshua Willis 74.46%
Markus Mottl 74.46%
Mikolaj Habryn 74.45%
Mauri Myllyla 74.45%
Chelsea Arnold 74.45%
Roger Hicks 74.45%
Cheryl Morris 74.44%
Baltazar Kowalski 74.44%
Jonathan Hansen 74.44%
Heather Nowaczewski 74.43%
Russell Letkeman 74.43%
Lori Anderson 74.43%
Robin Pederson 74.43%
George Hart 74.42%
Justin Swanstrom 74.42%
Marko Heinila 74.42%
michael medved 74.42%
Kathleen Swineford 74.40%
John Swinton 74.40%
Thor Egede-Nissen 74.40%
Andrey Zorin 74.39%
James I McMillan 74.39%
Joris Calow 74.39%
Philip Brandenburg 74.39%
Rory McGinley 74.39%
John Gagon 74.39%
Henri Saarikoski 74.39%
Proband 1 74.38%
Dirk Schweitzer 74.38%
David Wilson 74.38%
Andrew Ostoyic 74.37%
Boris Maryshev 74.37%
Maureen Thomas 74.37%
Kevin Thorsell 74.37%
John Holcomb 74.36%
Kraig Lerud 74.36%
Derek Jensen 74.36%
Donald Gudehus 74.35%
Joakim Jardenberg 74.35%
Shirley Wiese 74.35%
Keith Harris 74.35%
Ilmari Kivinen 74.35%

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19613
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #27 : 21 Май 2009, 17:37:07 »
Мне бы с ним сравнить данные, он мне по гаплотипу близок. Надо делать аутосомы, а финансы поют романсы.  :-\

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34822
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3010/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #28 : 21 Май 2009, 17:42:15 »
Мне бы с ним сравнить данные, он мне по гаплотипу близок.
Насколько близок?
У Вас есть сравнение с ним по Y-STR?

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19613
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe - анализ родства
« Ответ #29 : 21 Май 2009, 17:55:17 »
Мне бы с ним сравнить данные, он мне по гаплотипу близок.
Насколько близок?
У Вас есть сравнение с ним по Y-STR?

14 мутаций на 67 маркеров (и 13 на 67 если учитывать, что у других Штруновых 389b=28), но нас все время в один субклад приписывают
Вот здесь

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100