Ветвей там действительно несколько:
1) казахско-татарско-пакистанская
2) индо-иранская
3) основная, начинающаяся с упомянутых швейцарцев, после которых мы видим обширный ашеназский кластер и неашкеназский кластер (Хафф/Хофф).
Просмотрел дерево. Интерес был, в основном, по генеалогиям. Кстати, ещё раз убедился в преимуществе картинки ТНТ перед Муркой. Дерево ТНТ даётся в редакторе, и найти нужный гаплотип среди любого их числа - поиском - в одно касание. В .png-Мурки сломаешь глаза, а 100% толка не добъёшься.
Что имею в виду.
Неплохо выглядит участок Хоффов, Корневой их предок (169897/172691) на 270 годах выглядит вполне убедительно. Однако не нашёл 213826, который был приведён в Вашей выборке. Есть пара увеличенных "кружков" (совпаденцев) с одними и теми же номерами - вопрос, что это? Может быть там и искомый номер затерялся? Или - неудобство поиска в .png + плохое зрение.
Попробовал посчитать этих Хоффов МВП - даёт чересчур завышенный возраст, даже не буду приводить, что-то не то и нужно разбираться.
А какие константы были при расчёте Вашего Ро-возраста (mrate & T generate)?
По Шакке. Это молодая генеалогия (1720) и странно видеть её в самом корне всего дерева. №137432 на 4190 лет! Сидят они нормально - компактно, как и положено, но тысячные TMRCA... может опять я что-то недопонял? Опять же, не отыскал Шакке №N63229.
Прокомментируете?
Уважаемый Alexander! Большое спасибо за интерес проявленный к моей, забытой Богом, гаплогруппе:)
Только вернулся с гор - поэтому откомментирую с ходу то что смогу.
1. Мурка может выдавать дерево в текстовом формате. Пишите на ЛС свой емэйл и я перешлю Вам соответствующие файлы. К сожалению, пока не научился их публиковать в удобочитаемом виде. Полагал, что графика более наглядна. Вижу, что это нет так.
2. Ро я брал равным 150 (по рекомендации уважаемого Valery, как я уже писал). В принципе, получилось адекватно. Соответственно при mutation rate 0,002784 это дает T generate = 28.
3. По Шакке. IMHO, филогенетичекое древо показывает не дату формирования ветви саму по себе, а ее возраст относительно других. Это и вывело достаточно молодую швейцарскую ветвь в корень гаплогруппы Q1b-L275. Я это интерпретирую так. Предки этого семейства были первыми европейскими Q1b, которые отделились от чисто азиатских ветвей. В корне там серьезно намешано. Или картина со временем прояснится, или мы действительно имеем нелокализуемый разброс гаплотипов от Малой Азии до Центральной Европы.
4. Упомянутые гаплотипы отсутствуют у меня в исходном *ych файле. Если так, то я их скорее всего убрал из выборки как полностью совпадающие гаплотипы. Т.е. на 67 маркерах они не имели различий с каким-то другим гаплотипом, который остался в выборке.