АвторТема: Евреи  (Прочитано 57772 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Nycticorax

  • Сообщений: 1548
  • Рейтинг +285/-35
  • Y - R1a1, mtDNA - D5a3
Re: Евреи
« Ответ #135 : 30 Июль 2012, 12:25:47 »
Цитировать
почему по совокупности снипов наиболее близкими к ашкеназам оказываются жители северной Италии и киприоты? Даже Веренич отказался от комментариев на этот счет.
Намёк на этрусков/тевкров?

Оффлайн zastrug

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 11271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2850/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Евреи
« Ответ #136 : 30 Июль 2012, 12:47:02 »
Цитировать
Мне до сих пор непонятно - почему по совокупности снипов наиболее близкими к ашкеназам оказываются жители северной Италии и киприоты?
Действительно странно. Если бы киприоты и сардинцы, это можно было бы объяснить, что они также самылетиоее близкие к исследованным неолитчикам - Отци и шведским, что объясняется ближневосточным происхождением неолитических земледельцев Европы. Но вот Северная Италия путает все карты.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Евреи
« Ответ #137 : 30 Июль 2012, 17:06:03 »
Цитировать
Мне до сих пор непонятно - почему по совокупности снипов наиболее близкими к ашкеназам оказываются жители северной Италии и киприоты?
Действительно странно. Если бы киприоты и сардинцы, это можно было бы объяснить, что они также самылетиоее близкие к исследованным неолитчикам - Отци и шведским, что объясняется ближневосточным происхождением неолитических земледельцев Европы. Но вот Северная Италия путает все карты.

Что-то я дезинформировал общественность.
Вот пример оракула по MDPL по ашкеназскому образцу:

1   CITAL (Central-Italian) 7.26
2   ASHK (Ashkenazi)     9.26
3   GRK (Greek)             9.55
4   SIC (Sicilian)            10.54
5   NITAL (North-Italian)   15.57
6   GGZ (Gagauz)           19.02
7   RMN (Romanian)   20.04
8   BLG (Bulgarian)   20.05
9   CRS (Corsican)   20.55
10   CPR (Cypriot)   20.87

Центральная Италия ближе чем Северная. И греки.

Оффлайн Nycticorax

  • Сообщений: 1548
  • Рейтинг +285/-35
  • Y - R1a1, mtDNA - D5a3
Re: Евреи
« Ответ #138 : 30 Июль 2012, 17:21:16 »
А вот в этом списке самые интересные, имхо, греки. Они явно выпадают из общей картины. Интересно почему? И почему северные итальянцы ближе к средиземноморским группам, чем центральные?

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Евреи
« Ответ #139 : 30 Июль 2012, 20:52:21 »
А вот оракул по Диенеку:
#   Population (source)   Distance
1   Ashkenazi (Dodecad)   4.08
2   Ashkenazy_Jews (Behar)   4.09
3   Sicilian (Dodecad)   4.51
4   S_Italian_Sicilian (Dodecad)   4.69
5   Greek (Dodecad)   6.78
6   C_Italian (Dodecad)   9.38

7   Sephardic_Jews (Behar)   9.53
8   Morocco_Jews (Behar)   12.09
9   O_Italian (Dodecad)   12.36
10   Tuscan (HGDP)   13.35


А вот оракул по проекту HARAPPA

#   Population (source)   Distance
1   ashkenazy-jew (behar)   5.24
2   ashkenazi (harappa)   5.4
3   sephardic-jew (behar)   9.22
4   morocco-jew (behar)   11.99
5   tuscan (1000genomes)   13.54
6   tuscan (hgdp)   14.22
7   turk-aydin (hodoglugil)   14.86
8   tuscan (hapmap)   14.91
9   cypriot (behar)   15.73
10   turk-istanbul (hodoglugil)   19.5
11   turk-kayseri (hodoglugil)   19.69

Тут расширенный состав восточных популяций, что делает ситуацию еще более загадочной. Хотя если справедлива теория о том, что значительный часть населения Турции тождественна по генетике населению Греции (так обе общины имеют значительный процент экс-византийев в предках), то многое становится на свои места.

Оффлайн zastrug

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 11271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2850/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Евреи
« Ответ #140 : 30 Июль 2012, 22:45:01 »
Подождите, так речь об оракулах или все же кто-то исследовал на популяционном уровне?

Цитировать
почему по совокупности снипов наиболее близкими к ашкеназам оказываются жители северной Италии и киприоты?

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Евреи
« Ответ #141 : 20 Август 2012, 22:15:39 »
Nature doi:10.1038/nature09103

The genome-wide structure of the Jewish people

Doron M. Behar et al.

Contemporary Jews comprise an aggregate of ethno-religious communities whose worldwide members identify with each other through various shared religious, historical and cultural traditions. Historical evidence suggests common origins in the Middle East, followed by migrations leading to the establishment of communities of Jews in Europe, Africa and Asia, in what is termed the Jewish Diaspora. This complex demographic history imposes special challenges in attempting to address the genetic structure of the Jewish people6. Although many genetic studies have shed light on Jewish origins and on diseases prevalent among Jewish communities, including studies focusing on uniparentally and biparentally inherited markers, genome-wide patterns of variation across the vast geographic span of Jewish Diaspora communities and their respective neighbours have yet to be addressed. Here we use high-density bead arrays to genotype individuals from 14 Jewish Diaspora communities and compare these patterns of genome-wide diversity with those from 69 Old World non-Jewish populations, of which 25 have not previously been reported. These samples were carefully chosen to provide comprehensive comparisons between Jewish and non-Jewish populations in the Diaspora, as well as with non-Jewish populations from the Middle East and north Africa. Principal component and structure-like analyses identify previously unrecognized genetic substructure within the Middle East. Most Jewish samples form a remarkably tight subcluster that overlies Druze and Cypriot samples but not samples from other Levantine populations or paired Diaspora host populations. In contrast, Ethiopian Jews (Beta Israel) and Indian Jews (Bene Israel and Cochini) cluster with neighbouring autochthonous populations in Ethiopia and western India, respectively, despite a clear paternal link between the Bene Israel and the Levant. These results cast light on the variegated genetic architecture of the Middle East, and trace the origins of most Jewish Diaspora communities to the Levant.

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature09103.html

Genome-wide structure of Jews (Behar et al. 2010) - комментарий Диенека

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Евреи
« Ответ #142 : 22 Ноябрь 2012, 21:14:39 »
Диенек снова взялся за ашкеназские адмиксы.

Цитировать
November 22, 2012
ALDER signal of admixture in Ashkenazi Jews
(You can skip the first part if you want, and head straight to the RESULTS section)

Previous studies on uniparental markers have indicated that Ashkenazi Jews (AJ) were formed by admixture between a Near Eastern population and European host populations; the evidence for the former element seems pretty clear on the basis of Y-chromosomes where Jews possess a relatively high frequency of Y-haplogroup J1 (and a few others) that are quite rare in non-Jewish north/east Europeans. As for the latter, it seems probable on the basis of the location of Ashkenazi Jews on PCA plots where they tend to occupy an intermediate position between extant populations of the Levant (including Near Eastern Jews) and non-Jewish Europeans.

Anyone who has played around with genetic data will know that while AJ may be positioned in the aforementioned "intermediate" location within the "West Eurasian continuum" between Europe and Near East, they tend to form their own cluster at higher dimensions. And, indeed, this is why it's fairly easy for a clustering algorithm, such as my "Clusters Galore" (MCLUST/MDS) approach to pick out a very specific AJ cluster (e.g., here, or here, using a fastIBD approach). An Ashkenazi Jewish-specific cluster also pops out at higher K in ADMIXTURE analyses. This cluster may reflect endogamy within the AJ community until quite recent times.

One way of detecting admixture in a group is through the use of f3-statistics. The statistic f3(AJ; European, Near_East) could be negative --which would indicate admixture-- but it is usually not -at least in the combinations of (European, Near_East) I've tried, and this is consistent with either the presence admixture or absence of admixture.

A simple and intuitive way to see why post-admixture drift might mask the presence of admixture can be seen by means of a simple calculation. Remember that the f3-statistic's +/- sign depends on the +/- sign of quantities (c-a)*(c-b) where c is an allele frequency in the admixed (?) population we are investigating, and a, b in the two reference populations. We can pick a to be less than b with no loss of generality.

In the absence of strong drift (e.g., if all populations have a very large number of individuals), then the allele frequency c=xa+(1-x)b where x is the amount of admixture --between 0 and 1-- from group A and (1-x) from group B, and this c will be maintained little changed in the post-admixture phase. With the aid of a little algebra, we get that:

(c-a)*(c-b) = (xa+(1-x)b-a)*(xa+(1-x)b-b)
= (xa+b-xb-a)*(xa+b-xb-b) =
= x(x-1)(a-b)^2

and this is of course negative because we assumed that x was less than 1.

In a large population, this c will remain near-constant, because of the lack of strong drift. As long as it remains within the interval (a,b), then (c-a)*(c-b) will also remain negative, and so will the f3 statistic.

But, what if strong drift affects the admixed population? Allele frequencies fluctuate more wildly in larger populations, so c might go outside the (a,b) interval. Without loss of generality, assume that c becomes greater than b in which case (c-a)*(c-b) will become positive.

The f3-statistic averages over many SNPs, so, depending on (i) the initial differentiation of the admixed populations, which could be seen as b-a, and (ii) the amount of drift, which causes c to jump outside the (a, b) interval as discussed above, it is possible that the evidence for admixture may disappear.

So, relying on allele frequency differences may help obliterate the signal of admixture. But, there is a different signal of admixture that uses the decay of admixture linkage-disequilibrium, most recently discussed in the ALDER paper. The admixture LD signal's evidence may also disappear in time, but only because the signal occurs at increasingly lower genetic distances over time due to recombination. Thankfully, it tends to occur at large enough --for the last few thousand years-- distances, for which the SNP density of existing genotyping platforms that measure a few hundred thousand SNPs per individual is sufficient.

METHODS

Naturally I was curious to see whether the admixture LD mechanism would produce the evidence of admixture that the f3-statistics did not. I combined three datasets in my possession (HGDP by Li et al. Behar et al. and Yunusbayev et al. ) and identified sets of European and Semitic populations. (Remember that these sets are non-exhaustive, but presumably usable surrogates for the true mixing populations exist within them):

Abhkasians_Y, Adygei, Belorussian, Bulgarians_Y, Chechens_Y, Chuvashs, French, French_Basque, Georgians, Hungarians, Lezgins, Lithuanians, Mordovians_Y, North_Italian, North_Ossetians_Y, Orcadian, Romanians, Russian, Sardinian, Spaniards, Tuscan, Ukranians_Y

and:

Bedouin, Druze, Egyptans, Ethiopian_Jews, Ethiopians, Iraq_Jews, Jordanians, Lebanese, Morocco_Jews, Palestinian, Saudis, Sephardic_Jews, Syrians, Yemenese, Yemen_Jews

I used my Dodecad Project sample of AJ which numbers 36 individuals and is larger than any other usable public sample available to me.

(ALDER was run with default parameters, using the Rutgets recombination map for Illumina chips, and with the merged dataset prepared with a --geno 0.03 flag. Note that the Ashkenazi_D sample consists of individuals typed on different Illumina platforms from 23andMe and FamilyTreeDNA. The total number of SNPs considered was 527,165.)

RESULTS

I report below the tests for which ALDER reported "success" for the test with no warnings:


The median of all these estimates is 36.78 generations or 1070 years which corresponds to a calendar date of 910CE, assuming the sample's birthday was 1980, and a generation length of 29 years.

Palamara et al. placed the beginning of demographic expansion of AJ in a similar timeframe (33 generations), following a severe founder effect reducing the population to ~270 individuals. Such a founder effect may have indeed served to produce positive f3-statistics, masking the presence of admixture, the occurrence of which appears to be substantiated on the basis of the ALDER test of admixture.

As for the levels of admixture, using a 1-ref analysis with the European populations, I get the following lower bounds:




I'd be interested in hearing people's opinions on the plausibility of these dates/proportions, as well as their potential historical associations; a lot of factors might affect these results, so perhaps this analysis could be improved in the future.

http://dienekes.blogspot.ru/2012/11/alder-signal-of-admixture-in-ashkenazi.html

Оффлайн Гулмамад

  • Pamir
  • Сообщений: 41
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Bartang
  • Y-ДНК: G2b1 M377
Re: Евреи
« Ответ #143 : 07 Июнь 2014, 18:57:36 »
С недавнего времени читаю БС и не мог удержаться от перепоста темы про евреев. Кому интересно - рекомендую посмотреть полностью. Там приведены уникальные, на мой взгляд, фотографии китайских, бухарских, иранских и горских евреев.

В горских, фото женщины 100%  нет даже 300% памирка, Ни за что не поверил бы, что она еврейка.
« Последнее редактирование: 08 Июнь 2014, 00:11:07 от Гулмамад »

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Евреи
« Ответ #144 : 07 Июнь 2014, 19:59:26 »
С недавнего времени читаю БС и не мог удержаться от перепоста темы про евреев. Кому интересно - рекомендую посмотреть полностью. Там приведены уникальные, на мой взгляд, фотографии китайских, бухарских, иранских и горских евреев.

В горских фото женщины 100%  нет даже 300% памирка, Ни за что не поверил бы, что она еврейка.
Горские Евреи возможно как-то связаны с Хазарами
Легенда про прародителя Хазар Хазарига.
У Михаила Сирийского, заимствовавшего сведения из утраченной «Церковной истории» Иоанна Эфесского VI века, имеется схожий рассказ о трёх братьях, вышедших с 30 000 человек из «внутренней Скифии» от «горы Имаон» то есть Имеон ( Имаон , Имеон = Гиндукуш, Памир и Тянь-Шань) , во время царствования византийского императора Маврикия (582—602). Старший брат Хазариг вместе с другим братом, чьё имя не названо, поселился в области Берсилия в стране алан (Кавказ), а младший брат — Булгар с разрешения императора пришёл в Мёзию (будущую Дунайскую Болгарию).

Оффлайн Гулмамад

  • Pamir
  • Сообщений: 41
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Bartang
  • Y-ДНК: G2b1 M377
Re: Евреи
« Ответ #145 : 08 Июнь 2014, 00:45:46 »
С недавнего времени читаю БС и не мог удержаться от перепоста темы про евреев. Кому интересно - рекомендую посмотреть полностью. Там приведены уникальные, на мой взгляд, фотографии китайских, бухарских, иранских и горских евреев.

В горских фото женщины 100%  нет даже 300% памирка, Ни за что не поверил бы, что она еврейка.
Горские Евреи возможно как-то связаны с Хазарами
Легенда про прародителя Хазар Хазарига.
У Михаила Сирийского, заимствовавшего сведения из утраченной «Церковной истории» Иоанна Эфесского VI века, имеется схожий рассказ о трёх братьях, вышедших с 30 000 человек из «внутренней Скифии» от «горы Имаон» то есть Имеон ( Имаон , Имеон = Гиндукуш, Памир и Тянь-Шань) , во время царствования византийского императора Маврикия (582—602). Старший брат Хазариг вместе с другим братом, чьё имя не названо, поселился в области Берсилия в стране алан (Кавказ), а младший брат — Булгар с разрешения императора пришёл в Мёзию (будущую Дунайскую Болгарию).

Часть правящей элиты Хазар приняла иудаизм http://ru.wikipedia.org/wiki/%D5%E0%E7%E0%F0%F1%EA%E8%E9_%EA%E0%E3%E0%ED%E0%F2

принять иудаизм можно было женившись на еврейке, на сколько я понимаю

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Евреи
« Ответ #146 : 08 Июнь 2014, 07:48:37 »
Если речь о горских, то среди них есть носители как кавказских, так и левантийских субкладов J1 и J2.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Евреи
« Ответ #147 : 08 Июнь 2014, 12:33:28 »
Если речь о горских, то среди них есть носители как кавказских, так и левантийских субкладов J1 и J2.
Диаграмма от Казимы Булаевы в которой у Горских Евреев основная гаплогруппа G (?)
https://scontent-b-mxp.xx.fbcdn.net/hphotos-xpf1/t1.0-9/10001303_657767784258865_1898720646403125488_n.jpg

Оффлайн Гулмамад

  • Pamir
  • Сообщений: 41
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Bartang
  • Y-ДНК: G2b1 M377
Re: Евреи
« Ответ #148 : 08 Июнь 2014, 14:31:35 »
Интересно было бы знать, когда горские приняли иудаизм?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Евреи
« Ответ #149 : 10 Июнь 2014, 10:59:38 »
Цитировать
Диаграмма от Казимы Булаевы в которой у Горских Евреев основная гаплогруппа G (?)
Есть цветной вариант диаграммы?

Цитировать
когда горские приняли иудаизм?
Учитывая, что часть из них J1-L147.2, то можно сказать что они и есть потомки Авраама

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.