АвторТема: Гаплогруппа N в проекте 1K Genomes и HGDP  (Прочитано 47047 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6777
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #195 : 11 Май 2012, 11:30:49 »
Ув. Владимир,
Посмотрите пожайлуста
положение снипа Z1973 относительно M178 у N1c1 и у других в проекте 1К genomes?
Вроде как есть непроверенная информация что он тоже имеет отношение именно к N1c1 примерно на уровне L1026.
« Последнее редактирование: 11 Май 2012, 12:08:20 от Eugene »

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #196 : 11 Май 2012, 14:24:51 »
Ув. Владимир,
Посмотрите пожайлуста
положение снипа Z1973 относительно M178 у N1c1 и у других в проекте 1К genomes?
Вроде как есть непроверенная информация что он тоже имеет отношение именно к N1c1 примерно на уровне L1026.
Не совсем так. Это тот же самый снип L1026 = Z1973
На участке 20351963 (Build36) произошла делеция
CATA - > CA

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6777
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #197 : 11 Май 2012, 14:42:53 »
Не совсем так. Это тот же самый снип L1026 = Z1973
На участке 20351963 (Build36) произошла делеция
CATA - > CA
OK.
Спасибо!

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #198 : 22 Май 2012, 06:43:51 »
154501 Shikalov, Russia Z1935+ Z1936+ Z1940- Z1941+
Это прекрасно, что выделилась эта ветвь.
К сожалению, представителей этой ветви нет в проекте 1000 genomes
Там либо Z1935+ Z1936+ Z1940- Z1941- либо Z1935+ Z1936+ Z1940+ Z1941+


К группе Z1935+ Z1936+ Z1940+ Z1941+ относятся образцы HG00188   HG00335   HG00271   HG00273   HG00336   HG00338   HG00358

Они объединяются одним общим снипом с тремя образцами HG00182 HG00311 HG00183 из группы Z1935+ Z1936+ Z1940- Z1941-  Эти три образца объединяются снипом Z1939 (Его надо бы запустить, вдруг он есть у Ivaska)

Видимо, это две подветви карельской ветви.
Другая ветвь - образцы HG00278 HG00375   HG00187
Скорее всего это ветвь Саво.
Эти три образца объединяют три снипа, один из которых Z1967
Тоже надо запускать.


Третья группа образцов HG00280 HG00342 HG00369  с Z1935- Z1936- Z1940- Z1941-  относятся к восточно-европейской ветви
Два из них HG00342 HG00369  имеют L1022+

Есть несколько снипов, общих для этих трех образцов, которые обязательно будут у всех N-L550 и возможно, у значительной части тех ветвей, которые принадлежат к субкладу N-L1026

Я не понимаю, неужели так сложно запустить FTDNA эти несколько снипов






« Последнее редактирование: 22 Май 2012, 07:30:22 от Yurgan »

Оффлайн Huckleberry Finn

  • Сообщений: 22
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: N1c1, carelian subclade
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #199 : 22 Май 2012, 11:10:00 »
Sorry for writing in english but I have some difficulties in understanding the message of Yurgan. Could you pls confirm that this is a right translation:

"154,501 Shikalov, Russia Z1935 + Z1936 + Z1940-Z1941 +. It's wonderful that this branch was identified. Unfortunately, the members of this branch are not in the 1000 draft genomes. They either Z1935 + Z1936 + Z1940-Z1941- or Z1935 + Z1936 + Z1940 + Z1941 +.

The samples of the group Z1935 + Z1936 + Z1940 + Z1941 + are HG00188 HG00335 HG00271 HG00273 HG00336 HG00338 HG00358. They are united by one common SNP with the three samples HG00182 HG00311 HG00183 from the group Z1935 + Z1936 + Z1940-Z1941-. The common SNP is Z1939, probably to be found by Ivaska.

Apparently, these two are sub-branches of the Karelian branch.  Another branch - samples HG00278 HG00375 HG00187, is most likely a branch of Savo. These three samples have three common SNP's, one of those is Z1967. These chould be checked.

The third group of samples is HG00280 HG00342 HG00369 having Z1935-Z1936-Z1940-Z1941- and they belong to the Eastern European branch. Two of them i.e. HG00342 HG00369 have L1022 +. There are several SNPs that are common to these three samples, which all probably have N-L550 and perhaps a substantial portion of those features, which belong to subclade N-L1026."

Many thanks for your help. Blagodarju!


Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #200 : 22 Май 2012, 13:05:53 »
Sorry for writing in english but I have some difficulties in understanding the message of Yurgan. Could you pls confirm that this is a right translation:


Оффлайн Huckleberry Finn

  • Сообщений: 22
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: N1c1, carelian subclade
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #201 : 22 Май 2012, 14:03:22 »
Prekrasno i ozen interesno. Ogromnoe spasibo, uv. Yurgan.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #202 : 04 Август 2012, 20:44:34 »
К вопросу о происхождении гаплогрупп N1c и N1b.

В 1000 геномов есть два образца  со снипом L666, у которых, в отличие от других тамошних N1 есть много общих снипов с N1c1
Возможно, это N1b, но другие снипы, определяющие N1b, там отсутствуют.
Возможно, это предковые для N1b гаплотипы, этакие N1b*
Один китаец из Пекина, а второй - что самое интересное - вьетнамец  ::)
« Последнее редактирование: 04 Август 2012, 20:51:36 от Yurgan »

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #203 : 05 Август 2012, 07:05:08 »
А какие у них общие снипы с N1c1?
Они уже зафиксированы как серия L или Z?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #204 : 05 Август 2012, 07:11:18 »
А какие у них общие снипы с N1c1?
Они уже зафиксированы как серия L или Z?
L729
Другие не зафиксированы.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #205 : 21 Август 2012, 10:47:37 »
Неожиданно.  :o
Два образца - китаец и вьетнамец из 1000 геномов, которые L666, оказались M128.
Делеция CTGTG - > CTG
Т.е. N1a и N1b ближе другу к другу, чем к N1c.
Это объясняет более позднее появление N1b в Сибири.
Надо срочно проверять на L666 господина Мияту N107608   

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #206 : 21 Август 2012, 14:17:07 »
В проекте 1000 геномов более 80 снипов, которые являются общими у N1c1 и отсутствуют у N1a.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #207 : 21 Август 2012, 14:50:28 »
В проекте 1000 геномов более 80 снипов, которые являются общими у N1c1 и отсутствуют у N1a.
А там чистые N1c* есть?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #208 : 21 Август 2012, 18:50:42 »
В проекте 1000 геномов более 80 снипов, которые являются общими у N1c1 и отсутствуют у N1a.
А там чистые N1c* есть?
Нет, там две ветви.
Финно-карельская и восточно-европейская с L1022, Т.е. все N-L1026
Вот у них общих более 80 снипов.
С N-708* будет поменьше,
« Последнее редактирование: 22 Август 2012, 07:02:49 от Yurgan »

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Гаплогруппа N в проекте 1000 genomes
« Ответ #209 : 22 Август 2012, 07:21:33 »
В проекте 1000 геномов более 80 снипов, которые являются общими у N1c1 и отсутствуют у N1a.
А там чистые N1c* есть?
Нет, там две ветви.
Финно-карельская и восточно-европейская с L1022, Т.е. все N-L1026
Вот у них общих более 80 снипов.
С N-708* будет поменьше,

У восточно-европейской ветви 8 своих снипов, а у финно-карельской 9.

А каждого образца примерно 12 снипов, которые появились после разделения этих ветвей.


Кто у нас считает возраст по снипам?

Т.е. со времени разделения N1a и N1c прошло 95 снипов, а со времени разделения восточно-европейской и финно-карельской 12 снипов.
 

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.