• Добро пожаловать, Гость
news Новости:


news

Автор Тема: Сравнение Y-маркеров  (Прочитано 528 раз)

0 Пользователей и 1 Гость смотрят эту тему.

Offlinenapobo3

  • Rating 59
  • Сообщений: 396
  • Y-ДНК: J1e
  • мтДНК: N1b2
Сравнение Y-маркеров
« : 07 Июня 2009, 10:34:53 »
  •  
Стив Морз, разработчик интеловского процессора 8086, опубликовал простой инструмент* для сравнения Y-маркеров.
Хотим ли мы попросить его добавить ydna.ru ?

*Если кто знает более удачное название для английского tool, подскажите.
« Последнее редактирование: 08 Июня 2009, 17:14:13 от Аббат Бузони »
Записан
Y-DNA: J1e   Ysearch: ZFCQG
SNPs: M429+ M294+ P129+ M304+ P58+ M267+  M369- L147+
mtDNA: N1b2 mtSearch: ZFCQG GenBank ID: GU320211
а также:
Y-DNA:  G2a3b* Ysearch: PSQP6
Y-DNA:  R1a1     Ysearch: 4TDCJ
mtDNA: H (H6a1 ?)

Onlinemouglley

  • Rating 100
  • Сообщений: 2307
  • Y-ДНК: N1c1*
  • мтДНК: J1c3c
  • Я знаю, что познаю всё.
Re: сравнение Y-маркеров
« Reply #1 : 07 Июня 2009, 17:22:52 »
  •  
Вроде, работает.
Кто-нибудь заметил отличия от Yutility?
Надо будет скачать jav'у, посмотреть, какиескорости там заложены.

Но, по-моему, для тех,ктопозанимался ДНК-генеалогией и Yutility и эта считалка уже не катят.

По правильным группам пока раскладавют только Нетворк (чтобы разобрать дерево требуется очень много времени) и Мурка (сразу же получаем готовое и вполне достоверное, судя по национальной принадлежнсти, дерево).
Записан
Y-DNA: N1с1*; M214(rs2032674)+; P188(rs16980610)+; P192(rs16980641)+; P193(rs16980426)+; P194(rs16980363)+; P195(rs2196155)+; M231(rs9341278)+; LLY22g+; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298+; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 del32-normal

Offlineshekhol

  • default avatar
  • Rating 7
  • Сообщений: 189
  • Y-ДНК: N1c
Re: сравнение Y-маркеров
« Reply #2 : 08 Февраля 2010, 19:52:55 »
  •  
Цитата: mouglley от 07 Июня 2009, 17:22:52
Вроде, работает.
Кто-нибудь заметил отличия от Yutility?
Надо будет скачать jav'у, посмотреть, какиескорости там заложены.

Но, по-моему, для тех,ктопозанимался ДНК-генеалогией и Yutility и эта считалка уже не катят.

По правильным группам пока раскладавют только Нетворк (чтобы разобрать дерево требуется очень много времени) и Мурка (сразу же получаем готовое и вполне достоверное, судя по национальной принадлежнсти, дерево).

mouglley,
а на каком железе Вы считали?  Сколько по времени это занимает?
Записан

Onlinemouglley

  • Rating 100
  • Сообщений: 2307
  • Y-ДНК: N1c1*
  • мтДНК: J1c3c
  • Я знаю, что познаю всё.
Re: Сравнение Y-маркеров
« Reply #3 : 08 Февраля 2010, 21:41:59 »
  •  
4-х ядрёный процессор, 2 Гб памяти, скорость 3330 МГ.
Мурка:
Дерево 428 67-маркерных гаплотипов считает 3- часа.
1200 67-ми маркерных гаплотипов считает сутки.
Записан
Y-DNA: N1с1*; M214(rs2032674)+; P188(rs16980610)+; P192(rs16980641)+; P193(rs16980426)+; P194(rs16980363)+; P195(rs2196155)+; M231(rs9341278)+; LLY22g+; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298+; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 del32-normal

Offlineshekhol

  • default avatar
  • Rating 7
  • Сообщений: 189
  • Y-ДНК: N1c
Re: Сравнение Y-маркеров
« Reply #4 : 09 Февраля 2010, 19:05:50 »
  •  
Цитата: mouglley от 08 Февраля 2010, 21:41:59
4-х ядрёный процессор, 2 Гб памяти, скорость 3330 МГ.
Мурка:
Дерево 428 67-маркерных гаплотипов считает 3- часа.
1200 67-ми маркерных гаплотипов считает сутки.

:) ясненько.

А система какая?   
Записан

OfflineКаржавин

  • default avatar
  • Rating 40
  • Сообщений: 435
Re: Сравнение Y-маркеров
« Reply #5 : 09 Февраля 2010, 20:44:20 »
  •  
Цитата: mouglley от 08 Февраля 2010, 21:41:59
4-х ядрёный процессор, 2 Гб памяти, скорость 3330 МГ.
Мурка:
Дерево 428 67-маркерных гаплотипов считает 3- часа.
1200 67-ми маркерных гаплотипов считает сутки.
Зависимость времени счета от объема гаплотипов ниже квадратичной. Прекрасная программа, да и время счета для такой задачи - небольшое.
Записан
Даже если ваше объяснение настолько ясно, что исключает всякое ложное толкование, все равно найдется человек, который поймет вас неправильно [следствие из 3-го закона Чизхолма]

Onlinemouglley

  • Rating 100
  • Сообщений: 2307
  • Y-ДНК: N1c1*
  • мтДНК: J1c3c
  • Я знаю, что познаю всё.
Re: Сравнение Y-маркеров
« Reply #6 : 09 Февраля 2010, 22:36:23 »
  •  
Цитата: Каржавин от 09 Февраля 2010, 20:44:20
Зависимость времени счета от объема гаплотипов ниже квадратичной. Прекрасная программа, да и время счета для такой задачи - небольшое.
Да. причём время расчёта можно регулировать ухудшением выходящих результатов.
Пока же себе поставил: то, что считается более суток - вне моей досягаемости.


Записан
Y-DNA: N1с1*; M214(rs2032674)+; P188(rs16980610)+; P192(rs16980641)+; P193(rs16980426)+; P194(rs16980363)+; P195(rs2196155)+; M231(rs9341278)+; LLY22g+; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298+; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 del32-normal

Onlinemouglley

  • Rating 100
  • Сообщений: 2307
  • Y-ДНК: N1c1*
  • мтДНК: J1c3c
  • Я знаю, что познаю всё.
Re: Сравнение Y-маркеров
« Reply #7 : 09 Февраля 2010, 22:41:56 »
  •  
Цитата: shekhol от 09 Февраля 2010, 19:05:50
:) ясненько.

А система какая?   
Винда-хр-32.
В данный момент пытаюсь мигрировать на Винду-7-64,

Остался вопрос, можно ли на мою маму GA-P35-DS4 r2 установить 2 планки памяти по 4 ГБ, или придётся ставить 4 планки по 2 Гб?

Вот в чём вопрос, а то - Гамлет, Гамлет...

ЗЫ: Перенесите пожалуйста эти рассуждения в раздел "Компьютер для ДНК-генеалогии".
Записан
Y-DNA: N1с1*; M214(rs2032674)+; P188(rs16980610)+; P192(rs16980641)+; P193(rs16980426)+; P194(rs16980363)+; P195(rs2196155)+; M231(rs9341278)+; LLY22g+; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298+; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 del32-normal

OfflineLesla

  • Rating 25
  • Сообщений: 191
  • Y-ДНК: R1a1a*
    • WWW
Re: Сравнение Y-маркеров
« Reply #8 : 09 Февраля 2010, 23:11:58 »
  •  
Цитата: mouglley от 09 Февраля 2010, 22:41:56
Остался вопрос, можно ли на мою маму GA-P35-DS4 r2 установить 2 планки памяти по 4 ГБ, или придётся ставить 4 планки по 2 Гб?
Планки не больше 2 Гб. Если нужно 8 Гб, придется ставить 4 планки.
Записан
С уважением, Вячеслав Кудряшов.
yDNA: A2951C
Ysearch: 59YY6
Family TreeDNA: 154400

Onlinemouglley

  • Rating 100
  • Сообщений: 2307
  • Y-ДНК: N1c1*
  • мтДНК: J1c3c
  • Я знаю, что познаю всё.
Re: Сравнение Y-маркеров
« Reply #9 : 09 Февраля 2010, 23:16:09 »
  •  
Спасибо.
А я надеялся, верил, ждал...
Записан
Y-DNA: N1с1*; M214(rs2032674)+; P188(rs16980610)+; P192(rs16980641)+; P193(rs16980426)+; P194(rs16980363)+; P195(rs2196155)+; M231(rs9341278)+; LLY22g+; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298+; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 del32-normal
 

[PROF THEME]
Rambler's Top100