АвторТема: Gedmatch Ad-Mix Utility  (Прочитано 12064 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Anode

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 1502
  • Страна: ca
  • Рейтинг +145/-0
  • PS1 -> TT1 -> EE1 -> PS2
  • Y-ДНК: N1c1
  • мтДНК: H10a1, U5b1
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #15 : 08 Сентябрь 2011, 16:38:27 »
Цитировать
Новая игрушка на gedmatch
http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/ap_mix1.php
Нажимаю ссылку  - "невозможно отобразить стр". Как попасть туда?

http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/ap_mix1w.php

Живая ссылка также есть с главной страницы ("Admixture Proportions by Chromosome")

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1049
  • Рейтинг +140/-1
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #16 : 08 Сентябрь 2011, 21:13:11 »
Anode
Большое спасибо. Получилось. Такая гремучая смесь! Только может быть действительно подходить к этому как к игрушке, раз при повторном обращении получаются разные результаты?

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5997
  • Страна: ru
  • Рейтинг +943/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #17 : 15 Сентябрь 2011, 15:46:23 »
Теперь Gedmatch имеет все возможности Dodecad v3. Кроме admixture analysis теперь реализована визуализация по сегментам хромосом и возможность сравнения двух образцов.
Соответствующее сообщение разместил в своём блоге Диенек. 

Оффлайн UA6ATG

  • Сообщений: 170
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-1
  • Y-ДНК: J-M172
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #18 : 29 Ноябрь 2011, 10:28:13 »
А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 11074
  • Страна: ee
  • Рейтинг +753/-8
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #19 : 29 Ноябрь 2011, 11:33:04 »
А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

Загружаете свои данные от FTDNA на сайт Gedmatch.
Вот и вся методика.

Оффлайн UA6ATG

  • Сообщений: 170
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-1
  • Y-ДНК: J-M172
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #20 : 29 Ноябрь 2011, 11:49:04 »
А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

Загружаете свои данные от FTDNA на сайт Gedmatch.
Вот и вся методика.

Я понимаю, но данные вручную заносить (то есть банально вводя данные повторов маркеров Y хромосомы) или есть какой более продвинутый способ?  Или речь идет о других тестах не на Y хромосоме?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 11074
  • Страна: ee
  • Рейтинг +753/-8
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #21 : 29 Ноябрь 2011, 11:58:43 »
А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

Загружаете свои данные от FTDNA на сайт Gedmatch.
Вот и вся методика.

Я понимаю, но данные вручную заносить (то есть банально вводя данные повторов маркеров Y хромосомы) или есть какой более продвинутый способ?  Или речь идет о других тестах не на Y хромосоме?

Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

Оффлайн UA6ATG

  • Сообщений: 170
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-1
  • Y-ДНК: J-M172
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #22 : 29 Ноябрь 2011, 12:13:08 »
Цитировать
Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

А не могли бы Вы очень кратно рассказать, как именно переносить данные из FTDNA в этом случаи?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 11074
  • Страна: ee
  • Рейтинг +753/-8
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #23 : 29 Ноябрь 2011, 13:11:14 »
Цитировать
Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

А не могли бы Вы очень кратно рассказать, как именно переносить данные из FTDNA в этом случаи?

http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/a-upload1.php
http://ww2.gedmatch.com:8007/x/x_upload1.php

Оффлайн UA6ATG

  • Сообщений: 170
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-1
  • Y-ДНК: J-M172
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #24 : 29 Ноябрь 2011, 16:27:19 »
Цитировать
Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

А не могли бы Вы очень кратно рассказать, как именно переносить данные из FTDNA в этом случаи?

http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/a-upload1.php
http://ww2.gedmatch.com:8007/x/x_upload1.php

Спасибо! В целом понятно.  Вот только:
On the screen that opens, RIGHT click on "Autosomal Results".
Так я понял этот Autosomal Results надо заказывать и оплачивать отдельно?
По Х хромосоме: это заказ стандартного теста на мито ДНК или я не так понимаю?

Оффлайн Genesis

  • Сообщений: 113
  • Страна: 00
  • Рейтинг +33/-0
  • Y-ДНК: R1a (CTS1211+)
  • мтДНК: H
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #25 : 29 Ноябрь 2011, 16:37:39 »
Autosomal Results - GZIP, CSV
X Chromosome Results - GZIP, CSV

Это результаты у Вас есть, только если Вы заказывали  Family Finder:

2. In the column on the left, under Family Finder (either Affymetrix or Illumina section), click on "Download Raw Data"

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5997
  • Страна: ru
  • Рейтинг +943/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #26 : 29 Ноябрь 2011, 21:18:16 »
Спасибо! В целом понятно.  Вот только:
On the screen that opens, RIGHT click on "Autosomal Results".
Так я понял этот Autosomal Results надо заказывать и оплачивать отдельно?
По Х хромосоме: это заказ стандартного теста на мито ДНК или я не так понимаю?

GEDMatch и рассчитан на анализ аутосомного теста. Для этого нужно заказать Family Finder на FTDNA (там будет и анализ Х-хромосомы в отдельном файле) или заказать стандартный тест на 23иЯ (там будет всё: гаплотипы по Y и мито, аутосомы, Х-хромосома). Но если у Вас уже есть набор на FTDNA, то лучше и дешевле остановиться на заказе Family Finder, тем более сейчас есть скидка.

Оффлайн UA6ATG

  • Сообщений: 170
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-1
  • Y-ДНК: J-M172
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #27 : 01 Декабрь 2011, 10:16:47 »
Вообще то дешевле будет заказать с большой рожденственной скидкой на 23andme если она конечно будет...
Ну да ладно.  А нет случайно перевода help к  Gedmatch на русский язык? Может кто переводил?

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5997
  • Страна: ru
  • Рейтинг +943/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #28 : 01 Декабрь 2011, 10:52:20 »
Вообще то дешевле будет заказать с большой рожденственной скидкой на 23andme если она конечно будет...
Ну да ладно.  А нет случайно перевода help к  Gedmatch на русский язык? Может кто переводил?

Help как таковой вряд ли переводили, но на форуме есть ветка, где вопросы по Гедматчу достаточно подробно обсуждаются.

Относительно рождественных скидок на 23иЯ (если они, действительно, будут). Посчитайте с учетом пересылки через Шапито - получиться не мало. А в ФТДНА Ваш кит уже находится - ничего отдельно пересылать не нужно. Там конечно панель мультиснипов беднее - но для генеалогических целей и выяснения этнофона вполне подойдет.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5997
  • Страна: ru
  • Рейтинг +943/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Gedmatch Ad-Mix Utility
« Ответ #29 : 04 Июнь 2012, 17:04:44 »
Хотелось бы развить эту тему:)
Сейчас в GEDmatch представлены все основные калькуляторы и "ораклы": Диенек, Еврогенес, Хараппа, и конечно MDLP от Вадима Веренича.
Т.е. инструментальная база для анализа более чем солидная.
Может как-то обобщить результаты по разным проектам для сравнения и обобщения. Хотя бы по участникам МолГена, что, в принципе, обеспечит достаточно репрезентативную многонациональную выборку.

Даже если отбросить проблему идентификации метисов, которые способны запутать и без того запутанный вопрос:), то остается достаточно интересным вопрос о близости по генетическим дистанциям различных этносов.

Касательно сходства русских, украинцев, белорусов и литовцев - это уже установленный факт.
А вот почему к среднему ашкеназу оказались близки тосканцы, сицилийцы и киприоты? Именно эти популяции. А не немцы, австрийцы и поляки в этническом окружении которых они казалось бы проживали?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100