АвторТема: Обсуждение: Расчёт ВБОП по раздельным панелям Y-STR маркеров, отсортированных по  (Прочитано 15036 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Каржавин

  • ...
  • Сообщений: 1798
  • Рейтинг +144/-2
Нет смысла второй раз выводить формулу Адамова, если считаешь, что она выведена правильно. Равно как нет смысла повторять Ваш анализ (2008) о нечетных-четных шагах мутаций. Свои мысли я излагаю так, как они были изложены в опубликованной статье, где графики основанные на сотне-другой экспериментально полученных датировок показывают поочередное (по мере убывание древности ветвей) насыщение самых быстрых расчетных панелей. Сравнение линейного с ASD в статье выборочное, потому что ASD ввел в оборот уже при ответах резензенту. Для новых расчетов сравнение также проводил выборочно, потому что получалось примерно одно и то же обоими методами, а времени ASD расчеты у меня отнимают побольше (чисто технически). По базовым гаплотипам могу выслать Вам таблицу У-древа из более, чем 700 базовых гаплотипов - сравните со своими для тех же узлов, ветвей. Может быть никакой существенной разницы между нашими подходами и нет? Табличный файл doc занимает 7.8Мб. Есть желание и время?
С временем сейчас большие проблемы. Попозже.
А почему бы Вам не использовать Метод выборочных пар? Его просто реализовать. Чуть сложнее обычного ASD метода или Линейного метода.
« Последнее редактирование: 04 Декабрь 2011, 13:13:39 от Каржавин »

Оффлайн Slavar

  • Сообщений: 164
  • Страна: ru
  • Рейтинг +26/-3
  • 297896
  • Y-ДНК: Ra1a1a-CTS3402+
  • мтДНК: U4a2a
Уф-фф... Год назад мне АК примерно так же сказал: "А почему бы Вам самому не посчитать, если не нравятся мои расчеты?" Убил год не на своё дело, а более интересное лежит и ждет.
Вот только что посчитал ASD (по раздельным панелям) и сравнил с линейным с поправкой Адамова по раздельным панелям для хорошо снипированных и неплохо представленных британских ветвей:
  R1b1a2a1ab4 L21-P312-M222neg (FTDNA) по состоянию на  25 ноября 2011:

const - константа панели
n(i) - число маркеров в панели
N - число гаплотипов в ветви
Masd - сумма квадратов разностей для ASD
Mlin -число мутаций в панели
Tiasd - возраст по i-ой панели
Tilin - возраст по i-ой панели линейным

Жирным выделены панели, принятые в расчет

 R1b1a2a1a1b4-M222neg-nonattributed-Brit92 (N=92) - сумма неаттрибутированных, т.е. не разделенных на англичан, валлийцев, шотландцев, ирландцев

panel   const   n(i)   N   Masd   Mlin   Tiasd   Ti(lin)
67F1   23600   8   92   22.9   19   5874   4938
67F2   4175   15   92   78   70   3540   3259
67F3   1725   13   92   182.4   156   3420   3129
67F4   575   18   92   636   524   3975   3884
67F5   975   5   92   261.6   229   2772   3210

67F6   425   5   92   457   272   2111   1763
67F7   350   2   92   337.6   192   1284   1402

T2-5(ASD) = 3425±500 vs T2-5 (lin) = 3375±350

R1b1a2a1b4-M222neg-Wal11En37-48 (N=48)
panel   const   n(i)   N   Masd   Mlin   Tiasd   Ti(lin)
67F1   23600   8   48   8   8   3933   3975
67F2   4175   15   48   55.5   52   4827   4692
67F3   1725   13   48   120   101   4313   3949
67F4   575   18   48   291.6   244   3493   3400
67F5   975   5   48   159.1   107   3232   2784

67F6   425   5   48   235.5   147   2085   1851
67F7   350   2   48   173.1   94   1262   1255

T2-5(ASD) = 3975±725 vs T2-5(lin) = 3700±800

(раздельно линейным T2-5(lin)English37 = 3700±650, T2-5(lin)Welsh11 = 3675±1375)

R1b1a2a1b4-L21-P312-M222neg-Irish49 (N=49)

panel   const   n(i)   N   Masd   Mlin   Tiasd   Ti(lin)
67F1   23600   8   49   7   5   3371   2424
67F2   4175   15   49   37.8   31   3221   2698
67F3   1725   13   49   98.4   93   3464   3531
67F4   575   18   49   272.2   245   3194   3335
67F5   975   5   49   187.7   132   3735   3564

67F6   425   5   49   210.1   140   1822   1682
67F7   350   2   49   136.5   80   975   932

T2-5 (ASD) = 3400±250 vs  T2-5 (lin) = 3275±400

R1b1a2a1b4- L21-P312-M222neg-Scottish29 (N=29)
67F1   23600   8   29   4   4   3255   3283
67F2   4175   15   29   25.8   23   3714   3401
67F3   1725   13   29   51   48   3034   3049
67F4   575   18   29   169.3   139   3357   3176
67F5   975   5   29   98.7   75   3318   3376

67F6   425   5   29   112.8   84   1653   1714
67F7   350   2   29   116.7   61   1408   1422

T2-5(ASD) = 3350±275 vs T2-5 (lin) = 3350±175

В целом, похоже на то, что датируют одинаково, причем, агличане и валлийцы (с одниковым базовым гаплотипом) примерно совпадают с приходом ККК в Британию, а шотландцы и ирландцы (тоже с одинаковым базовым гаплотипом, но отличающимся в одном маркере от англичан-валлийцев) несколько моложе, что естественно отнести на продвижение на север и на запад.

Оффлайн Каржавин

  • ...
  • Сообщений: 1798
  • Рейтинг +144/-2
Цитировать
В целом, похоже на то, что датируют одинаково, причем, агличане и валлийцы (с одниковым базовым гаплотипом) примерно совпадают с приходом ККК в Британию, а шотландцы и ирландцы (тоже с одинаковым базовым гаплотипом, но отличающимся в одном маркере от англичан-валлийцев) несколько моложе, что естественно отнести на продвижение на север и на запад.
Сравнение результатов ASD и линейного метода - это к Адамову. Я в этих методах мало что смыслю  ;)
А про археологические культуры - это к Застругу  ;)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.