R1a у арабов

[Semargl]

В продолжение темы, начатой в ветке сарматов.
По просьбе Nycticorax, выкладываю дерево арабских R1a.
Просьба не судить строго

Ветка племени Тамим, с ближайшими соседями на общем дереве R1a:
("сидит" на этом месте крепко, несмотря на разные опции построения, изменяется незначительно)

[Semargl]

Попробовал построить дерево, добавив все известные мне 67 маркерные гаплотипы арабов. Набралось 43 гт.
Вывод: Племя Тамим, осталось там же, где и было. А остальные арабы, в основном курайшиты расползлись по всему дереву R1a.
Выкладываю дерево, только 43 арабских гт. Деревьев получилось два, отличия незначительны.
Какие будут замечания?

[Nycticorax]

Получается, что ближайшая к Тамим ветка не "сарматы" а "североморская"? Или я что попутал?

[Semargl]

Получается, что ближайшая к Тамим ветка не "сарматы" а "североморская"? Или я что попутал?

Из "сарматов" есть только Szymanski, которого случайно прибило к арабской ветке.
А ближайшая ветка не сарматская, а "викингов". По крайней мере все, кроме Backlund, Copeland, Mastin, Feist, определяются предиктором Urasina, как R1a1a1*-Vikings.

[Farroukh]

Интересно, среди них есть прошедшие WTY-тест? Это отдельный ближневосточный субклад или просто кластер? насколько он отстоит от хазарской ветви?

По моим спекулятивным прикидкам, в Азии намечаются минимум два разных субклада.

[Semargl]

Интересно, среди них есть прошедшие WTY-тест? Это отдельный ближневосточный субклад или просто кластер? насколько он отстоит от хазарской ветви?

По моим спекулятивным прикидкам, в Азии намечаются минимум два разных субклада.

На счет WTY - у меня информации нет, но можно посмотреть снипы протестированных здесь

[Lesla]

Интересно, среди них есть прошедшие WTY-тест?

Нет, к сожалению.
116213 Kussad и 184336 Abdulaziz (немногие счастливчики из Азии, участвующие в WTY) на другой ветке, судя по второй схеме.

[Овод]

Хорошая работа, Тунец. +1
 
Меня только смущает укоренение по модалу выборки. Лучше укоренять по постороннему или же условно-предковому (например, Вертнеровскому, как это делает Маугли).
 
Модал имеет тенденцию перекашивать дерево в сторону наиболее полно представленного в выборке кластера. Это незначительно повлияет на сами терминальные ветки, но очень сильно - на их взаимное расположение. Отсюда может наблюдаться ложная близость некоторых ветвей.
 
Кстати, вы получили последнюю версию ро-скрипта от Александра?
 
 

[Semargl]

Хорошая работа, Тунец. +1
 
Меня только смущает укоренение по модалу выборки. Лучше укоренять по постороннему или же условно-предковому (например, Вертнеровскому, как это делает Маугли).
 
Модал имеет тенденцию перекашивать дерево в сторону наиболее полно представленного в выборке кластера. Это незначительно повлияет на сами терминальные ветки, но очень сильно - на их взаимное расположение. Отсюда может наблюдаться ложная близость некоторых ветвей.
 
Кстати, вы получили последнюю версию ро-скрипта от Александра?

Да, получил. Огромное спасибо!
Попробую последовать Вашему совету. У меня есть несколько вопросов, но задам чуть позже, в другой теме.

[Yurgan]

DYS640 = 12 редкое значени у R1a1, и оно имеется у двух кластеров арабов.
Один кластер (Arab-1)- это Бану Тамим и их родственники, второй (Arab-2) Doha-Qatar, Tulsyan - India,
Al Nuaimi, Mohamed.
Эти ветви сильно разнечены межу собой, самое большое растояние - 41/67.
Странно, что в двух разных ветвях арабов одна и та же мутация, ну ладно, спишем это на гомоплазию.
Но первый кластер (Arab-1) все явные родственники, самое дальнее расстояние - 15/67.
M6285 Kabeer  - 162855 Akram Tamim.

гаплотип M6285 Kabeer я на дереве не вижу. Именно он даст больший возраст для кластера Arab-1

[Semargl]

Но первый кластер (Arab-1) все явные родственники, самое дальнее расстояние - 15/67.
M6285 Kabeer  - 162855 Akram Tamim.
гаплотип M6285 Kabeer я на дереве не вижу. Именно он даст больший возраст для кластера Arab-1

Добавил M6285, действительно возраст Arab1 немного изменился.

[Овод]

Тунец, у Вас на дереве образуются рубра с ложным разрешением (нулевой длины). Это происходит из-за того, что ТНТ по умолчанию представляет дерево в бинарном виде. Для того, чтобы избежать этого и отразить реальную полифилию ветвей, Вам стоит установить в выпадающем окне поиска опцию "Сollapse trees after search".
 
Дерево станет более реалистичным.

[Semargl]

Тунец, у Вас на дереве образуются рубра с ложным разрешением (нулевой длины). Это происходит из-за того, что ТНТ по умолчанию представляет дерево в бинарном виде. Для того, чтобы избежать этого и отразить реальную полифилию ветвей, Вам стоит установить в выпадающем окне поиска опцию "Сollapse trees after search".
 
Дерево станет более реалистичным.

Спасибо за совет.

[Yurgan]

Еще забыл добавить.
DYS640 = 12 встречается только в двух ветвях - староскандинавской и арабской.
Если сходство со староскандинавской можно списать на гомоплазию, то у арабов это могу быть две ветви одного кластера, пришедшие к арабам в разное время.

[Yurgan]

Интересно, а династия аль-Тани тоже R1a1?

The Al Thani (Arabic: آل ثاني‎) family is the royal family of Qatar whose origins can be traced back to Banu Tamim. The Al Thani family has been ruling Qatar since 1825.

List of Hakims and Emirs:

    * Sheikh Thani bin Mohammed, Hakim of Qatar (1825–1850)
    * Sheikh Mohammed bin Thani, Hakim of Qatar (1850–1878)
    * Sheikh Jassim bin Mohammed Al Thani, Emir of Qatar (1878–1913)
    * Sheikh Abdullah bin Jasssim Al Thani, Emir of Qatar (1914–1945)
    * Shiekh Hamad bin Abdullah Al Thani, Emir of Qatar (1945–1946)
    * Sheikh Ali bin Abdullah Al Thani, Emir of Qatar (1949–1960)
    * Sheikh Ahmad bin Ali Al Thani, Emir of Qatar (1960–1972)
    * Sheikh Khalifa bin Hamad Al Thani, Emir (1972–1995)
    * Sheikh Hamad bin Khalifa Al Thani, present Emir of Qatar Since 1995.


А основатель ваххабизма?

Saudi Tamimi tribes

Al-AlShaikh - the house of Muhammad ibn 'Abd al-Wahhāb (d. 1792 C.E.); lives mostly in Riyadh, originally from Uyainah.