Semargl.me: он-лайн сервис для анализа данных по Y-ДНК

[AlexanderK]

что то у меня апгрейд У37>У67 в Семаргле никак не отобразится   B105570, есть в проектах Azerbaijan и Armenian DNA

[kirroid]

Attempt to get a DNS server for semargl.me failed: Timed out   
Прошу починить.

[Semargl]

Attempt to get a DNS server for semargl.me failed: Timed out   
Прошу починить.

Крупная авария у провайдера, обещали починить в течении дня.

[rLin]

Semargl, я не то, чтобы желающий (просто не знаю, насколько это для меня сложно) по портированию карты на OpenLayers, но можно узнать какие-нибудь подробности по формату входных данных для карты и запросам к серверу для получения этих данных? Если будет возможность - хочу попробовать, вдруг получится.

[Semargl]

Semargl, я не то, чтобы желающий (просто не знаю, насколько это для меня сложно) по портированию карты на OpenLayers, но можно узнать какие-нибудь подробности по формату входных данных для карты и запросам к серверу для получения этих данных? Если будет возможность - хочу попробовать, вдруг получится.

Сначала опишу как было раньше. На странице, справа от карты был вертикальный список всех субкладов с чекбоксами. При выборе чекбокса идет AJAX запрос на сервер и полученный ответ (обычно это словарь координат, но можно любой массив) подгружается на карту в виде фишек определенного цвета. При снятии чекбокса эти данные удаляются с карты. Таким образом можно компоновать на одной карте несколько разных ветвей. Возможны и другие варианты с дополнительным функционалом, но основное взаимодействие карты с БД идет посредством AJAX, где в ответ на запрос приходит массив данных с координатами и другой доп информацией.

[AlexanderK]

Вопрос: А если сделан всего лишь Y12 (или Y27 или Y37) и сразу после этого BigY - то попадут ли все соответствующие STR-маркёры в Semargl, то есть станет ли тест там соответствующим Y111 ? То что в BigY могут не считаться все "правильные" (то есть соответствующие Y111) маркеры - читал на форуме. Но интересна и чисто техническая сторона дела, каким образом можно перенести STR-маркеры из BigY в Семаргл?

[Semargl]

каким образом можно перенести STR-маркеры из BigY в Семаргл?

Обратиться в соответствующем разделе форума к администратору. Я думаю внесут без проблем.

[AlexanderK]

каким образом можно перенести STR-маркеры из BigY в Семаргл?

Обратиться в соответствующем разделе форума к администратору. Я думаю внесут без проблем.

А где мне их взять чтобы передать администратору соответствующего раздела? Все эти дополнительные STR- маркеры, которые мне BigY посчитает?

[Daemon2017]

каким образом можно перенести STR-маркеры из BigY в Семаргл?

Обратиться в соответствующем разделе форума к администратору. Я думаю внесут без проблем.

А где мне их взять чтобы передать администратору соответствующего раздела? Все эти дополнительные STR- маркеры, которые мне BigY посчитает?

Залить на yfull, дождаться обработки, заплатить 49$

[Виталий77]

каким образом можно перенести STR-маркеры из BigY в Семаргл?

Обратиться в соответствующем разделе форума к администратору. Я думаю внесут без проблем.

А где мне их взять чтобы передать администратору соответствующего раздела? Все эти дополнительные STR- маркеры, которые мне BigY посчитает?

Получаете ссылку от ФТДНА, регистрируетесь на УФулл, указав ссылку на файл. Команда УФулл скачивает файл, обрабатывет его и после оплаты 49$ сначало становятся доступны Снипы (Вы размещаетесь на дереве снипов), чуть позднее (месяца через 1,5-2) будут готовы результаты СТРов.

[AlexanderK]

А где мне их взять чтобы передать администратору соответствующего раздела? Все эти дополнительные STR- маркеры, которые мне BigY посчитает?

Залить на yfull, дождаться обработки, заплатить 49$

Ну это слишком простое решение ). А есть какое-нибудь посложнее но бесплатно? )))

[Semargl]

Ну это слишком простое решение ). А есть какое-нибудь посложнее

1) Найти в разных публикациях описание и позиции STR маркеров.
2) Установить хромосомный браузер для просмотра BAM'ов и несколько других утилит
3) Попробовать посчитать повторы STR маркеров вручную, проанализировав правильно отмаппированные риды и откинув "левые" риды.

[AlexanderK]

Ну это слишком простое решение ). А есть какое-нибудь посложнее

1) Найти в разных публикациях описание и позиции STR маркеров.
2) Установить хромосомный браузер для просмотра BAM'ов и несколько других утилит
3) Попробовать посчитать повторы STR маркеров вручную, проанализировав правильно отмаппированные риды и откинув "левые" риды.

Меня собственно интересует всего 111 маркёров входящих  в FTDNA Y111. Прикинул ччто дешевле всего мне выходит делать Y12 - и сразу после этого  BigY (снипы по сути тоже бесполезная трата денег). Но тогда у моих китов в Семаргле будет только 12 STR маркеров и они будут бесполезны для пользователей.

[Daemon2017]

Ну это слишком простое решение ). А есть какое-нибудь посложнее

1) Найти в разных публикациях описание и позиции STR маркеров.
2) Установить хромосомный браузер для просмотра BAM'ов и несколько других утилит
3) Попробовать посчитать повторы STR маркеров вручную, проанализировав правильно отмаппированные риды и откинув "левые" риды.

Меня собственно интересует всего 111 маркёров входящих  в FTDNA Y111. Прикинул ччто дешевле всего мне выходит делать Y12 - и сразу после этого  BigY (снипы по сути тоже бесполезная трата денег). Но тогда у моих китов в Семаргле будет только 12 STR маркеров и они будут бесполезны для пользователей.

Если я не ошибаюсь, можно написать в техподдержку и попросить выставить Вам заказ на БигМак. И не надо переплачивать за 12 маркеров)

[AlexanderK]

Меня собственно интересует всего 111 маркёров входящих  в FTDNA Y111. Прикинул ччто дешевле всего мне выходит делать Y12 - и сразу после этого  BigY (снипы по сути тоже бесполезная трата денег). Но тогда у моих китов в Семаргле будет только 12 STR маркеров и они будут бесполезны для пользователей.

Если я не ошибаюсь, можно написать в техподдержку и попросить выставить Вам заказ на БигМак. И не надо переплачивать за 12 маркеров)

Логично. Тем более у меня есть их пустые киты. Но у меня ещё и задача чтобы с данными моего Бига  могли полноценно сравниваться пользователи Семаргла у которых сделаны 37-67-111 маркёров