Использовать модал при построениях не совсем правильно, вернее совсем не правильно. Здесь мы упираемся в недостаток репрезентативноности. Некоторые семейные проекты, по причине бОльшего числа протестированных, перетягивают модал на себя. Ради эксперимента, попробуйте поменять хоть одно значение СТР в модале, и посмотрите что из этого выйдет на графе.
В этом случае лучше брать аутгрупп гаплотип.
Совершенно с Вами не согласен.
Озвученная Вами проблема характерна не только для построения по модалу, но и для всех прочих видов построений.
Точно также выборкозависимое построение и по среднекй точке, и по аутгрупп гаплотипу.
Наиболее методически верным является построение по средней точке. Но оно требует подготовки для восприятия и занимает больше времени на отработку (при большом количестве гаплотипов - это ощутимо).
Модал субклада в идеале (часто нереализуемом даже теоретически) стремится к предковому гаплотипу. Да, и интуитивно понятнее (особенно для новичков).
*** По поводу замены одного значения. Человек опытный понимает, что имеет место многовариантность построений. При сотне вариантов вероятностный разброс не велик. Ещё сотни возможностей просто не озвучены.
Иными словами, что при попарных сравнениях имеем огромный разброс значений. Что при филогенетическом построении. Какая-то веточка (набор гаплотипов) повторилась тройку-пяток раз, вот уже и говорим об устойчивом кластере.
Ну, а для новичка можно взять первый предложенный вариант, присовокупив,
а возможно всё было вот так.
Резюмирую: построение по модалу (особенно по модалу субклада) - можно сказать, самый распространённый и вполне оправданный метод построений.
Тема: Semargl.me: он-лайн сервис для анализа данных по Y-ДНК (Прочитано 165517 раз)