Semargl.me: он-лайн сервис для анализа данных по Y-ДНК

[mouglley]

Как предложение:
Может расположить гаплогруппы в соответствии с деревом снипов? Кучками?
Типа:
C -> F -> MNOPS -> P  -> R -> R1 -> R1a
C -> F -> MNOPS -> NO  -> N

А то структуры не видно?

[Semargl]

Как предложение:
Может расположить гаплогруппы в соответствии с деревом снипов? Кучками?
Типа:
C -> F -> MNOPS -> P  -> R -> R1 -> R1a
C -> F -> MNOPS -> NO  -> N

А то структуры не видно?

Это про страницу со снипами?
Если да, то сделать иерархию, для меня, будет накладно по ресурсам.
Единственно, хочу сделать скрытие ненужных снипов. Те для пользователя будет выведен только список гаплогрупп, при нажатии на который будут показаны снипы конкретной гаплогруппы.

[Шад]

Все будеть номально - завтра сделаю возможность выборок из базы, по вашим условиям.
Те будет возможен запрос: "показать все DYS388 = 10 и DYS666 = 23"

Это было бы здорово... Так как текущая кластеризация многих гаплогрупп строится не только на открытых снипах, но и на предполагаемых по филогении и характерным значениям STR-маркеров. А для этих целей такая выборка была бы очень полезна.

[mouglley]

Это про страницу со снипами?
Если да, то сделать иерархию, для меня, будет накладно по ресурсам.
Единственно, хочу сделать скрытие ненужных снипов. Те для пользователя будет выведен только список гаплогрупп, при нажатии на который будут показаны снипы конкретной гаплогруппы.

Неплохо!
Хотя, перечень гаплогрупп в порядке дерева (а не в произвольном порядке) тоже неплохо поможет в поимке своих снипов.

В крайнем случае - перечень гаплогрупп в алфавитном порядке.

Это я подвожу к тому, что скоро подкину Вам снипы для O, но и, чисто, для NO!
Куда их засуните?
Понял. Туда - не надо.

[Semargl]

Это я подвожу к тому, что скоро подкину Вам снипы для O, но и, чисто, для NO!
Куда их засуните?

Пример? Сейчас посмотрю
Ввел все снипы для NO и для N
Проблем особо не обнаружил, правда плачет по мне Оккама со своей бритвой )
Насчет иерархии списка снипов, попробую продумать, но обещаний нет.

[mouglley]

Пример? Сейчас посмотрю

Прошу прощения, сейчас не при базе.
Точно не скажу.

Предварительно (без базы) набегают снипы, общие для NO:
L16, L74, M89, SRY10831

[Semargl]

Пример? Сейчас посмотрю

Прошу прощения, сейчас не при базе.
Точно не скажу.

Предварительно (без базы) набегают снипы, общие для NO:
L16, L74, M89, SRY10831

L16 - снип для IJK
для NO ввел:M214,P188,P192,P193,P194,P195
для N: M231

То есть, проблем в добавлении надгрупп для снипов нет, единственно список будет "разбухать". Но когда сделаю сортировку по названию, и автоматическое скрытие списков, то проблем, думаю, не будет

[mouglley]

для NO ввел:M214,P188,P192,P193,P194,P195
для N: M231

То есть, проблем в добавлении надгрупп для снипов нет, единственно список будет "разбухать". Но когда сделаю сортировку по названию, и автоматическое скрытие списков, то проблем, думаю, не будет

А мою подпись не видели?
P188- (23andMe)
Всяко бывает.
В WTY этот снип не тестируют.

[mouglley]

для NO ввел:M214,P188,P192,P193,P194,P195
 для N: M231
 
 То есть, проблем в добавлении надгрупп для снипов нет, единственно  список будет "разбухать". Но когда сделаю сортировку по названию, и  автоматическое скрытие списков, то проблем, думаю, не будет

А мою подпись не видели?
 P188- (23andMe), как и у все тестированных там N.
 Всяко бывает.
 В WTY этот снип не тестируют.

[Semargl]

А мою подпись не видели?
P188- (23andMe)
Всяко бывает.
В WTY этот снип не тестируют.

Да уж. Всяко бывает Добавил Вам этот снип в минус.
Не знаком, подробно, с проблематикой группы N, но как такое возможно?
А вы, имея учетную запись, могли бы исправить координаты и прочее?
Персональная ссылка для Вас

[mouglley]

А мою подпись не видели?
P188- (23andMe)
Всяко бывает.
В WTY этот снип не тестируют.

Да уж. Всяко бывает Добавил Вам этот снип в минус.
Не знаком, подробно, с проблематикой группы N, но как такое возможно?

Думаю, это - проблема не ДНК-генеалогии. Каждый N в 23andMe P188-.
То есть, сотни.

Вариант нумбер уан: неправильное разделение учёными на стадии изучения гаплогруппы NO,
То есть, P188 находится под NO, но относится к гаплогруппе O.

Вариант нумбер ту: неправильная работа (за наши деньги) 23andMe.

Оба случая - профессиональная некомпетентность специалистов-генетиков, то есть, не наш случай.

[Semargl]

Все будеть номально - завтра сделаю возможность выборок из базы, по вашим условиям.
Те будет возможен запрос: "показать все DYS388 = 10 и DYS666 = 23"

Это было бы здорово... Так как текущая кластеризация многих гаплогрупп строится не только на открытых снипах, но и на предполагаемых по филогении и характерным значениям STR-маркеров. А для этих целей такая выборка была бы очень полезна.

Пока задачка откладывается. На недельку-две.

Это тестовый режим! Просьба ссылки пока не распространять. URL карт может еще измениться.

Приложение "устаканилось". Адреса останутся прежними. Будут только "косметические" улучшения.  Ссылки можно распространять.

[mouglley]

Уважаемый Тунец, ответьте пожалуйста:
http://dna-forums.org/index.php?/topic/16821-google-maps-of-snps-distribution/page__view__findpost__p__287705

Я там 5 тем создал по Вашему приложению: E, I, J, N, R.

[Аббат Бузони]

Уважаемый Тунец, ответьте пожалуйста:
http://dna-forums.org/index.php?/topic/16821-google-maps-of-snps-distribution/page__view__findpost__p__287705

Я там 5 тем создал по Вашему приложению: E, I, J, N, R.

Зря, еще не все готово, зачем сырой материал показывать (по I по-крайней мере)?

[Аббат Бузони]

Good work, however on the I2 map (and some others) the American pins fall somewhere in Cental Asia. Maybe the East/West Longitude is mixed up.

А такое действительно есть. Так что...