АвторТема: Interpretome: online genome analysis  (Прочитано 18740 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Clavis

  • Семенов Михаил Юрьевич
  • Сообщений: 1495
  • Страна: ru
  • Рейтинг +111/-0
    • https://m.vk.com/@clavis1953
  • Y-ДНК: G2a2 L1264
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #30 : 25 Июнь 2011, 23:45:16 »
ASW-Азия юго-западная? Странная картинка. Северо-восточную Азию у нас уже находили, коми и финны в родне есть, а вот юго-западную Азию трудно ожидать...

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #31 : 25 Июнь 2011, 23:52:35 »
ASW-Азия юго-западная? Странная картинка. Северо-восточную Азию у нас уже находили, коми и финны в родне есть, а вот юго-западную Азию трудно ожидать...

Нет.

ASW=African ancestry in Southwest USA

По-русски, афроамериканцы.

http://www.sanger.ac.uk/resources/downloads/human/hapmap3.html

Оффлайн Clavis

  • Семенов Михаил Юрьевич
  • Сообщений: 1495
  • Страна: ru
  • Рейтинг +111/-0
    • https://m.vk.com/@clavis1953
  • Y-ДНК: G2a2 L1264
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #32 : 26 Июнь 2011, 00:35:51 »
ASW-Азия юго-западная? Странная картинка. Северо-восточную Азию у нас уже находили, коми и финны в родне есть, а вот юго-западную Азию трудно ожидать...

Нет.

ASW=African ancestry in Southwest USA

По-русски, афроамериканцы.

http://www.sanger.ac.uk/resources/downloads/human/hapmap3.html
Вот моей теще только дяди Тома в числе предков нехватало! Видимо программа расчитана на RF  а я ей скормил файл от FF вот и начались чудеса..

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1380/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #33 : 26 Июнь 2011, 09:37:23 »
Вот моей теще только дяди Тома в числе предков нехватало!

порадуете тещу  ;D

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #34 : 26 Июнь 2011, 13:13:07 »
Вот моей теще только дяди Тома в числе предков нехватало!

порадуете тещу  ;D

Вспомнился соетский фильм "Цирк" (1936)

Цитировать
В итоге Мэрион и её маленький чернокожий сын находят в СССР свою новую Родину и любовь.

http://www.youtube.com/watch?v=FYUqQRkdMG8

Оффлайн Clavis

  • Семенов Михаил Юрьевич
  • Сообщений: 1495
  • Страна: ru
  • Рейтинг +111/-0
    • https://m.vk.com/@clavis1953
  • Y-ДНК: G2a2 L1264
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #35 : 26 Июнь 2011, 14:09:37 »
Если перенести сюжет фильма "Цирк" в уральскую деревню 19 века, получится ненаучная фантастика. Кроме того, этнопопуляционная программа FTDNA не нашла у нее африканского компонента, зато нашла 5% восточноазиатского, чему можно верить.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #36 : 26 Июнь 2011, 17:34:09 »
Если перенести сюжет фильма "Цирк" в уральскую деревню 19 века, получится ненаучная фантастика. Кроме того, этнопопуляционная программа FTDNA не нашла у нее африканского компонента, зато нашла 5% восточноазиатского, чему можно верить.

Какие настройки Вы использовали в Interpretome?
При определенных настройках, сегменты африканского происхождения показываются у всех европейцев.

Оффлайн Clavis

  • Семенов Михаил Юрьевич
  • Сообщений: 1495
  • Страна: ru
  • Рейтинг +111/-0
    • https://m.vk.com/@clavis1953
  • Y-ДНК: G2a2 L1264
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #37 : 26 Июнь 2011, 17:39:52 »
Честно говоря, использовал то что было по умолчанию, а когда пытался поиграть с меню, ничего принципиально не изменилось.

Оффлайн OlegIV

  • Сообщений: 24
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: N1c1
  • мтДНК: K1a12a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #38 : 12 Октябрь 2011, 16:56:11 »
Неандерталь - 13  :)


Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 422
  • Страна: us
  • Рейтинг +26/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #39 : 07 Сентябрь 2012, 04:57:53 »
Неандерталь - 10  :o
« Последнее редактирование: 07 Сентябрь 2012, 22:35:49 от Jonik »

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 422
  • Страна: us
  • Рейтинг +26/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #40 : 07 Сентябрь 2012, 05:25:44 »
PC1/PC4 (43,000 & 74,000)
« Последнее редактирование: 07 Сентябрь 2012, 06:23:52 от Jonik »

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 422
  • Страна: us
  • Рейтинг +26/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #41 : 07 Сентябрь 2012, 06:21:28 »
HapMap2
(CEU (vzyato oboznachenie from HapMap3) - Utah residents with Northern and Western European ancestry from the CEPH collection)

HapMap3
(TSI - Toscani in Italia; MEX - ?)   

« Последнее редактирование: 07 Сентябрь 2012, 06:30:04 от Jonik »

Оффлайн wbull

  • Сообщений: 444
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
    • Rickman Surname Project
  • Y-ДНК: E1b1b1a1, Cluster : E-L618* , Geno 2.0: E-CTC10912
  • мтДНК: U5a1g
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #42 : 05 Октябрь 2012, 15:23:33 »
Подскажите пожалуйста, как правильно конвертировать FF в RF для Interpretome.
FF состоит из двух файлов, а RF, как я понимаю, из одного. Конвертировать только аутосомный файл или надо как то его соединить с Х файлом?   

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #43 : 05 Октябрь 2012, 20:00:51 »
Что-то упорно меня к немцам тянет :-\


Зато в Paint my Chromosome третьей версии (вторая ничего принципиально отличного от картинок 23иЯ и Макдональда не дает) такую красоту получил:

« Последнее редактирование: 05 Октябрь 2012, 20:49:31 от Alex AXe »

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 422
  • Страна: us
  • Рейтинг +26/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: Interpretome: online genome analysis
« Ответ #44 : 05 Октябрь 2012, 23:03:05 »
Подскажите пожалуйста, как правильно конвертировать FF в RF для Interpretome.
FF состоит из двух файлов, а RF, как я понимаю, из одного. Конвертировать только аутосомный файл или надо как то его соединить с Х файлом?
Naskol'ko pomnyu - autosomnij - snachala razarhivirovat' a uzhe potom vstavit' razorhivirovannij v konvektor.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.