АвторТема: Генетические маркеры и заболевания  (Прочитано 17203 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #15 : 08 Июнь 2011, 12:30:56 »
Цитировать
Конечно, гены и маркеры это одно и тоже.
нет не одно

маркер это чаще всего просто однонуклеотидная замена (СНП), бывают маркеры и STR, конечно
а ген - это большой кусок генетического кода

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #16 : 08 Июнь 2011, 13:02:26 »
Можно ли из определенного набора тестов FTDNA (например из raw data FF, mtFGS) получить ту же информацию о здоровье и наследственности, что дает тестирование в 23 &Me?

Оффлайн dima75

  • Сообщений: 592
  • Страна: il
  • Рейтинг +122/-1
    • Tartakovsky surname project
  • Y-ДНК: E1b1b1-PF1975 (E-Z830-A)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #17 : 08 Июнь 2011, 13:03:59 »
Можно ли из определенного набора тестов FTDNA (например из raw data FF, mtFGS) получить ту же информацию о здоровье и наследственности, что дает тестирование в 23 &Me?
Нет. Частично совпадают только генеалогические тесты.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #18 : 08 Июнь 2011, 13:47:42 »
Цитировать
Конечно, гены и маркеры это одно и тоже.
нет не одно

маркер это чаще всего просто однонуклеотидная замена (СНП), бывают маркеры и STR, конечно
а ген - это большой кусок генетического кода

Не совсем так.
Ген -это несколько условное понятие, в отличие от маркера, который всегда конкретен. Ведь ген - структурная и функциональная единица наследственности, контролирующая развитие определенного признака или свойства, а генетический маркер - участок ДНК с известной локализацией.

Долгое время, до начала эры молекулярного анализа ДНК считалось, ЧТО материальным носителем генетических признаков (т.е конкретных генов) являются белки, а не нуклеотиды (позже эта точка зрения была опровегнута).

Цитировать
Эти трудности преодолеваются благодаря наличию непрямых (косвенных) методов молекулярной диагностики. Этот исторически более ранний подход основан на использовании сцепленных с геном полиморфных маркеров, с помощью которых проводится идентификация мутантных хромосом (точнее хромосом, несущих мутантный ген) в семьях высокого риска, т. е. у родителей больного и его ближайших родственников. Косвенные методы молекулярной диагностики принципиально возможны практически для всех моногенных заболеваний с известной локализацией контролирующего гена, для каждого из которых разработана удобная система вне- и внутригенных полиморфных индексных маркеров.


Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #19 : 08 Июнь 2011, 13:53:07 »
Можно ли из определенного набора тестов FTDNA (например из raw data FF, mtFGS) получить ту же информацию о здоровье и наследственности, что дает тестирование в 23 &Me?

Из FF Rawdata - можно, если привести FF rawdata к тому же виду, что и 23andme rawdata.
Загрузите себе программу Prometheasa или Enlis Genomics
http://www.enlis.com/

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #20 : 08 Июнь 2011, 15:09:11 »
Можно ли из определенного набора тестов FTDNA (например из raw data FF, mtFGS) получить ту же информацию о здоровье и наследственности, что дает тестирование в 23 &Me?

Из FF Rawdata - можно, если привести FF rawdata к тому же виду, что и 23andme rawdata.
Загрузите себе программу Prometheasa или Enlis Genomics
http://www.enlis.com/

А данные по мито-ДНК играют роль в анализе 23&Me?
На форуме, в частности, обсуждался вопрос о медицинских рисках по митогруппе J: http://forum.molgen.org/index.php/topic,558.0.html
Я сравнил позиции - их можно получить при полном сиквенсе (FGS).

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #21 : 08 Июнь 2011, 15:09:57 »
Насколько я помню, - нет.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #22 : 08 Июнь 2011, 16:47:13 »
Цитировать
Ген -это несколько условное понятие, в отличие от маркера, который всегда конкретен.
Ген - точно не условное понятие. А маркер, правда,
Цитировать
всегда конкретен
. Думаю, что в данном случае понятие маркер и гена совпадают. Обычно мутантный ген (с мутациями в разных позициях) свидетельствует о заболевании. Что в 23andme подразумевают под маркерами, не знаю. Из общих соображений, мутантный ген.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #23 : 08 Июнь 2011, 17:14:40 »
Нет, не так.

Напомню опеределение  гена. Ген —эта структурная и функциональная единица наследственности, контролирующая развитие определенного признака или свойства.
Т.е это по своей сути это понятие привязно к определенному наследственному признаку.

Википедия

Цитировать
Изначально термин ген появился как теоретическая единица передачи дискретной наследственной информации. История биологии помнит споры о том, какие молекулы могут являться носителями наследственной информации. Большинство исследователей считали, что такими носителями могут быть только белки, так как их строение (20 аминокислот) позволяет создать больше вариантов, чем строение ДНК, которое составлено всего из четырёх видов нуклеотидов. Позже было экспериментально доказано, что именно ДНК включает в себя наследственную информацию, что было выражено в виде центральной догмы молекулярной биологии.

В то время, как маркеры всегда конкретные - начиная с классических белковых маркеров, и заканчивая более привычными для уха генетического генеалога маркерами типа SNP, CNV(делеции,дупликации, инсерции), STR. Под конкретностью я подразумеваю то, что известно из физическое положение и положение на генетической карте (сM).  Именно по положению этих макеров и определяется положение гена в геноме (т.е сначала определяются полиморфзмы маркеров, затем определяются аллели, ассоциированные с тем или иным заболеванием и только после этого говорят о дефектном гене). Само понятие "дефектный ген" указывает, что внутри гена или среди сцепленных с геном маркеров имеется полиформизм, ассоциированный с заболеванием.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #24 : 08 Июнь 2011, 22:54:36 »
   
Цитировать
История биологии помнит споры о том, какие молекулы могут являться носителями наследственной информации
....
Что об этом вспоминать. Структура ДНК открыта в 1953 г.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #25 : 08 Июнь 2011, 22:59:27 »
Это к тому, что как видите, понятие гена -рудимент домолекулярной эпохи.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #26 : 08 Июнь 2011, 23:13:05 »
Не соглашусь.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #27 : 08 Июнь 2011, 23:20:34 »
Можно ли из определенного набора тестов FTDNA (например из raw data FF, mtFGS) получить ту же информацию о здоровье и наследственности, что дает тестирование в 23 &Me?

Из FF Rawdata - можно, если привести FF rawdata к тому же виду, что и 23andme rawdata.
Загрузите себе программу Prometheasa или Enlis Genomics
http://www.enlis.com/

Установил Enlis Genome Personal Edition, но программа импортирует только 23andme rawdata. Есть ли конвертор для FF rawdata?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #28 : 09 Июнь 2011, 09:28:40 »
Не соглашусь.

Прошу прощения, Вы, как я понимаю, имеете какое-то отношение к мед.генетике или биологии?

Оффлайн mladshij

  • Сообщений: 801
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-0
  • Darth Vader
  • Y-ДНК: R1a-Z92 -> YP569 -> Y85137
  • мтДНК: H1
Re: Генетические маркеры и заболевания
« Ответ #29 : 09 Июнь 2011, 10:22:06 »
Установил Enlis Genome Personal Edition, но программа импортирует только 23andme rawdata.

Глючная она. Я ею пробовал поиграться. Кончилось тем, что она просто перестала свои же данные видеть.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.