АвторТема: Коррекция дерева J2a  (Прочитано 31269 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #30 : 07 Апрель 2013, 21:46:39 »

Наши новые результаты. Стараниями Алфреда Абурто протестирован 1 из 3х существующих в проекте гаплотипов L24 (без L25, как у всех остальных). Это позволило разнести снипы группы L24 от L25.
Кроме того, субклад L363, который ранее был субкладом L25, теперь находится под F3113  F761. Этот гаплотип из Саудовской Аравии, L363 найден в результате WTY.  Информация о человеке приватная. В переписке с Абурто сообщил, что тестировал на этот снип членов своего племени и 45 человек были найдены как L363+.
« Последнее редактирование: 07 Апрель 2013, 22:28:34 от Людмила »

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #31 : 08 Апрель 2013, 13:10:35 »
Людмила, спасибо за информацию. У меня есть несколько замечаний, скорее не к Вам, а к FTDNA по поводу непрекращающегося искажения или неадекватного отражения результатов тестов.
Кит 671 сделал WTY года три назад, по итогом которого нашли L254 (маркирующий его веточку) и M365.2 (его личный). После Гено 2.0 он "вдруг" стал M365.2-. Можно либо проигнорировать это изменение и сместить 671 ниже по стрелке M365.2, либо убрать M365.2 вообще с Вашей схемы. CTS1489 безсистемно встречается в разных гаплогруппах, включая разные ветви J2 и J1, имеет ли смысл считать его достаточно надежным для включения в дерево? То же самое в отношении F3515. Кроме этого, N32862 и N67066 относятся к одной ветви - между ними 4 мутации. К сожалению, снип, маркирующий эту веточку, пока не найден, но IMHO лучше показать их рядом.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #32 : 08 Апрель 2013, 20:58:56 »
JaG, спасибо большое за критику, это всегда полезно, когда кто-то свежим взглядом и с багажом своих знаний может придирчиво взглянуть на предмет. Будем разбираться, все решаемо, надо обсуждать.
Относительно того, что №671 стал М365.2- после GENO 2.0 Вы правильно заметили. Как это произошло, не очень понятно. Теперь в снипах у него стоит- минус, хотя этого снипа нет в перечне GENO 2.0 (поправьте, если не так). Произошла какая-то ошибка в записи данных в FT.
Относительно стабильности снипов сказать все-таки трудно. То, что встречаются одни и те же снипы в разных ветвях - такое возможно. Кто знает, насколько стабилен такой снип в каждой ветке?
Относительно N32862 и N67066  - показать-то рядом я их могу (это ничему не будет противоречить), Но они разных субкладов (если не отбрасывать данные по F3515).

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #33 : 09 Апрель 2013, 10:05:31 »
Нужно точно знать, что у N32862 в raw data для F3515 : "С" или "-"(no-call).

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #34 : 09 Апрель 2013, 12:44:02 »
Черновик SNP-дерева М67

Сделан только по открытым данным, без доступа к raw data.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #35 : 09 Апрель 2013, 14:04:56 »
Черновик SNP-дерева М67

Сделан только по открытым данным, без доступа к raw data.
Есть кто-то из  Cluster B который протестировался на Z467?
J2a3b, Cluster B, one member so far P36+

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #36 : 09 Апрель 2013, 15:08:22 »
Думаю, что та группа, которая в J-проекте называется "кластер В", вообще не составляет кластер. Все 3 известных Р36.3+ происходят из анабаптистов-меннонитов. У N10519 нашли Р36+ по результатам 23andme, позже 223789 тестировался в FTDNA, а теперь появились результаты Гено 2.0 для 270808: Z467+, Р36+.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #37 : 09 Апрель 2013, 15:31:25 »
 спасибо!

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #38 : 09 Апрель 2013, 15:34:02 »
Цитировать
Нужно точно знать, что у N32862 в raw data для F3515 : "С" или "-"(no-call).

C.

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #39 : 09 Апрель 2013, 18:01:29 »
Цитировать
Нужно точно знать, что у N32862 в raw data для F3515 : "С" или "-"(no-call).

C.
Увы  :(  Боюсь, что останется N67066 с этим снипом в одиночестве.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #40 : 10 Апрель 2013, 22:57:04 »

JaG, исправила М365+ у №671, поставила поближе друг к другу 2 других гаплотипа.
В L70 добавился новый участник (N89531 из Jewish Prague project). Даю Рис. без фамилий, но здесь хочется поделиться - Botvinik, Belarus. Может быть, это потомок нашего чемпиона?

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #41 : 10 Апрель 2013, 23:38:47 »
Цитировать
204221 ... L236+ ...

А слона то я и не заметил.  ;D

204221, а также его родственнику 209115, делали WTY. Нет у них L236+.

Не знаю, получал ли Томас мои сообщения по поводу L236, читал ли их, но в Гено 2.0 зачем-то его включил  ???

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #42 : 11 Апрель 2013, 07:28:20 »
JaG Спасибо. Тоже доведу до сведения Абурто и Томаса.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #43 : 11 Апрель 2013, 07:52:06 »
Абурто тут же ответил -
Kit 204221 не тестировал L236 в WTY.  L236 тестировали в GENO и кит 204221 найден как L236+ .

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #44 : 11 Апрель 2013, 10:43:15 »
Kit 204221 тестировал участок, где находится L236 в WTY. Если он L236+, то это упущение при анализе хроматограммы.

L236 нашли у меня в raw-data 23andme. Я заказал его в FTDNA и получил L236-. Гено 2.0 делается по чип-технологии Иллюмины, также как и тест 23andme. Чем он надежнее?

Снип, который сумел укрыться от десятков WTY, дождался своего звездного часа:
37488 R1a ... L236+ ...
233653 R1b ... L236+ ...

to be continued...
« Последнее редактирование: 11 Апрель 2013, 11:57:04 от JaG »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.