АвторТема: Гаплогруппа С  (Прочитано 19475 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн NMTАвтор темы

  • Сообщений: 70
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: I2a1b
  • мтДНК: C5c1a
Гаплогруппа С
« : 14 Май 2011, 14:06:00 »
Получил результат от National Genographic Project, определен как Haplogroup С
HVR1:16093C, 16223T, 16234T, 16288C, 16298C, 16327T, 16518T, 16519C, 16527T
Эта гаплогруппа так редка, что соответствующей темы нет на форуме?

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2049
  • Рейтинг +508/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #1 : 14 Май 2011, 14:25:24 »
Получил результат от National Genographic Project, определен как Haplogroup С
HVR1:16093C, 16223T, 16234T, 16288C, 16298C, 16327T, 16518T, 16519C, 16527T
Эта гаплогруппа так редка, что соответствующей темы нет на форуме?
Среди европейцев действительно встречается редко. В Северо-Восточной Азии - самая обычная гаплогруппа. У якутов - около 45 %, у эвенков - еще выше. Рекомендую книгу Деренко и Малярчука "Молекулярная филогеография населения Северной Евразии по данным об изменчивости митохондриальной ДНК" (2010).

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2049
  • Рейтинг +508/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #2 : 14 Май 2011, 14:30:24 »
Из книги Деренко и Малярчука. Частота гаплогруппы С4 у русского населения европейской части России 0.41 %. Других субкладов гаплогруппы С не выявлено.

Оффлайн NMTАвтор темы

  • Сообщений: 70
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: I2a1b
  • мтДНК: C5c1a
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #3 : 14 Май 2011, 14:30:51 »
Считаю, надо тему поднять вверх по причине возможного огромного кол-ва С представителей на территории СНГ, вспомним про татар... Тема будет востребована.
Я как чайник даже не могу сразу вот так сформулировать вопросы, какие меня могут интересовать, пока присматриваюсь, читаю знающих уважаемых профессионалов в этом деле.
За наколку про книгу спс!

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #4 : 14 Май 2011, 14:31:35 »
Получил результат от National Genographic Project, определен как Haplogroup С
HVR1:16093C, 16223T, 16234T, 16288C, 16298C, 16327T, 16518T, 16519C, 16527T
Эта гаплогруппа так редка, что соответствующей темы нет на форуме?

Добрый день! Это "славянский" вариант восточноазиатской гаплогруппы C5. В Азии, откуда он в конечном счете вышел, он крайне редок, зато встречается в малых частотах в Восточной Европе. Есть вполне обоснованная теория, что в Европу линия проникла раньше эпохи великого переселения, то есть не с тюркскими миграциями.

См. наше дерево

http://mtdna.gentis.ru/tx/hg/M/tx_M8C5b1_328214.htm#

и отсюда все нижележащие ветви ("Child taxa").


Оффлайн NMTАвтор темы

  • Сообщений: 70
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: I2a1b
  • мтДНК: C5c1a
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #5 : 14 Май 2011, 14:41:16 »
Может подскажете где почитать про идентификацию например как у меня С и M8C5b1_328214? Я так понял это представление одного и того же в разных "классификаторах"?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #6 : 14 Май 2011, 14:46:36 »
Из книги Деренко и Малярчука. Частота гаплогруппы С4 у русского населения европейской части России 0.41 %. Других субкладов гаплогруппы С не выявлено.

В выборках Малярчука и Деренко такой вариант есть только у поляков. Но у других авторов, в том числе в неопубликованных выборках, он найден и у русских. Также известен у украинцев и белорусов. Максимума частота достигает у поляков - 5/996. У русских 3/3300.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #7 : 14 Май 2011, 14:48:31 »
Может подскажете где почитать про идентификацию например как у меня С и M8C5b1_328214? Я так понял это представление одного и того же в разных "классификаторах"?

число - это просто ID образца в нашей базе. не обращайте внимания на него. Ваша гаплогруппа - C5b1, можете указать ее в профиле. В нашей базе C называется M8C, потому что это ветвь гаплогруппы M8.

Оффлайн NMTАвтор темы

  • Сообщений: 70
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: I2a1b
  • мтДНК: C5c1a
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #8 : 14 Май 2011, 14:53:08 »
вот это ответ по полочкам! спасибо уважаемый, буду дальше копать, может посоветуете, для уточнения, так скажем, картины надо ли заказать доп. исследование HVR2 и др. и что надо?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #9 : 14 Май 2011, 15:30:37 »
Полезен может быть FGS. ГВС2 в данной ситуации менее ценен так как "совпаденцев" со специфическими мутациями в ГВС2 мало.

Оффлайн NMTАвтор темы

  • Сообщений: 70
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: I2a1b
  • мтДНК: C5c1a
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #10 : 14 Май 2011, 15:34:40 »
после загрузки данных (.fasta) в он-лайн утилиту от James Lick получил вот это http://vps1.jameslick.com/dna/mthap/mthap.cgi:
"mthap version 0.15 (2011-03-07); haplogroup data version Phylotree Build 11 (2011-02-07)
 raw data source N98102-FASTA.fasta (16KB)

FASTA format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR1.

Found 546 markers at 546 positions covering 3.3% of mtDNA.


Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2:
CR:
HVR1: 16093C 16223T 16234T 16288C 16298C 16327T 16518- 16520.1C 16527T


Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) C5c1

Defining Markers for haplogroup C5c1:
HVR2: 73G 249- 263G 489C
 CR: 595.1C 750G 1438G 1670T 2706G 3552A 4715G 4769G 7028T 7196A 8584A 8701G 8860G 9540C 9545G 10398G 10400T 10454C 10873C 11719A 11914A 12705T 13263G 14318C 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 15487T
 HVR1: 16093C 16223T 16234T 16288C 16298C 16327T 16518T 16527T

Marker path from rCRS to haplogroup C5c1 (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 8701G 9540C 10398G 10873C 15301A ⇨ L3 ⇨ 489C 10400T 14783C 15043A ⇨ M ⇨ 4715G 7196A 8584A 15487T 16298C ⇨ M8 ⇨ 249- ⇨ CZ ⇨ 3552A 9545G 11914A 13263G 14318C 16327T ⇨ C ⇨ 595.1C 16288C ⇨ C5 ⇨ 16093C ⇨ C5(16093) ⇨ 10454C 16518T 16527T ⇨ C5c ⇨ 1670T 16234T ⇨ C5c1 ⇨ 16518- 16520.1C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(8): 16093C 16223T 16234T 16288C 16298C 16327T 16518- 16527T
Extras(2): 16518- 16520.1C
Untested(34): 73 249 263 489 595.1 750 1438 1670 2706 3552 4715 4769 7028 7196 8584 8701 8860 9540 9545 10398 10400 10454 10873 11719 11914 12705 13263 14318 14766 14783 15043 15301 15326 15487


1) C5c1a

Defining Markers for haplogroup C5c1a:
HVR2: 73G 249- 263G 489C
 CR: 595.1C 750G 1438G 1670T 2706G 3552A 4715G 4769G 7028T 7196A 7694T 8584A 8701G 8860G 9540C 9545G 10398G 10400T 10454C 10873C 11719A 11914A 12705T 13263G 14318C 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 15487T
 HVR1: 16093C 16223T 16234T 16288C 16298C 16327T 16518T 16527T

Marker path from rCRS to haplogroup C5c1a (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 8701G 9540C 10398G 10873C 15301A ⇨ L3 ⇨ 489C 10400T 14783C 15043A ⇨ M ⇨ 4715G 7196A 8584A 15487T 16298C ⇨ M8 ⇨ 249- ⇨ CZ ⇨ 3552A 9545G 11914A 13263G 14318C 16327T ⇨ C ⇨ 595.1C 16288C ⇨ C5 ⇨ 16093C ⇨ C5(16093) ⇨ 10454C 16518T 16527T ⇨ C5c ⇨ 1670T 16234T ⇨ C5c1 ⇨ 7694T ⇨ C5c1a ⇨ 16518- 16520.1C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(8): 16093C 16223T 16234T 16288C 16298C 16327T 16518- 16527T
Extras(2): 16518- 16520.1C
Untested(35): 73 249 263 489 595.1 750 1438 1670 2706 3552 4715 4769 7028 7196 7694 8584 8701 8860 9540 9545 10398 10400 10454 10873 11719 11914 12705 13263 14318 14766 14783 15043 15301 15326 15487


2) C5c

Defining Markers for haplogroup C5c:
HVR2: 73G 249- 263G 489C
 CR: 595.1C 750G 1438G 2706G 3552A 4715G 4769G 7028T 7196A 8584A 8701G 8860G 9540C 9545G 10398G 10400T 10454C 10873C 11719A 11914A 12705T 13263G 14318C 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 15487T
 HVR1: 16093C 16223T 16288C 16298C 16327T 16518T 16527T

Marker path from rCRS to haplogroup C5c (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 8701G 9540C 10398G 10873C 15301A ⇨ L3 ⇨ 489C 10400T 14783C 15043A ⇨ M ⇨ 4715G 7196A 8584A 15487T 16298C ⇨ M8 ⇨ 249- ⇨ CZ ⇨ 3552A 9545G 11914A 13263G 14318C 16327T ⇨ C ⇨ 595.1C 16288C ⇨ C5 ⇨ 16093C ⇨ C5(16093) ⇨ 10454C 16518T 16527T ⇨ C5c ⇨ 16234T 16518- 16520.1C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 16093C 16223T 16288C 16298C 16327T 16518- 16527T
Extras(3): 16234T 16518- 16520.1C
Untested(33): 73 249 263 489 595.1 750 1438 2706 3552 4715 4769 7028 7196 8584 8701 8860 9540 9545 10398 10400 10454 10873 11719 11914 12705 13263 14318 14766 14783 15043 15301 15326 15487


3) C5(16093)

Defining Markers for haplogroup C5(16093):
HVR2: 73G 249- 263G 489C
 CR: 595.1C 750G 1438G 2706G 3552A 4715G 4769G 7028T 7196A 8584A 8701G 8860G 9540C 9545G 10398G 10400T 10873C 11719A 11914A 12705T 13263G 14318C 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 15487T
 HVR1: 16093C 16223T 16288C 16298C 16327T

Marker path from rCRS to haplogroup C5(16093) (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 8701G 9540C 10398G 10873C 15301A ⇨ L3 ⇨ 489C 10400T 14783C 15043A ⇨ M ⇨ 4715G 7196A 8584A 15487T 16298C ⇨ M8 ⇨ 249- ⇨ CZ ⇨ 3552A 9545G 11914A 13263G 14318C 16327T ⇨ C ⇨ 595.1C 16288C ⇨ C5 ⇨ 16093C ⇨ C5(16093) ⇨ 16234T 16518- 16520.1C 16527T

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(5): 16093C 16223T 16288C 16298C 16327T
Extras(4): 16234T 16518- 16520.1C 16527T
Untested(32): 73 249 263 489 595.1 750 1438 2706 3552 4715 4769 7028 7196 8584 8701 8860 9540 9545 10398 10400 10873 11719 11914 12705 13263 14318 14766 14783 15043 15301 15326 15487"

P.S. я так понял, что я всё ж C5c1 (c вероятностью C5c1а), а не С5b1???

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19279
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1348/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #11 : 14 Май 2011, 15:52:37 »
А корни откуда?

Оффлайн NMTАвтор темы

  • Сообщений: 70
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: I2a1b
  • мтДНК: C5c1a
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #12 : 14 Май 2011, 15:55:17 »
по матери казанские татары, известны до прабабки, родня в Татарии, по отцу русские ЦР России

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #13 : 14 Май 2011, 16:14:42 »
В phylotree недавно произошла смена номенклатуры - они поменяли местами C5b и C5c. Я еще не заменил у себя. Да, для удобства можете писать C5c чтобы все соответствовало Phylotree.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа С
« Ответ #14 : 14 Май 2011, 16:18:33 »
Собственно, для краткости можете свою линию обозначать как C5+16234+16518+16527. Это и есть "восточноевропейская C5". Номенклатура может меняться а суть остается.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100