Я переделала все с установкой
-37 маркеров
-6 генетическая дистанция.
Получилась такая картинка.
Если возможно, помогите понять результат.
Немного толкований по рыбьим косточкам.
1) Дерево построено с укоренением по модальному гаплотипу. Это Один из возможных вариантов укоренений. Модальный гаплотип, это набор наиболее часто встречающихся в выборке значений по каждому из маркеров.
Сейчас у Вас в выборке 6 совпаденцев - модальный гаплотип (и последующее построение) один. Убавьте кого-то, или прибавьте - значения модала и результаты построения изменятся.
Основной вывод: филогенетическое построение
выборкозависимое.
2) Рассматривайте данное построение как генеалогическое дерево. Узлы (пересечения) соответствуют общим предкам. Длина ветвей (в соотношениях) соответствуют поколенным расстояниям. Вопрос о том, как получить масштабную линейку, увязанную с ВБОП пока опускаем. (Есть несколько простых артизанальных методов - о них, если хотите, позже.)
Теперь самое главное. Для данной группы сэмплов можно построить не одно, а несколько различных филогенетических деревьев. Обычно по мере накопления новых данных указания родственных связей (будем называть ветви древа именно так) - меняются.
Основной вывод: все построения всегда носят некий промежуточный характер.
3) Посмотрим на веточку FDTEZ и DGSUV. Вроде имеют общего предка. А расстояния до предка разные. Почему? Как это следует понимать?
Допустим, между двумя указанными сэмплами 6 шагов генетической дистанции. Вполне может быть, что от какого-то предкового гаплотипа один образец отличается к примеру на две мутации, а другой на четыре. Поэтому и ветки разной длины.
Извините, на работу бегу. Надеюсь, ещё кто-нибудь подключится к объяснению.
а) Я помню Вас как серьёзного генеалога с СВРТ.
2) Вы проявили необыкновенную прыть и сообразительность (пардон, за фамильярность
), которую я не видел ни от кого из новичков с данного форума.
Иными словами, потенциал Ваш велик и хотелось бы Вас по полной увлечь ДНК-генеалогией.
Коллеги, не спите!!!