АвторТема: Проект Magnus Ducatus Lituaniae  (Прочитано 148366 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #510 : 08 Ноябрь 2012, 16:31:42 »
PS В 6-й хромосоме у меня полно пигмеев и суб-Сахары вместе с ЮВ-Азией.  :o
Похромосомный режим очень зашумленный, это скорее всего ничего не значит. Еще Африка может идти в комплекте с North-European mesolithic из-за его сравнительной древности, у финнов иногда встречается немножко Африки.

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #511 : 08 Ноябрь 2012, 16:45:57 »
Еще Африка может идти в комплекте с North-European mesolithic из-за его сравнительной древности, у финнов иногда встречается немножко Африки.
У меня в 6-й помимо Африки почти максимальное значение Северо-Восточной Европы. Еще Сибири много. А Западной Азии очень мало. North-European mesolithic вообще в ней отсутствует.

11-я же примечательна полным отсутствием West Asia при максимуме North-European mesolithic. Вообще, между ними обратная корреляция.

А вот Atlantic_Mediterranean_Neolithic и North-East-European распределены в целом равномерно. Первый слегка коррелирует с West Asia.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #512 : 08 Ноябрь 2012, 17:16:32 »
У меня в 6-й помимо Африки почти максимальное значение Северо-Восточной Европы. Еще Сибири много. А Западной Азии очень мало. North-European mesolithic вообще в ней отсутствует.
Да, загадка... Одна хромосома - это пять или больше поколений назад, XIX век. Вспомнился Пушкин  ;D

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #513 : 08 Ноябрь 2012, 17:43:03 »
Поиск матчей по ней (с сегментами более 1 сМ) не выдает ничего неожиданного. Все те же люди, которые находятся и при обычном поиске: татары, чеченцы, парочка финнов, русские и Западная Европа.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #514 : 10 Ноябрь 2012, 09:30:26 »
Полезные ссылки для MDLP W22:
 Quote Originally Posted by Vadim Verenich View Post
Populations used with mean K=22 values https://docs.google.com/spreadsheet/ccc?key=0Aqn7iMc2P-yQdEItR3hlYzVVSE5yQjBkUzBzT1E5Ymc
MDS plot with MDLP synthetic populations of "pure components" http://image-upload.de/image/UFhVmK/052076d5e1.png
DIY version of MDLP Wolrd-22 -all-in-one kit for all off-line needs of yourself. https://docs.google.com/open?id=0B6n7iMc2P-yQMnN2OXVERlhjSXM
MOracle(m: DodecadOracle) tool for inferring population sharing https://docs.google.com/file/d/0B6n7iMc2P-yQMkVZYXd1TEFHMGM/edit

Оффлайн galychanyn

  • Сообщений: 297
  • Страна: ua
  • Рейтинг +30/-0
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a1a (L260+, YP256+, YP254-)
  • мтДНК: H3g
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #515 : 29 Март 2013, 16:22:44 »
Мои результаты:
 0.00%  Pygmy               
  9.74%  West-Asian         
  2.49%  North-European-Mesol
  0.78%  Indo-Tibetan       
  0.00%  Mesoamerican       
  1.06%  Arctic-Amerind     
  0.00%  South-America_Amerin
  0.15%  Indian             
  0.05%  North-Siberean     
 27.94%  Atlantic_Mediterrane
  0.59%  Samoedic           
  0.00%  Indo-Iranian       
  0.00%  East-Siberean       
 52.26%  North-East-European
  0.06%  South-African       
  0.01%  North-Amerind       
  0.00%  Sub-Saharian       
  0.29%  East-South-Asian   
  4.53%  Near_East           
  0.00%  Melanesian         
  0.00%  Paleo-Siberian     
  0.05%  Austronesian   

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7824
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #516 : 29 Март 2013, 18:18:00 »
Да, я посевернее буду:

West-Asian   2.51%
North-European-Mesolithic   4.20%
Mesoamerican   0.35%
Arctic-Amerind   1.81%
North-Siberean   0.12%
Atlantic_Mediterranean_Neolithic   19.04%
North-East-European   67.05%
East-South-Asian   0.47%
Near_East   3.81%
Paleo-Siberian   0.64%

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #517 : 29 Март 2013, 18:48:10 »
Мои резалты:
Pygmy   -   
West-Asian   4.33%
North-European-Mesolithic   4.20%
Indo-Tibetan   0.39%
Mesoamerican   -   
Arctic-Amerind   0.07%
South-America_Amerind   -   
Indian   0.17%
North-Siberean   -   
Atlantic_Mediterranean_Neolithic   19.56%
Samoedic   3.25%
Indo-Iranian   1.61%
East-Siberean   0.31%
North-East-European   63.00%
South-African   -   
North-Amerind   -   
Sub-Saharian   -   
East-South-Asian   0.49%
Near_East   1.53%
Melanesian   -   
Paleo-Siberian   0.51%
Austronesian   0.55%

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9799
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #518 : 01 Апрель 2013, 10:52:35 »
MDLP World-22 Oracle

#   Population   Percent
1   North-East-European   63.07
2   Atlantic_Mediterranean_Neolithic   20.17
3   North-European-Mesolithic   6.41
4   West-Asian   4.27
5   Samoedic   2.41
6   North-Siberean   1.54
7   North-Amerind   0.59
8   Mesoamerican   0.45
9   Austronesian   0.45
10   Arctic-Amerind   0.25
11   South-African   0.18
12   Paleo-Siberian   0.14
13   Indo-Tibetan   0.04
14   Indo-Iranian   0.01
15   East-Siberean   0.01

Single Population Sharing:

#   Population (source)   Distance
1   Belarusian_V (derived)   5.73
2   Ukrainian-Center (derived)   5.81
3   Russian_V (derived)   5.89
4   Ukrainian_V (derived)   6.07
5   Sorb (derived)   6.24
6   Ukrainian-West (derived)   6.5
7   Polish_V (derived)   6.74
8   Russian_cossack (derived)   6.79
9   Ukrainian-East (derived)   7.08
10   Russian_South (derived)   7.1
11   Mordovian_V (derived)   7.39
12   Ukrainian (derived)   7.72
13   Polish (derived)   8
14   Mordovian (derived)   8.38
15   Russian_Center (derived)   8.46
16   Slovakian (derived)   8.64
17   Moldavian (derived)   8.86
18   Russian_North (derived)   8.98
19   Czech (derived)   10.46
20   Croatian_V (derived)   11.46

Оффлайн eugene-march

  • Сообщений: 284
  • Рейтинг +41/-2
  • Y-ДНК: R1a1a
  • мтДНК: К1b2a
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #519 : 20 Июнь 2013, 22:37:13 »
Мои данные:
0.00% Pygmy
6.22% West-Asian
3.88% North-European-Mesol

0.40% Indo-Tibetan
0.34% Mesoamerican
0.50% Arctic-Amerind
0.20% South-America_Amerin
0.13% Indian
0.67% North-Siberean
18.61% Atlantic_Mediterrane
1.72% Samoedic
0.98% Indo-Iranian

0.52% East-Siberean
64.09% North-East-European
0.22% South-African
0.20% North-Amerind
0.00% Sub-Saharian
0.00% East-South-Asian
1.09% Near_East
0.18% Melanesian
0.00% Paleo-Siberian
0.06% Austronesian

Using 1 population approximation:
1 Ukrainian-Center @ 3,14442
2 Ukrainian_V @ 3,878799
3 Ukrainian-East @ 3,947558
4 Russian_V @ 4,067855
5 Belarusian_V @ 4,256191
6 Russian_cossack @ 4,344524
7 Russian_South @ 4,426137
8 Polish_V @ 4,718939
9 Sorb @ 4,99787
10 Ukrainian @ 5,052432
11 Ukrainian-West @ 5,151392
12 Polish @ 6,715526
13 Mordovian_V @ 6,755747
14 Russian_Center @ 6,941658
15 Mordovian @ 7,779762
16 Moldavian @ 8,612144
17 Slovakian @ 9,885686
18 Latvian_V @ 10,764666
19 Russian @ 10,804765
20 Russian_North @ 10,997324
253 iterations.

Using 2 populations approximation:
1 Russian_V+Ukrainian-Center @ 2,208823
2 Russian_V+Ukrainian_V @ 2,502528
3 Russian_South+Ukrainian_V @ 2,830884
4 Russian_V+Ukrainian-West @ 2,844735
5 Russian_South+Ukrainian-Center @ 2,892175
6 Russian_cossack+Ukrainian-Center @ 2,923558
7 Belarusian_V+Ukrainian-Center @ 2,944266
8 Ukrainian-Center+Ukrainian-East @ 2,971935
9 Polish_V+Ukrainian_V @ 2,972491
10 Belarusian+German @ 2,997909
11 Ukrainian-East+Ukrainian_V @ 3,00354
12 Russian_South+Ukrainian-West @ 3,008116
13 Russian_Center+Ukrainian-West @ 3,030136
14 Russian_cossack+Ukrainian_V @ 3,042357
15 Belarusian_V+Ukrainian_V @ 3,058904
16 Polish_V+Ukrainian-Center @ 3,076718
17 Russian_Center+Ukrainian_V @ 3,127625
18 Mordovian+Sorb @ 3,13716
19 Ukrainian-Center+Ukrainian-Center @ 3,14442
20 Mordovian_V+Polish_V @ 3,156892

Gaussian method.
Noise dispersion set to 0,22662

Using 1 population approximation:
1 Polish_V @ 2,546931
2 Ukrainian-East @ 2,845316
3 Ukrainian-Center @ 2,860159
4 Belarusian_V @ 3,040401
5 Ukrainian-West @ 3,139539
6 Russian_Center @ 3,172514
7 Russian_South @ 3,185197
8 Ukrainian_V @ 3,310638
9 Slovakian @ 3,347178
10 Polish @ 3,503232
11 Russian_V @ 3,70423
12 Russian_cossack @ 3,782209
13 German @ 3,979488
14 Sorb @ 3,985477
15 Ukrainian @ 4,00567
16 German-North @ 4,101171
17 German_V @ 4,263209
18 Russian @ 4,352131
19 Moldavian @ 4,441735
20 Mordovian @ 4,556076
253 iterations.


Данные жены:
Pygmy- 0,33
West-Asian- 7,05
North-European-Mesolithic- 3,80
Indo-Tibetan- 1,01

Mesoamerican- 0,00
 Arctic-Amerind- 0,00
 South-America_Amerind- 0,00
 Indian- 0,00
 North-Siberean- 1,05
 Atlantic_Mediterranean_Neolithic -23,48

 Samoedic- 0,19
 Indo-Iranian- 1,00
 East-Siberean- 0,07
 North-East-European- 55,48
 South-African- 0,05
 North-Amerind- 0,00
 Sub-Saharian -0,11
 East-South-Asian – 0,16
Near_East- 5,14
 Melanesian- 0,00
 Paleo-Siberian- 0,90
 Austronesian- 0,16

Using 1 population approximation:
1 Croatian_V @ 3,584663
2 Slovakian @ 5,519245
3 Czech @ 5,963228
4 German @ 6,584362
5 Slovenian @ 7,06812
6 Ukrainian-West @ 7,584447
7 Hungarian @ 8,260122
8 Croatian @ 8,333705
9 Ukrainian_V @ 8,699933
10 German-North @ 8,748425
11 Latvian_V @ 9,352173
12 Bosnian @ 9,812022
13 Ukrainian-Center @ 9,857432
14 Mordovian_V @ 10,209331
15 Austrian @ 11,285098
16 Sorb @ 11,311333
17 Swedish @ 11,511367
18 German_V @ 11,610067
19 CEU_V @ 12,119492
20 Swedish_V @ 12,138373
253 iterations.

Using 2 populations approximation:
1 Bulgarian+Estonian @ 2,360161
2 Estonian+Macedonian @ 2,963994
3 Estonian+Montenegrin @ 2,973506
4 Russian_V+Serbian @ 2,982523
5 Russian_Center+Serbian @ 3,286611
6 Latvian_V+Swedish @ 3,288739
7 Estonian+Romania @ 3,322531
8 Moldavian+Serbian @ 3,329395
9 Latvian_V+Swedish_V @ 3,333813
10 Macedonian+Russian_Center @ 3,354252
11 Hungarian+Ukrainian_V @ 3,378319
12 Estonian+Gagauz @ 3,391799
13 Montenegrin+Russian_Center @ 3,511623
14 German-North+Latvian_V @ 3,550921
15 Croatian_V+Croatian_V @ 3,584663
16 Hungarian+Ukrainian-West @ 3,619631
17 Russian_cossack+Serbian @ 3,752896
18 German+Ukrainian-West @ 3,759549
19 Hungarian+Ukrainian-Center @ 3,763461
20 Bosnian+Russian_V @ 3,777037
32131 iterations.

Gaussian method.
Noise dispersion set to 0,22662

Using 1 population approximation:
1 Slovenian @ 3,508076
2 Ukrainian-Center @ 3,809892
3 Ukrainian-West @ 3,878406
4 Czech @ 3,921835
5 Ukrainian_V @ 3,942166
6 Croatian_V @ 3,976034
7 Croatian @ 4,021183
8 Hungarian @ 4,045381
9 German @ 4,163658
10 Slovakian @ 4,164392
11 Polish_V @ 4,167468
12 German_V @ 4,209847
13 Ukrainian-East @ 4,285353
14 Sorb @ 4,40311
15 Austrian @ 4,40813
16 CEU_V @ 4,449356
17 Belarusian_V @ 4,479833
18 German-South @ 4,642434
19 German-North @ 4,66223
20 Russian_South @ 4,700475
253 iterations.



Оффлайн galychanyn

  • Сообщений: 297
  • Страна: ua
  • Рейтинг +30/-0
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a1a (L260+, YP256+, YP254-)
  • мтДНК: H3g
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #520 : 25 Июнь 2013, 23:41:41 »
У меня по хромосомах наиболее неравномерно распределен North_European Mesolithic - от 0% до 13,4%. Наиболее равномерно - Atlantic-Mediterranean-Neolithic и North-East European.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6312
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1207/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #521 : 04 Июль 2013, 22:36:09 »
Обращение Вадима Веренича (для тех, кто не в Фейсбуке)

Цитировать
Господа, я рассчитал аллельные частоты примерно 130000 тысяч снипов по референсным популяциям, взятым из академических источников. С целью сохранения совместимости с коммерческими данными, были выбраны только те снипы, которые присутствуют либо в последнем чипсете 23andme, и/либо в последнем чипсете FAmilyFinder от FTDNA.
Я высчитал средние значения каждого из 23 компонентов для всех референсных популяций. Также имеются данные по кластерному определению каждого из снипов.
Судя по разбивке популяций, они выглядят весьма правдоподобными.
Но некоторые кластеры вызвают вопросу. Поэтому перед тем как делать релиз очередного этно-популяционного ДНК-калькулятора, я решил воспользоваться услугами бета-тестеров. В первую очередь, надеюсь на помощь Александр Бурнашев и Srkz (Сергея Козлова) поскольку они лучше остальных в русскоязычном секторе любителей ДНК-генеалогии понимают принципы работы калькуляторов на основе Додекад DIY. Все необходимые данные я перешлю по мейлу

https://www.facebook.com/vadim.verenich/posts/10201421796256634

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 4778
  • Страна: ru
  • Рейтинг +345/-16
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3127
  • мтДНК: V16
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #522 : 04 Июль 2013, 23:02:17 »
У меня по хромосомах наиболее неравномерно распределен North_European Mesolithic - от 0% до 13,4%. Наиболее равномерно - Atlantic-Mediterranean-Neolithic и North-East 
Ого, забавненько -  у западного украинца Урал рулит.   :) А если серьёзно, это  ещё одно подтверждение непрерывного генетического континуума от Бискайского залива до Урала. 

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #523 : 05 Июль 2013, 09:09:39 »
https://www.facebook.com/vadim.verenich/posts/10201421796256634
Написал Вадиму в Фэйсбуке, у меня там заведен "пустой" аккаунт.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Проект Magnus Ducatus Lituaniae
« Ответ #524 : 07 Июль 2013, 20:39:36 »
Хочу уточнить некоторые закономерности для Оракула в новом калькуляторе Вадима Веренича, поэтому приглашаю всех желающих поучаствовать высылать мне свои файлы аутосом raw data 23andMe или FTDNA на адрес ethnocalc(собака)mail.ru. Это не приглашение в проект MDLP, все исходит только от меня. Кому-либо другому файлы передаваться не будут. Лиц, связанных кровным родством, не шлите, но можно, к примеру, папу и маму (тогда себя не надо). Обязательно пишите происхождение, из каких местностей были предки.
После релиза DIY-калькулятора всем приславшим файлы отправлю их результаты, а также Оракул, так что вам не придется ждать его появления на Gedmatch  :)

Update: Прием файлов закончен
« Последнее редактирование: 17 Июль 2013, 16:59:57 от Srkz »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100