Нет, такое поведение на плоте объясняется только изолированным положением популяции и небольшим числом эффективной популяции.
То есть все эти баски являются многократными родственниками между собой.
Классический генный дрейф.
Так разве 2,6 миллиона человек можно назвать небольшим числом эффективной популяции? И насколько изолированной? Судя по возрасту субкладов R1b еще относительно недавно предковая мужская популяция басков не была таковой.
Нет, речь идет не о нынешнем числе живущих басков, а о эффективном размере (Ne) популяции, которая участвовала в репродукции или обмене генами
в отдаленном прошлом. Chromopainter позволяет оценить этот размер, исходя из числа наблюдаемых рекомбинаторных гаплотипов и значений LD. Когда я производил оценку этого размера, то для каждой из 22 неполовых хромосом он получился разный, однако среднеарифметическое значение составило 22 000.
Это близко к значениям Ne рекомендуемым профессионалами (например авторами программы IMPUTE V2)
"Effective size" of the population (commonly denoted as Ne in the population genetics literature) from which your dataset was sampled. This parameter scales the recombination rates that IMPUTE2 uses to guide its model of linkage disequilibrium patterns. When most imputation runs were conducted with reference panels from HapMap Phase 2, we suggested values of 11418 for imputation from HapMap CEU, 17469 for YRI, and 14269 for CHB+JPT.
Modern imputation analyses typically involve reference panels with greater ancestral diversity, which can make it hard to determine the "ideal" -Ne value for a particular study. Fortunately, we have found that imputation accuracy is highly robust to different -Ne values; within each of several human populations, we have obtained nearly identical accuracy levels for values between 10000 and 25000. We suggest setting -Ne to 20000 in the majority of modern imputation analyses.