АвторТема: GeneTree (SMGF) данные получены. Что делать дальше?  (Прочитано 16884 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Выставил такие вот параметры для поиска:



и получил только одного далёкого родича:



Мало того, что ВБОП больше 109 поколений (3300 лет), так ещё и приближенец - анонимный партизан.

Завтра займёмся вычислением гаплогруппы.
Как уже понятно, надежды получить её по приближенцам не сбылись.
Придётся использовать предикторы.

Оффлайн Brigante

  • Сообщений: 2
  • Рейтинг +0/-0
Мало того, что ВБОП больше 109 поколений (3300 лет), так ещё и приближенец - анонимный партизан.

Завтра займёмся вычислением гаплогруппы.
Как уже понятно, надежды получить её по приближенцам не сбылись.
Придётся использовать предикторы.

Дело в том, что у всех, кто тестировался не в ФТДНА, гаплогруппы "обнулились" и стали неизвестными. У обоих ранее стояло G2a1a




Оффлайн Brigante

  • Сообщений: 2
  • Рейтинг +0/-0
Цитировать
СТРАННО, пытаюсь посмотреть, получаю
Invalid User ID
Аджиев - EPHQX

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Для сравнения с базой Соренсона, обладателям 67-маркерных гаплотипов от ФТДНА надо дозаказать следующие 9 (девять) маркеров:

DYS461
DYS462
Y-GATA-A10
DYS635
Y-GGAAT-1B07
DYS441
DYS445
DYS452
DYS463


А не 8, как я писал ранее ошибочно.
« Последнее редактирование: 10 Март 2011, 18:23:25 от Mich Glitch »

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Набил данные Аджиева в предиктор Вадима, получил следующий предикт:

N   Haplogroup   Probability
1   G2a-P15   100%

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Остался пятый пункт - объявиться в раделе по G2a (ссылка).

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Ну, и пункт шестой: попытайтесь самостоятельно сделать простейшее построение.
Вопросы можно задавать тут.
Сначала Филипом, а потом либо Муркой, либо ТНТ.
Хорошо, если бы Вы наловчились строить дерева до подхода результатов по всем 30 сэмплам.

Могли бы сделать пусть и не вполне методически выверенное, но зато очень наглядное построение по всему карачай-малкар батчу. Типа того, как это сделал Alexander по своим однофамильцам (ссылка).

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1543
  • Страна: ru
  • Рейтинг +102/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Набил данные Аджиева в предиктор Вадима, получил следующий предикт:

N   Haplogroup   Probability
1   G2a-P15   100%
Рискну предположить, что G2a1a. Исходя из того, что в ближнем круге Березов, который вместе с уже обширной группой земляков:
QEB7P   Kokaev   Ossetia, Russia 
6PS3J   Dzhugashvili   Georgia 
6R6HV   Ramonov   Ossetia, Russia 
97SV9   Khumarov  Ossetia, Russia 
C9JB3   Tsakhilov   Ossetia, Russia 
CTF38   Dzgoev   Ossetia, Russia 
ENKNN   Aboity   Zaramag, Ossetia, Russia 
ZNAFX   Chabiev   Koban, Ossetia, Russia 
входит в осетинскую, или лучше сказать, аланскую, ветвь G2a1a.

Оффлайн dmpir

  • Данков
  • Сообщений: 679
  • Страна: ru
  • Рейтинг +92/-3
  • R1a1(BY32008)
  • Y-ДНК: R1a1a1g (M458>CTS11962>L1029> FGC66323>YP6048>BY32008)
  • мтДНК: HV9A
Михаил, большое спасибо за мануал, осваиваю. (Если написать его побудило мое письмо к вам, то спасибо тем более  :)).

Перепрыгивая вперед, не совсем понимаю вопросы по поводу определения гаплогруппы.
У меня в письме от генетрее сразу стояло:
•   Y-DNA Haplogroup: R-M207
•   Subgroup: R1a1a-M458
Т.е. могу ли я сразу себя отнести к R1a1a-M458 или это нужно перепроверять?

Оффлайн dmpir

  • Данков
  • Сообщений: 679
  • Страна: ru
  • Рейтинг +92/-3
  • R1a1(BY32008)
  • Y-ДНК: R1a1a1g (M458>CTS11962>L1029> FGC66323>YP6048>BY32008)
  • мтДНК: HV9A
Чудны бо дела твои...
Итак, загнав свои данные в поисковик Соренсона по двум стандартам (Family Tree DNA и NIST), выбрав 85% совпадения я получил одинаковые результаты. Вот они.



Картина любопытная.
Пара шведов, австияк, три немца и русский.
Наибольшая сходимость со шведами. 20 поколений.
с австрийцем - 27 поколений.
с русским (вроде как из тверских) - 34 поколения.

С учетом того, что предок мой (вопрос вдруг согрешивших бабушек пока отставляем), сторожевой казак Назар из пограничного тогда города Данков, отстоит от меня на 13 поколений становится особенно интересно.))

Родство с русским и австро-немцами можно связать со славянским (венедским) корнем. Но со шведами как-то не понятно.

Поскольку средний шаг поколения в моем случае составляет 27 лет, экстраполируя получаем, что наш общий с этими шведами предок проживал в промежутке между 1080-1240гг. Вполне историческое время, конец средневековья. Русь раздроблена, но еще не под татарами.

p/s/ ну или я таки что-то сделал не так.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Т.е. могу ли я сразу себя отнести к R1a1a-M458 или это нужно перепроверять?
Уже перепроверять по предикторам не нужно.
Точнее на 43 маркерах никто не скажет.
Другое дело, если бы было 67 маркеров. В этом случае можно было бы сделать тест дип-снип. Т.е. определить свой субклад по снипу в явном виде.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Чудны бо дела твои...
Итак, загнав свои данные в поисковик Соренсона по двум стандартам (Family Tree DNA и NIST), выбрав 85% совпадения я получил одинаковые результаты.
Ничего удивительного.
Вам надо было вводить свои данные непосредственно в формате ГенТри. Тогда никакие конверсии не нужны.
Затем, когда Вы меняете, скажем на ISOGG (NIST) формат, или ФТДНА, то мало того, что маркеры располагаются в нужном порядке, так ещё и их значения меняются в зависимости от конвенции.

Резюмирую: проверьте, что значения всех маркеров Вы ввели правильно.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34637
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
По поводу шведа. 4 маркера у него отсутствуют: DYS464 a, b, c, d.
Т.е., 7 несовпадений. (То, что значения этого маркера несовпадают - наиболее вероятно. Чисто статистически.)
Итого 36 матчей из 43.
Что даёт при скорости мутаций 0.002 и доверительном интервале 50% 49 поколений. Скажем, БОП 500 г.р. Н.Э.

Колумбиец, с его 6 несовпадениями, и то ближе - ВБОП равен 42 поколениям.

Ну, и сомнения по поводу правильности ввода значений маркеров Вы всё ещё не развеяли.

Резюмирую:
1) Введите данные в формате ГенТри.
2) Кликнув на соответствующую кнопку, переведите данные в формат ФТДНА.
3) Проверьте приближенцев и поделитесь скриншотом.

Оффлайн dmpir

  • Данков
  • Сообщений: 679
  • Страна: ru
  • Рейтинг +92/-3
  • R1a1(BY32008)
  • Y-ДНК: R1a1a1g (M458>CTS11962>L1029> FGC66323>YP6048>BY32008)
  • мтДНК: HV9A
Цитировать
Резюмирую: проверьте, что значения всех маркеров Вы ввели правильно.

я по незнанию (до вашего мануала еще). ввел маркеры по первому предложенному варианту (NIST). Но он совпадает с GeneTree полностью. разве не так? потом, при выборе FTDNA уже происходила автоматическая конвертация.
Вот по ysearch у меня нет уверенности. там в каком формате надо вбивать, тоже FTDNA?

как верх наглости демонстрирую свою таблицу, в том виде, в котором получил:

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2723
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
В таблице на этой странице форума Ваши данные в формате NIST. В поиске на предыдущей - данные в формате ФТДНА. От данных NIST  -GATA_H4(-1),DYS442(-5),DYS441(-1),GATA_A10(-2).
В Ysearch надо вводить в формате ФТДНА, но понимать, что кто-то из тестировавшихся у Соренсена(43м) мог ввести данные в формате NIST.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100