Только, если скидываться, то лучше брать не меня или Леслу, а кого-нибудь, кто поближе к модалу. А иначе велик шанс получить частный снип.
Не совсем так. Все ветви прошли одинаково длинную историю, все одиниково далеки от корня. Просто некоторые линии в силу случайности
на выбранном наборе 67 имеют мало мутаций, а если вдобавок их веточки малы, то возникает полная иллюзия абсолютной немутированности. На самом деле у прикорневых (по СТР) вероятность иметь снипы не меньше чем у периферийных. Мы еще до конца не знаем насколько они "прикорневые", это могут быть просто малонаселенные ветви или одиночные гаплотипы без близких связей. Они могут быть
близки к корню по виду 67 локусов а могут быть и
далеки, в последнем случае их изолированность может выражаться в перепрыгивании с ветки на ветку, и только многократные запуски хорошего софта, вроде ТНТ, проливают свет на их истинную "прикорневость".
Я много лет наблюдаю как меняется картина мутаций в ГВС vs полный сиквенс мтднк. Распределение такое как я описал выше. Никаких разумных соображений что у У-хромосомы это по-другому быть не может. Есть масса глубоких ветвей которые по ГВС - как предок, а на полной молекуле там такоооой зоопарк мутаций..
Итак: если ветвь на 67 выделяется очень хорошо и со стабильным составом, то вкорее всего так и по снипам будет. Если же она либо прыгает либо находится "у корня" то угадать что в действительности невозможно. Переход от 67 к полному сиквенсу может быть еще разительнее чем от 17 к 67.
Поэтому мне кажется, что при наличии средств нужно брать нескольких наиболее удаленных.