АвторТема: RJGG Vol.3 No.1 2011  (Прочитано 39615 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #15 : 18 Апрель 2011, 20:50:49 »
А можно обобщенное резюме по этой статья не на математическом а на нормальном понятным простому человеку языке? Иначе кроме автора никто не поймет ничего.  :)

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6479
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2708/-13
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #16 : 18 Апрель 2011, 21:22:16 »
Господа, насколько я поняла объяснения уважаемого автора, все статьи очень сильно взаимосвязаны, эта статья - предваряющая, на нее будут ссылки в остальных статьях. Может быть наберемся немного терпения? ::)

Оффлайн Каржавин

  • ...
  • Сообщений: 1798
  • Рейтинг +144/-2
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #17 : 18 Апрель 2011, 22:51:08 »
[Ну, или, что следует из сползания матожидания вправо-влево? И т.д.
А следует то, что при вычислении так называемого модального гаплотипа в этом маркере получится значение, "сползшее" относительно истинного предкового. Всего и делов! А потом на этом липовом "базовом" гаплотипе делаются выводы. ;)
Или другая формула для второго момента распределения (дисперсии), в которой учитываются перескоки аллелей сразу на несколько шагов, позволяет более точно рассчитать время жизни предка, которое иначе будет чуточку завышено. Мелочь, конечно, но курочка помалу клюет и сыта бывает. Между прочим, анализируя мутации "отец-сын", я увидел, что однозначно двух и трехшаговые мутации имеются! А одна двухшаговая мутация в формуле дисперсии весит как ЧЕТЫРЕ одношаговых, а одна трехшаговая весит как ДЕВЯТЬ одношаговых. Конечно, вероятность двухшаговых более чем в 10 раз меньше,чем одношаговых, да и не во всех локусах они имеются. Тем не менее, куммулятивный эффект от них может составить в дисперсии от 5% до 15%. Вот и судите, много это или мало.
А по поводу понятности статьи, я старался! Согласен с уважаемым Александром, что она какая-то непонятно зачем. ДА, она должна была быть как часть моей давней статьи. Ну не хватило мне тогда соображалки этот ВАЖНЫЙ вопрос прояснить. Но он действительно важен, а впихивать его в другие статьи не получилось, выпирает отовсюду грыжей (вот только в первую давно написанную статью ложится).

Слава Богу, остальные статьи написаны вместе с Адамовым, а это залог понятности текста.
По поводу практической значимости: будет и это, господа, не сумлевайтеся!
« Последнее редактирование: 18 Апрель 2011, 23:06:56 от Каржавин »

Оффлайн Каржавин

  • ...
  • Сообщений: 1798
  • Рейтинг +144/-2
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #18 : 18 Апрель 2011, 23:15:58 »
Думаю у Сергея статья из первого рода, на основе которой он напишет что-нибудь поинтереснее для читателей.
Уверен, что действительно интересное напишете Вы, поскольку метод оценки TMRCA, который мы с Дмитрием разработали, позволит Вам и всем остальным уменьшить ошибки датирования, особенно для малых совокупностей гаплотипов. Так что, для Вас точно будет иметь интерес  ;)

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6479
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2708/-13
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #19 : 21 Апрель 2011, 22:23:55 »
Статья автором доработана и отправлена техреду для перезаливки на сайте.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6479
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2708/-13
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #20 : 23 Апрель 2011, 21:29:44 »
Получена-сверстана-согласована вторая статья из заявленной серии "Оценка возраста родовой популяции по STR гаплотипам Y-хромосомы" (Д.Адамов, С.Каржавин). Отправлена техреду.

Оффлайн Grigoriev

  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 3098
  • Страна: ru
  • Рейтинг +187/-3
    • Молекулярная генеалогия
  • Y-ДНК: O3a3c
  • мтДНК: J1c
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #21 : 23 Апрель 2011, 23:33:07 »
Вернулся из Красноярска. Постараюсь поработать со статьями...

Оффлайн Grigoriev

  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 3098
  • Страна: ru
  • Рейтинг +187/-3
    • Молекулярная генеалогия
  • Y-ДНК: O3a3c
  • мтДНК: J1c
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #22 : 24 Апрель 2011, 22:04:55 »
Статья автором доработана и отправлена техреду для перезаливки на сайте.
Сделано.

Оффлайн Grigoriev

  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 3098
  • Страна: ru
  • Рейтинг +187/-3
    • Молекулярная генеалогия
  • Y-ДНК: O3a3c
  • мтДНК: J1c
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #23 : 24 Апрель 2011, 22:13:53 »
Оценка возраста родовой популяции по STR гаплотипам Y-хромосомы
Дмитрий Адамов, Сергей Каржавин

Цитировать
Вводятся понятия среднего возраста родовой популяции и возраста начального предка генеалогического дерева выживших финальных потомков. Расчет этих возрастов по выборке Y-STR гаплотипов соответствует разным вариантам квадратичного метода: соответственно ASD (стандартному) методу и ASD0 методу.
На основе компьютерного моделирования множества генеалогий исследованы характеристики вероятностных распределений оценки возраста в зависимости от численности финальной популяции, количества маркеров в гаплотипах. Получены универсальные аппроксимационные формулы, позволяющие рассчитать среднеквадратичное отклонение оценки возраста. Исследовано улучшение точности оценки возраста с ростом числа используемых в гаплотипе Y-STR локусов (маркеров). Объяснено, почему нельзя рассчитать TMRCA по одному маркеру.

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/81

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17073
  • Страна: az
  • Рейтинг +5885/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #24 : 26 Апрель 2011, 12:40:43 »
Небольшие ремарки. Как показал скромный пейсательский опыт автора этих строк, статьи более востребованы, ежели они на английском писаны. Если такая узкоспецифическая вещь как статьи по E1b1b1 были прочитаны несколькими десятками (если уже не сотнями) людей, то что уж говорить о статьях по общетехническим предметам?

Полагаю, что эта статья Адамова о расчёте ВБОПа для чайников заслуживает перевода на английский.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2399
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #25 : 26 Апрель 2011, 12:59:55 »
Небольшие ремарки. Как показал скромный пейсательский опыт автора этих строк, статьи более востребованы, ежели они на английском писаны. Если такая узкоспецифическая вещь как статьи по E1b1b1 были прочитаны несколькими десятками (если уже не сотнями) людей, то что уж говорить о статьях по общетехническим предметам?

Полагаю, что эта статья Адамова о расчёте ВБОПа для чайников заслуживает перевода на английский.

Уважаемый Farroukh, Вы правы. Только кто бы помог с грамотным переводом... В прошлый раз выручил уважаемый Василий Гаврилов.
С Сергеем Каржавиным планируем написать еще несколько статей. Набирается целый тематический выпуск для RJGG.

Оффлайн dima75

  • Сообщений: 592
  • Страна: il
  • Рейтинг +122/-1
    • Tartakovsky surname project
  • Y-ДНК: E1b1b1-PF1975 (E-Z830-A)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #26 : 26 Апрель 2011, 13:55:17 »
...статьи по E1b1b1 были прочитаны несколькими десятками (если уже не сотнями) людей...
А где можно увидеть счётчики просмотров?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6479
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2708/-13
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #27 : 26 Апрель 2011, 14:34:15 »
...статьи по E1b1b1 были прочитаны несколькими десятками (если уже не сотнями) людей...
А где можно увидеть счётчики просмотров?
На странице со статьей, внизу. 

Оффлайн dima75

  • Сообщений: 592
  • Страна: il
  • Рейтинг +122/-1
    • Tartakovsky surname project
  • Y-ДНК: E1b1b1-PF1975 (E-Z830-A)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #28 : 26 Апрель 2011, 15:16:24 »
...статьи по E1b1b1 были прочитаны несколькими десятками (если уже не сотнями) людей...
А где можно увидеть счётчики просмотров?
На странице со статьей, внизу.
http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGG/article/view/79/97
Не вижу. Может, причина в этом:
* Requires registration?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6479
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2708/-13
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol.3 No.1 2011
« Ответ #29 : 26 Апрель 2011, 15:18:13 »
Здесь http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGG/article/view/79 стрелочка внизу. То есть это не страница самой загрузки, а предыдущая.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.