J2a1b*

[dnaexplora]

Получил результаты дяди по маме из 23andme, не могу нагуглить никакой вменяемой инфы про субклад Подскажите, пожалуйста, где искать.

PS. ГГ по ISOGG также называется?

[Centurion]

Получил результаты дяди по маме из 23andme, не могу нагуглить никакой вменяемой инфы про субклад Подскажите, пожалуйста, где искать.

PS. ГГ по ISOGG также называется?

нужно знать какой снип... это похоже старая номенклатура

[dnaexplora]

"какой снип" -- как понять этот вопрос? какая выборка генов проверялась?

это 23andme, platform V3

[Centurion]

"какой снип" -- как понять этот вопрос? какая выборка генов проверялась?

это 23andme, platform V3

какой снип у них в их дереве маркирует эту их J2a1b*?

[I2a1a]

Советую посмотреть этот FGS в Генбанке

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/DQ341089

Он был опубликован в работе Carelli et al.2006

Положение в дереве Валерия (Valery)

Parent taxon    J2a1_306702
Sequence    73 150 195 215 295 319 489 513 750 1438 2706 4216 4769 4991 6635 7028 7476 7789 8860 10398 10499 11251 11377 11704 11719 12501 12612 12705 13708 14133 14766 15055 15257 15326 15452A 16069 16126 16145 16231 16284
Ignored    152 309.1C 309.2C 315.1C 3107d
Added    
Differences from the parent taxon    263GA(!)*) 4991GA(s)*) 6635TC(s)*) 11704CT(s)*) 12501GA(s)*) 12705CT(s)*) 15055TC(s)*) 16284AG
Frequency    1
Reference    Carelli 2006
Accession No.    DQ341089

[Centurion]

Советую посмотреть этот FGS в Генбанке

Тут про Y-гг речь. 

[I2a1a]

Сорри, не обратил внимания.

[Centurion]

J2a1b* как я понимаю (это вообще классификация ISOGG 2008)   соответствует M67, а это в последней номенклатуре 2011 года гаплогруппа J2a4b*.

[napobo3]

"какой снип" -- как понять этот вопрос? какая выборка генов проверялась?

это 23andme, platform V3

Заходите сюда: https://www.23andme.com/you/labs/haplogroup_tree_mut_mapper/ , вводите гаплогруппу и получаете снипы и их значения.

[Mich Glitch]

"какой снип" -- как понять этот вопрос? какая выборка генов проверялась?

это 23andme, platform V3

Заходите сюда: https://www.23andme.com/you/labs/haplogroup_tree_mut_mapper/ , вводите гаплогруппу и получаете снипы и их значения.

Эта гаплогруппа по третьей панели и её описания в указанной Вами фиче пока ещё нет.

[dnaexplora]

"какой снип" -- как понять этот вопрос? какая выборка генов проверялась?

это 23andme, platform V3

Заходите сюда: https://www.23andme.com/you/labs/haplogroup_tree_mut_mapper/ , вводите гаплогруппу и получаете снипы и их значения.

круто, спасибо!

[dnaexplora]

J2a1b* как я понимаю (это вообще классификация ISOGG 2008)   соответствует M67, а это в последней номенклатуре 2011 года гаплогруппа J2a4b*.

получается, J2a4b*! спасибо

J2a1b* defining mutations
N/A         
 
J2a1b defining mutations
rs2032628 (M67)   A      T
i3000079 (M67)   A      T
 
J2a1 defining mutations
N/A         
 
J2a defining mutations
N/A         
 
J2 defining mutations
rs2032604 (M172)   T      G
 
J defining mutations
rs13447352 (M304)   A      C
 

[Mich Glitch]

J2a1b* как я понимаю (это вообще классификация ISOGG 2008)   соответствует M67, а это в последней номенклатуре 2011 года гаплогруппа J2a4b*.

получается, J2a4b*! спасибо

J2a1b* defining mutations
N/A         
 
J2a1b defining mutations
rs2032628 (M67)   A      T
i3000079 (M67)   A      T
 
J2a1 defining mutations
N/A         
 
J2a defining mutations
N/A         
 
J2 defining mutations
rs2032604 (M172)   T      G
 
J defining mutations
rs13447352 (M304)   A      C

Дружище,
 
Вы спутали игрек и мито.

[Mich Glitch]

No haplogroup J2a1b found for lineage type maternal

[Mich Glitch]

Есть только вот это:


 
J2a1 defining mutations
rCRS=7789    i3000655
rCRS=14133    i3001259
rCRS=16145    rs41419246
rCRS=16231    i4000857
 
J2a defining mutations
rCRS=195    rs2857291
rCRS=195    i3002066
rCRS=10499    i3000928
rCRS=11377    rs41537746
rCRS=11377    i3001505
 
J2 defining mutations
rCRS=7476    i3000624
rCRS=15257    rs41518645
rCRS=15257    i3001522
 
J defining mutations
rCRS=295    rs41528348
rCRS=295    i4001145
rCRS=489    rs28625645
rCRS=10398    rs2853826
rCRS=12612    rs28359172
rCRS=13708    rs28359178
rCRS=16069    i3001561
 
JT defining mutations
rCRS=11251    rs3915952
rCRS=15452    rs3088309
rCRS=16126    i3001602
rCRS=16126    i3001603
 
R2'JT defining mutations
rCRS=4216    rs1599988
 
R defining mutations
rCRS=12705    rs2854122
rCRS=16223    rs2853513
 
N defining mutations
rCRS=8701    i3000759
rCRS=8701    rs34488815
rCRS=9540    rs2248727
rCRS=9540    i3001497
rCRS=10398    rs2853826
rCRS=10873    rs2857284
rCRS=15301    rs28573847
rCRS=15301    i3001523
 
L3 defining mutations
rCRS=769    rs2853519
rCRS=769    i3001949
rCRS=1018    rs2856982
rCRS=1018    i3001452
 
L3'4 defining mutations
rCRS=182    rs41473347
rCRS=182    i3001445
rCRS=3594    rs2854134
rCRS=7256    rs28625947
rCRS=13650    rs2854123
rCRS=16278    rs41458645
rCRS=16278    i3001790
 
L3'4'6 defining mutations
rCRS=4104    rs1117205
rCRS=7521    i1000010
rCRS=7521    i3001488
 
L2'3'4'6 defining mutations
rCRS=195    rs2857291
rCRS=195    i3002066
rCRS=247    rs41334645
rCRS=247    i3001448
rCRS=825    rs2853520
rCRS=8655    rs2853822
rCRS=8655    i3002650
rCRS=10688    rs2853488
rCRS=10810    rs28358282
rCRS=10810    i3000954
rCRS=13105    rs2853501
rCRS=13506    rs2857287
rCRS=15301    rs28573847
rCRS=15301    i3001523
rCRS=16129    i4990110
rCRS=16129    i3001531
rCRS=16129    i3001605
rCRS=16187    i4000590
rCRS=16187    i4000591
rCRS=16189    rs28693675
rCRS=16189    i4000587
 
L2-6 defining mutations
rCRS=152    i3001922
rCRS=2758    rs2856980
rCRS=2885    rs2854130
rCRS=7146    rs28546855
rCRS=8468    rs1116907
rCRS=8468    i3000730
 
L1-6 defining mutations
rCRS=146    i3001869
rCRS=182    rs41473347
rCRS=182    i3001445
rCRS=4312    i3002160
rCRS=10664    rs2854121
rCRS=10915    rs2857285
rCRS=11914    rs2853496
rCRS=13276    rs2853502
rCRS=16230    rs2853514