Насчёт человека - согласен. Но мы пока вроде не собираемся на виды делиться.А вот со многими приматами - сложнее. Гориллы и орангутаны уже занесены в красную книгу или ещё нет? Пора заносить, имхо.
Я уже не говорю об амурских тиграх или пандах. Собственно сабж актуален не только для филогении видов, но и для любых популяций, таковых не образующих. Насколько понимаю, ILS - заноза в заднице у всех попгенов. Особенно при филогении.
Хотя в последнее время много работ, предлагающих, как снизить гомоплазию вследствиt ILS при любых расчётах конвергенции. Сам, правда, не вникал.