АвторТема: GEDmatch.Com - инструмент для генеалогических поисков  (Прочитано 324214 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Онлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
У меня тоже есть такие глюкнутые совпаденцы в Генезисе, в том числе и этот JS4628602. Приходится перепроверять всё в Гедматче.
Зачем, в Генезиcе есть колонка Overlap, которая подсвечивается розовым или красным, когда мало общих снипов

Не могу въехать, зачем такие сложности? Размера общих сегментов не хватало?

Overlap = размер общих сегментов (в SNP), а Largest Seg = качество совпадения (в сМ). Сантиморганы отражают качество: чем больше сМ, тем выше вероятность перекреста на этом участке и тем свежее совпадение ;)

Оффлайн DmitroR-2

  • Сообщений: 1886
  • Страна: ru
  • Рейтинг +683/-3
Добрый День!
В Гедматче есть инструмент "Archaic Matches", который показывает содержание в твоих аутосомах генов ископаемых людей. У меня на уровне 5 см есть два "совпаденца". Насколько это большой %? И о чём это может говорить?
п.с. Может я не на то смотрю, и нужно наоборот вводить как можно меньший сегмент(0,5) и смотреть какой из ископаемых как можно "плотнее" "закрасится" оранжевым цветом?

Оффлайн DmitroR-2

  • Сообщений: 1886
  • Страна: ru
  • Рейтинг +683/-3

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
В Гедматче есть инструмент "Archaic Matches", который показывает содержание в твоих аутосомах генов ископаемых людей. У меня на уровне 5 см есть два "совпаденца". Насколько это большой %? И о чём это может говорить?
Здесь в первую очередь влияет качество прочтения образца. С теми, кто прочитан на уровне, близком по качеству секвенированию на чипах  - LBK, Loschbour, NE1, BR2 у европейцев часто проявляются длинные общие сегменты и много коротких. С теми, кто прочитан хуже, имеющиеся сегменты полностью проявиться не смогут, так как будут "рваться" на местах плохого прочтения. Во вторую - геногеографическая принадлежность, Clovis тоже хорошо прочитан, но это геном древнего американца, поэтому самые длинные пересечения у него с потомками индейцев. И уже только в третью очередь - древность образца, но на фоне двух перечисленных причин её влияние заметить трудно. Т.е. инструмент по сути не имеет смысла, разве что для демонстрации, что длинный общий сегмент может быть и возрастом десять тысяч лет.

Оффлайн Чукча не читатель

  • Сообщений: 317
  • Страна: 00
  • Рейтинг +95/-0
  • Y-ДНК: R1a-L260>YP1337>BY27938
Почему-то в Гедматче перестали отображаться многие близкие родственники, у них - тоже. В чем может быть проблема?

Оффлайн Balymba

  • Сообщений: 381
  • Страна: ua
  • Рейтинг +162/-0
  • Y-ДНК: I2a
  • мтДНК: H
Почему-то в Гедматче перестали отображаться многие близкие родственники, у них - тоже. В чем может быть проблема?
Думал только у меня такая проблема.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1936
  • Страна: gb
  • Рейтинг +479/-4
Похоже всех волюнтаристски переводят в genesis.   

Онлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Летом 2016, когда я переписывался с Джоном Хайвардом, он говорил, что перевод всех пользователей на новую версию (тогда еще звавшуюся https://beta.gedmatch.com) произойдет очень скоро. "Очень скоро" растянулось на 3 года почти  ;D

Оффлайн katilemur

  • Сообщений: 43
  • Страна: 00
  • Рейтинг +15/-0
  • мтДНК: H1b2
зато теперь нашелся троюродный  из Китая)
Kit                 1:1     Name      Largest Seg   Total cM   Gen      Overlap   Testing Company
PJ3019803   A   Leilei Zhang   24.0                     324.2     2.7       46176            GeseDNA - GSA Imp
UC9129789   A   Leilei Zhang   32.9                     240.1     3.0        49023            GeseDNA - ASA Imp
overlap естественно красный, но теперь не пойму какой в этом вообще смысл...

Оффлайн Feroce

  • Сообщений: 1907
  • Страна: ru
  • Рейтинг +608/-0
  • Потомок помещичьих крестьян Бессоновых(Безсоновых)
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP569>>Y11268>>>>Y86309/FT74365)
  • мтДНК: мтДНК в ожидании
Интересный факт, все перенесённые образцы имеют большие совпадения в генезисе, чем загруженные туда в ручную.

Оффлайн Balymba

  • Сообщений: 381
  • Страна: ua
  • Рейтинг +162/-0
  • Y-ДНК: I2a
  • мтДНК: H
Похоже всех волюнтаристски переводят в genesis.
Подскажите несведущим, как в тот "генезис" попасть.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1936
  • Страна: gb
  • Рейтинг +479/-4
В Генезисе совпадения начинаеют считать от 200snp, а в Гедматче вроде от 500 было?  Что за ерунду они там придумали, и зачем.  Хоть бы объявление написали - товарищи жильцы, извините за неудобство, на три недели отключим горячую воду.     

Оффлайн Balymba

  • Сообщений: 381
  • Страна: ua
  • Рейтинг +162/-0
  • Y-ДНК: I2a
  • мтДНК: H

Оффлайн Balymba

  • Сообщений: 381
  • Страна: ua
  • Рейтинг +162/-0
  • Y-ДНК: I2a
  • мтДНК: H
зато теперь нашелся троюродный  из Китая)
Kit                 1:1     Name      Largest Seg   Total cM   Gen      Overlap   Testing Company
PJ3019803   A   Leilei Zhang   24.0                     324.2     2.7       46176            GeseDNA - GSA Imp
UC9129789   A   Leilei Zhang   32.9                     240.1     3.0        49023            GeseDNA - ASA Imp
overlap естественно красный, но теперь не пойму какой в этом вообще смысл...
Что за ерунда? У меня тот же человек на такой же дистанции.

Оффлайн DmitroR-2

  • Сообщений: 1886
  • Страна: ru
  • Рейтинг +683/-3
зато теперь нашелся троюродный  из Китая)
Kit                 1:1     Name      Largest Seg   Total cM   Gen      Overlap   Testing Company
PJ3019803   A   Leilei Zhang   24.0                     324.2     2.7       46176            GeseDNA - GSA Imp
UC9129789   A   Leilei Zhang   32.9                     240.1     3.0        49023            GeseDNA - ASA Imp
overlap естественно красный, но теперь не пойму какой в этом вообще смысл...
Что за ерунда? У меня тот же человек на такой же дистанции.
У меня тот же товарищ на дистанции 26.9/324.7 и 28.0/235.1.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.