АвторТема: Снипы R1a  (Прочитано 122765 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Снипы R1a
« Ответ #300 : 24 Февраль 2015, 09:06:53 »
Уважаемый Semargl!
На древе где-то рядом с отцом Ya-nina и мой отец (кит 248308).
Какой снип посоветуете заказать ему.
Ранее мне советовали как и для отца Ya-nina  M237.
Задержалась с заказом этого снипа.
Теперь вижу везде в проектах его под этим снипом без вопроса.
Может тоже лучше уже дальше двинуться?
Аналогично предыдущему совету, двумя постами выше. Начните с YP1018.

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +155/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: Снипы R1a
« Ответ #301 : 27 Февраль 2015, 07:36:26 »
На сайте Estonian biocentre в открытом доступе размещены результаты тестирования "307 high coverage human Y chromosome sequences" http://evolbio.ut.ee/chrY/.
В первую очередь наверно надо смотреть вот эту таблицу: http://evolbio.ut.ee/chrY/Y_data_metainfo.xlsx
Как я понял в ней через R1a1a и R1a1b обозначены Z92+, R1a1c - это CTS1211+, R1a1d - это M458+, R1a1e - это Z284+, R1a2 - это Z93+.
Снипы можно смотреть в каждой директории, например, в файлах /ASM/var_chrY-GS00 ...
« Последнее редактирование: 27 Февраль 2015, 07:57:56 от Teresh »

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +155/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: Снипы R1a
« Ответ #302 : 27 Февраль 2015, 13:53:39 »
Если в этих результатах покрытие лучше чем в Big Y, то можно попробовать поискать новые снипы за пределами Big Y.
Конечно речь идет о ветвях, у которых есть что сравнивать. Вот, например, Z92 там много разных. 

Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1696
  • Страна: 00
  • Рейтинг +122/-91
Re: Снипы R1a
« Ответ #303 : 27 Февраль 2015, 14:16:28 »
Если в этих результатах покрытие лучше чем в Big Y, то можно попробовать поискать новые снипы за пределами Big Y.
Конечно речь идет о ветвях, у которых есть что сравнивать. Вот, например, Z92 там много разных.
...я так понимаю, что у FGC почти 100% покрытие Y-хромосомы... не?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Снипы R1a
« Ответ #304 : 05 Март 2015, 10:22:14 »
Сообщение от Mayka:
Цитировать
FTDNA now offers individual SNP tests for:

YP591 - Subclade of YP335 < YP295 < YP234 < YP237 < CTS3402
YP319 - Tree-equivalent to YP314, a subclade of YP315 < S18681 < CTS8816 < Y33 < CTS3402
Для заказа доступны новые снипы YP591 и YP319

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Снипы R1a
« Ответ #305 : 07 Март 2015, 09:54:56 »
Доступен для заказа в FTDNA снип YP1183, маркирующий субклад под YP515 (братская к L1029 ветвь)
 

Оффлайн Виталий77

  • Однодворец ищущий свои корни
  • Сообщений: 1325
  • Страна: ru
  • Рейтинг +362/-0
  • FTDNA: 297613
  • Y-ДНК: R1a-A7015, R1a1a1b1a2b3a1c2c2a1~(ISOGG)
  • мтДНК: H13a1a1c
Re: Снипы R1a
« Ответ #306 : 07 Март 2015, 13:06:07 »
Доступен для заказа в FTDNA снип YP1078, маркирующий субклад под YP578

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Снипы R1a
« Ответ #307 : 10 Март 2015, 20:33:17 »
Под Z93 добавлена новая ветвь, братская к Z94 и YP1451.
Маркируется снипами YP1505, YP1506, YP1507, YP1508
В ветку вошли образцы KyrgzTJ1, KyrgzTJ2, KyrgzTJ3, Altai3, Altai4

Киргизская подветвь, маркируется снипами YP1509, YP1510, YP1511, YP1512, YP1513, YP1514, YP1515, YP1516, YP1517
В ветку вошли образцы KyrgzTJ1, KyrgzTJ2, KyrgzTJ3

Алтайская подветвь, маркируется снипами YP1518, YP1519, YP1520, YP1521, YP1522, YP1523, YP1524, YP1525, YP1526, YP1527, YP1528, YP1529, YP1530, YP1531
В ветку вошли образцы Altai3, Altai4

Оффлайн Елена Александровна

  • Сообщений: 2716
  • Страна: by
  • Рейтинг +608/-2
  • U5a1d2a1 Гедматч - M125805
  • Y-ДНК: R1a1a: отец 248308, сын 260304, дед по маме 249367
  • мтДНК: U5a1d2a1 - я; МЖМЖ U5
Re: Снипы R1a
« Ответ #308 : 11 Март 2015, 13:52:48 »
Спасибо за схему и посоветуйте, как лучше поступить:  кит отца 262816
Результатов мало, так что предсказать почти невозможно. Я бы начал с YP1018.
Уважаемый Semargl!
На древе где-то рядом с отцом Ya-nina и мой отец (кит 248308).
Какой снип посоветуете заказать ему.
Аналогично предыдущему совету, двумя постами выше. Начните с YP1018.
Спасибо за совет!
Заказаны обоим YP1018 02/24/2015   Batch 611
 Срок стоит    4-8 Weeks.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Снипы R1a
« Ответ #309 : 29 Март 2015, 15:12:02 »
Скажите пожалуйста - какие программы использовали при сотворении данных картинок
1) Corel Draw
2) Graphviz

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +155/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: Снипы R1a
« Ответ #310 : 20 Май 2015, 06:29:07 »
В материалах к новой статье http://forum.molgen.org/index.php/topic,8152.msg296703/topicseen.html#msg296703
есть снипы на 25 образцов R1a. Дерево с номерами образцов (которое в приложении) плохо читается, но, похоже, что ork-026m будет M417-, nor-16 и CEU-NA12155 будут Z2461+, gre-15:  F2935+,
bav-26 и hun-39:  YP349+, ser-19, ser-27 и hun-25: Y2902+, den-30: YP977+, hun-28 и hun-35: Y2609+, bav-52: Y12463+, saa-1: YP392+ и т.д.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Снипы R1a
« Ответ #311 : 20 Май 2015, 09:51:21 »
В материалах к новой статье http://forum.molgen.org/index.php/topic,8152.msg296703/topicseen.html#msg296703
есть снипы на 25 образцов R1a. Дерево с номерами образцов (которое в приложении) плохо читается, но, похоже, что ork-026m будет M417-, nor-16 и CEU-NA12155 будут Z2461+, gre-15:  F2935+,
bav-26 и hun-39:  YP349+, ser-19, ser-27 и hun-25: Y2902+, den-30: YP977+, hun-28 и hun-35: Y2609+, bav-52: Y12463+, saa-1: YP392+ и т.д.
Спасибо за оперативную новость.
ser-27 и hun-25 образуют очередную новую ветвь под Y2902. Они имеют два общих снипа.

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +155/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: Снипы R1a
« Ответ #312 : 20 Май 2015, 10:41:50 »
ser-27 и hun-25 образуют очередную новую ветвь под Y2902. Они имеют два общих снипа.
Два снипа под PH3519?
А снипы серии PH откуда, от какой группы?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Снипы R1a
« Ответ #313 : 20 Май 2015, 10:52:20 »
Два снипа под PH3519?
Да.
PH3782 точно ниже, так как отрицательный у #82383.
PH864 может иметь уровень YP1144, так как не покрыт в BigY.
Цитировать
А снипы серии PH откуда, от какой группы?
Pille Hallast et al. (2014)

Оффлайн andronn

  • Сообщений: 418
  • Страна: ua
  • Рейтинг +100/-0
  • 100% European.E.Europe 83%, Finland 14%,S.Europe3%
  • Y-ДНК: R-Z283
Re: Снипы R1a
« Ответ #314 : 11 Июнь 2015, 07:08:05 »
Зашел сегодня на ФТНДА, у меня вместо  R-M512 уже R-Z283, чем это объяснить? Это в принципе одно и тоже, просто маркировка разная, или как?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100