АвторТема: Новички R1a: интерпретация, советы  (Прочитано 1020397 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1331
  • Страна: ua
  • Рейтинг +787/-6
    • http://r1b-pf7562.blogspot.com/
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4410 : 26 Январь 2017, 17:52:45 »
Какие ещё совпаденцы по снипам FTDNA?
Если бы я делал снипы в FTDNA, то моими совпаденцами был бы весь мир ;D
А по снипам YSEQ и данным моего проекта в FTDNA нашлись конкретные совпаденцы.
Сообщив администратору проекта свой снип, оказался в нужном кластере.
Так что снипование в FTDNA - полный отстой :'(

У меня такой же же вопрос. Откуда вы узнали про этот снип? И откуда этот снип оказался у всех остальных в "нужном кластере", они все тоже в YSEQ его делали?

Кстати, что вы понимаете по "конкретными" совпаденцами?

По совпадению гаплотипов с людьми, сделавшими BigY или Y Elite, что ж тут неясно?
Конкретные совпаденцы - люди с моим снипом, опять же - очевидное...

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1936
  • Страна: ru
  • Рейтинг +357/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4411 : 26 Январь 2017, 18:56:02 »
По совпадению гаплотипов с людьми, сделавшими BigY или Y Elite, что ж тут неясно?
Конкретные совпаденцы - люди с моим снипом, опять же - очевидное...

А, понял. То есть вы в FTDNA  сделали мнимальный типа Y37 - а нужные снипы набрали в YSEQ?

P.S. Я не из праздного любопытства спрашиваю. Возможно мне понадобится создать некий сниппак в YSEQ для более глубокого тестирования совпаденцев. 

Оффлайн Панк

  • Сообщений: 1365
  • Страна: ua
  • Рейтинг +673/-1
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4412 : 26 Январь 2017, 19:16:22 »
Прошу добавить в Семаргл
570338   Vasyl Tokar, b. 1926   Ukraine
https://www.familytreedna.com/public/R1a/default.aspx?section=yresults
Добавил.

Спасибо!
Похоже нужно рекомендовать R1a-Z280 SNP pack для определения ветки

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4413 : 26 Январь 2017, 19:18:16 »
P.S. Я не из праздного любопытства спрашиваю. Возможно мне понадобится создать некий сниппак в YSEQ для более глубокого тестирования совпаденцев.
Здесь это оффтоп. Позже надо будет перенести часть сообщений в тему YSeq.
Что касается их-снип паков, то там есть два типа наборов:
1) "Плоский". Тупо тестируются все снипы пакета. Поэтому стоят дороже.
2) С алгоритмом выбора подветвей, если так можно сказать. Делается в два-три шага. Например на первом шаге определяются все основные подветви и снипы верхнего уровня. Вторым шагом тестируется только снипы той подветви, которая показала позитивный результат. То есть в конечном итоге из всего снип-пака проверяют 1/3- 1/2 от всех входящих в него снипов. Такие пакеты дешевле.

И еще. Снип-паки от FTDNA созданы по другой технологии. Чипам характерны их "болезни". Ложные срабатывания и no call часты. Есть много примеров. В результате человек на дереве FTDNA попадает в другой субклад и иногда гаплогруппу. Зато снипов на их чипе вроде может быть около сотни. Практически цена 1 снипа = $1.
В YSeq тестируют по Сангеру. Технология более дорогостоящая, но и значительно более точная. По этой же технологии тестируют в FTDNA одиночные снипы, поэтому у них цена такая высокая по сравнению с панелями снипов. Поэтому FTDNA не желает добавлять одиночные снипы в заказ. Слишком много мороки с созданием праймеров и прочим.
Везде есть свои плюсы и минусы.  ;D

Оффлайн grimsvotn

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6406
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1780/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA-IRL), Proto-Celts?
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4414 : 26 Январь 2017, 19:22:07 »
Прошу добавить в Семаргл
570338   Vasyl Tokar, b. 1926   Ukraine
https://www.familytreedna.com/public/R1a/default.aspx?section=yresults
Добавил.

Спасибо!
Похоже нужно рекомендовать R1a-Z280 SNP pack для определения ветки

Да, самое оптимальное.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4415 : 26 Январь 2017, 19:24:49 »
2) С алгоритмом выбора подветвей, если так можно сказать. Делается в два-три шага. Например на первом шаге определяются все основные подветви и снипы верхнего уровня. Вторым шагом тестируется только снипы той подветви, которая показала позитивный результат. То есть в конечном итоге из всего снип-пака проверяют 1/3- 1/2 от всех входящих в него снипов. Такие пакеты дешевле.
К примеру панель Z280 в YSeq.
Сначала проверяют 4 основных снипа:
CTS1211, Y33, YP237, Z92
По их результатам определяют какой из пяти "подпакетов" тестировать дальше.

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1331
  • Страна: ua
  • Рейтинг +787/-6
    • http://r1b-pf7562.blogspot.com/
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4416 : 26 Январь 2017, 19:27:02 »
По совпадению гаплотипов с людьми, сделавшими BigY или Y Elite, что ж тут неясно?
Конкретные совпаденцы - люди с моим снипом, опять же - очевидное...

А, понял. То есть вы в FTDNA  сделали мнимальный типа Y37 - а нужные снипы набрали в YSEQ?

P.S. Я не из праздного любопытства спрашиваю. Возможно мне понадобится создать некий сниппак в YSEQ для более глубокого тестирования совпаденцев.

Да, именно так - 37 маркеров в FTDNA и снип (один!) в YSEQ, но всё это благодаря администратору проекта Сергею Малышеву :)

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9632
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2927/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4417 : 26 Январь 2017, 21:22:28 »
Прошу добавить в Семаргл
570338   Vasyl Tokar, b. 1926   Ukraine
https://www.familytreedna.com/public/R1a/default.aspx?section=yresults
Добавил.

Спасибо!
Похоже нужно рекомендовать R1a-Z280 SNP pack для определения ветки
Да. Там помимо L1280 еще проверять вглубь из этого субклада снипы: FGC11555, YP611, Y5647, YP1448, FGC19283, YP1701, YP3987, YP3989, YP3992

Оффлайн Панк

  • Сообщений: 1365
  • Страна: ua
  • Рейтинг +673/-1
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4418 : 26 Январь 2017, 21:34:33 »
Спасибо!
Похоже нужно рекомендовать R1a-Z280 SNP pack для определения ветки
Да. Там помимо L1280 еще проверять вглубь из этого субклада снипы: FGC11555, YP611, Y5647, YP1448, FGC19283, YP1701, YP3987, YP3989, YP3992

Неплохое начало для 37 маркеров   :)

Оффлайн Панк

  • Сообщений: 1365
  • Страна: ua
  • Рейтинг +673/-1
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4419 : 27 Январь 2017, 11:14:27 »
Обновите пожалуйста в Семаргле до 67
289562 Zdanowicz  Nicholas Zdanowicz ? Ukraine
https://www.familytreedna.com/public/rurikid/default.aspx?section=yresults

Дистанция  4/67 c Semen Plokhyj, b.c.1650, Olshana, Ukraine

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9632
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2927/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4420 : 27 Январь 2017, 11:23:36 »
Обновите пожалуйста в Семаргле до 67
289562 Zdanowicz  Nicholas Zdanowicz ? Ukraine
https://www.familytreedna.com/public/rurikid/default.aspx?section=yresults

Дистанция  4/67 c Semen Plokhyj, b.c.1650, Olshana, Ukraine
Обновил. Да, похоже YP418+

Оффлайн zea78

  • SevskGen.ru
  • Сообщений: 1548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +755/-3
  • будем искать
  • Y-ДНК: R1a-YP418*
  • мтДНК: U8a1a1b1*
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4421 : 27 Январь 2017, 11:29:44 »
Обновите пожалуйста в Семаргле до 67
289562 Zdanowicz  Nicholas Zdanowicz ? Ukraine
https://www.familytreedna.com/public/rurikid/default.aspx?section=yresults

Дистанция  4/67 c Semen Plokhyj, b.c.1650, Olshana, Ukraine
Обновил. Да, похоже YP418+
Вот так да! Zdanowicz и Plokhyj не родственники? Биг Y планируете?

Оффлайн Панк

  • Сообщений: 1365
  • Страна: ua
  • Рейтинг +673/-1
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4422 : 27 Январь 2017, 13:08:44 »
Обновите пожалуйста в Семаргле до 67
289562 Zdanowicz  Nicholas Zdanowicz ? Ukraine
https://www.familytreedna.com/public/rurikid/default.aspx?section=yresults

Дистанция  4/67 c Semen Plokhyj, b.c.1650, Olshana, Ukraine
Обновил. Да, похоже YP418+
Вот так да! Zdanowicz и Plokhyj не родственники? Биг Y планируете?

Спасибо!
Zdanowicz  только недавно присоединился к нашему проекту
Собираюсь написать ему (куратору) письмо, разузнать что к чему, похоже на куратора иностранца
Может кто-то знает здесь кто его курирует

Маркер стоит в бывшей Кировоградской области

Оффлайн zea78

  • SevskGen.ru
  • Сообщений: 1548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +755/-3
  • будем искать
  • Y-ДНК: R1a-YP418*
  • мтДНК: U8a1a1b1*
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4423 : 27 Январь 2017, 13:25:53 »
Plokhyj относится к YP418* . Результат Zdanowicz и Plokhyj могут дать новую подветвь под YP418 собщими для них снипами.

Оффлайн zea78

  • SevskGen.ru
  • Сообщений: 1548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +755/-3
  • будем искать
  • Y-ДНК: R1a-YP418*
  • мтДНК: U8a1a1b1*
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #4424 : 28 Январь 2017, 01:16:18 »
Внесите в базу Semargl результат из YSEQ.
http://forum.molgen.org/index.php/topic,9548.msg365956.html#msg365956

Итак, #221082: YP728-, YP1013-, YP1137-

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.