АвторТема: Dodecad Ancestry Project  (Прочитано 107077 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн ladybel

  • Сообщений: 207
  • Страна: be
  • Рейтинг +7/-0
  • мтДНК: Т2
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #675 : 24 Март 2014, 15:24:19 »
подскажите где можно скачать оракул для Додекад-9, а то замучилась просто искать
а ещё нормальный оракул для W27 Вадима, для двух популяций
или подскажите как его сделать на основе экселевского файла ))
« Последнее редактирование: 24 Март 2014, 15:53:10 от ladybel »

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #676 : 24 Март 2014, 16:30:09 »
подскажите где можно скачать оракул для Додекад-9, а то замучилась просто искать
а ещё нормальный оракул для W27 Вадима, для двух популяций
или подскажите как его сделать на основе экселевского файла ))
скачать Оракул можно по ссылке в первом сообщении этой темы
Если есть готовый файл excel, то можете попробывать те шаги, что я описал здесь, они подходят для всех кальков.
например, получившийся txt-файл Оракула для k27 (версия ув. Srkz для Восточной Европы):
27 {Quantity of components}
Nilotic-Omotic
Ancestral-South-Indian
North-European-Baltic
Uralic
Australo-Melanesian
East-Siberean
Ancestral-Yayoi
Caucasian-Near-Eastern
Tibeto-Burman
Austronesian
Central-African-Pygmean
Central-African-Hunter-Gatherers
Nilo-Saharian
North-African
Gedrosia-Caucasian
Cushitic
Congo-Pygmean
Bushmen
South-Meso-Amerindian
South-West-European
North-Amerindian
Arabic
North-Circumpolar
Kalash
Papuan-Australian
Baltic-Finnic
Bantu
Abkhasian_S3 0,24 0,75 8,58 2,17 0,27 1,20 0,72 40,79 0,00 0,72 0,05 0,22 0,55 0,50 32,01 1,17 0,00 0,04 0,27 2,68 0,13 2,42 0,47 2,38 0,42 1,25 0,00 100
Ashkenazi_R3 0,20 0,50 13,20 0,50 0,50 0,20 0,50 32,25 0,10 0,30 0,10 0,10 0,10 4,10 12,00 3,00 0,15 0,10 0,10 20,70 0,25 9,35 0,10 0,30 0,10 1,10 0,10 100
Balt_R2 0,00 0,60 59,70 3,87 0,00 0,00 0,00 6,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,70 3,96 0,20 0,00 0,00 0,70 10,69 0,00 1,00 0,00 1,38 0,20 11,00 0,00 100
Bashkir_R3 0,00 0,50 28,93 13,30 0,00 13,00 3,50 6,60 5,70 0,40 0,00 0,10 0,00 0,00 8,10 0,15 0,00 0,25 1,65 5,60 0,90 1,50 1,70 1,97 0,00 6,15 0,00 100
Belarusian_N_S4 0,36 0,91 54,63 2,28 0,47 0,06 0,21 10,22 0,12 0,05 0,00 0,28 0,00 0,65 4,69 0,41 0,00 0,05 0,30 11,89 0,57 1,71 0,11 1,57 0,50 7,96 0,00 100
Belarusian_SE_R3 0,10 0,90 53,10 3,50 0,45 0,10 0,10 10,10 0,15 0,10 0,10 0,10 0,10 0,70 4,60 0,15 0,10 0,10 0,35 11,20 0,35 1,80 0,60 1,80 0,10 9,15 0,10 100
Belarusian_SW_R2 0,35 0,80 51,45 2,32 0,40 0,10 0,20 9,90 0,10 0,10 0,00 0,25 0,00 0,65 4,90 0,50 0,00 0,10 0,30 15,21 0,56 1,59 0,10 2,00 0,50 7,60 0,02 100
British_German_R1 0,21 0,15 28,48 2,40 0,46 0,20 0,00 9,93 0,00 0,00 0,00 0,22 0,00 1,43 11,33 0,30 0,00 0,51 0,09 31,35 0,16 0,58 0,00 1,79 0,00 10,41 0,00 100
Bulgarian_S14 0,07 0,72 30,09 1,47 0,35 0,24 0,06 24,20 0,19 0,23 0,04 0,26 0,08 1,85 9,26 0,74 0,11 0,02 0,19 19,80 0,39 4,01 0,40 1,22 0,24 3,77 0,00 100
Carpathian_R1 0,00 0,00 41,00 2,70 0,30 0,00 1,00 18,80 0,00 0,05 0,05 0,20 0,05 1,20 5,60 0,25 0,05 0,05 0,25 19,50 0,05 2,30 0,25 1,30 0,00 5,00 0,05 100
Chuvash_R4 0,32 1,12 34,27 19,01 0,06 9,99 0,06 6,21 2,47 1,05 0,00 0,25 0,00 1,17 6,06 0,03 0,36 0,00 0,40 4,72 0,64 0,55 1,33 1,43 0,45 8,05 0,00 100
Croatian_S11 0,23 0,42 38,64 1,14 0,45 0,14 0,00 19,37 0,24 0,12 0,07 0,15 0,00 1,01 7,35 0,35 0,00 0,04 0,32 20,41 0,28 2,88 0,19 1,24 0,37 4,52 0,07 100
English_R2 0,11 0,11 33,00 2,50 0,11 0,12 0,12 8,40 0,11 0,11 0,11 0,11 0,11 1,00 9,80 0,11 0,11 0,11 0,11 33,50 0,11 0,70 0,11 1,60 0,11 7,50 0,11 100
Erzya_R4 0,15 0,50 46,80 7,40 0,00 3,35 0,65 9,00 0,50 0,30 0,10 0,10 0,30 0,80 5,60 0,00 0,00 0,00 0,10 10,00 1,10 1,15 0,80 1,10 0,10 10,10 0,00 100
Estonian_S4 0,20 1,50 52,91 0,84 0,27 0,57 0,00 1,33 0,05 0,46 0,00 0,17 0,34 0,83 1,88 1,21 0,13 0,08 0,23 7,56 0,23 1,77 0,41 0,85 0,27 25,91 0,00 100
Finnish_Inkeri_R2 0,00 0,80 33,20 5,00 0,20 0,40 0,40 2,30 0,20 0,40 0,00 0,00 0,00 0,00 2,25 0,00 0,00 0,00 0,25 4,80 0,70 1,30 0,80 0,80 0,20 46,00 0,00 100
Finnish_North_East_R2 0,00 0,60 28,70 3,50 0,20 1,15 0,20 4,25 0,20 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 2,90 0,00 0,00 0,00 0,50 3,80 0,50 1,00 1,00 0,50 0,00 51,00 0,00 100
Finnish_South_West_R3 0,05 0,30 31,80 4,23 0,19 0,24 0,30 2,73 0,17 0,15 0,10 0,31 0,00 0,51 4,36 0,31 0,10 0,10 0,43 10,12 0,10 0,56 0,66 0,96 0,25 40,97 0,00 100
German_R2 0,49 0,87 31,03 1,67 0,48 0,09 0,00 10,36 0,25 0,03 0,00 0,11 0,00 0,98 11,10 0,45 0,05 0,49 0,35 29,11 0,15 0,15 0,24 1,78 0,50 9,12 0,15 100
Irish_Scottish_R2 0,20 0,10 33,50 1,40 0,10 0,10 0,10 5,05 0,10 0,10 0,10 0,15 0,10 0,10 11,15 0,30 0,10 0,10 0,10 36,35 0,10 0,20 0,10 1,80 0,10 8,30 0,10 100
Kazakh_R2 0,13 1,67 9,50 4,20 0,10 22,60 11,30 5,90 19,80 0,70 0,10 0,10 0,00 0,20 10,60 0,00 0,00 0,00 1,00 4,10 1,00 1,30 2,20 1,50 0,50 1,50 0,00 100
Komi_R1 0,00 1,00 41,10 16,40 0,50 7,60 0,00 6,00 0,00 1,00 0,00 0,00 0,00 0,40 5,50 0,00 0,00 0,00 0,00 5,50 1,00 1,55 2,00 0,70 0,00 9,75 0,00 100
Korean_R1 0,00 0,00 0,00 0,00 0,35 8,35 42,95 0,00 38,30 8,65 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 1,40 0,00 0,00 0,00 0,00 100
Kumyk_S3 0,40 0,71 16,96 3,01 0,20 2,39 0,97 26,75 1,42 0,00 0,10 0,46 0,00 0,23 29,34 0,72 0,46 0,10 1,13 3,94 0,37 4,11 0,60 3,15 0,15 2,32 0,01 100
Lezgin_S3 0,14 1,55 15,91 3,45 0,34 0,84 0,12 24,77 0,29 0,23 0,13 0,32 1,66 0,30 32,81 0,98 0,03 0,17 0,84 4,18 0,31 3,86 0,24 3,87 0,40 2,22 0,04 100
Mansi_D 0,00 0,48 28,83 23,54 0,00 18,25 0,48 2,88 2,40 0,00 0,00 0,00 0,00 0,38 4,32 0,00 0,00 0,00 0,77 3,84 1,15 0,58 2,88 1,54 0,00 7,68 0,00 100
Mari_R2 0,30 0,57 34,94 25,91 0,00 11,71 0,50 4,02 2,90 0,24 0,00 0,10 0,00 0,70 3,93 0,00 0,00 0,00 0,40 2,00 0,58 0,50 1,70 2,00 0,30 6,70 0,00 100
Mishar-D_R2 0,10 1,20 37,00 8,30 0,25 5,55 1,70 10,60 2,90 0,65 0,00 0,10 0,00 0,65 7,85 0,25 0,25 0,10 0,00 8,00 0,50 1,30 1,15 1,00 0,60 10,00 0,00 100
Mishar-N_R1 0,10 0,50 36,80 6,90 0,10 6,80 2,80 10,70 4,50 0,30 0,00 0,30 0,20 1,00 7,50 0,50 0,15 0,00 0,00 9,70 1,00 1,40 0,80 1,15 0,50 6,30 0,00 100
Moksha_R3 0,00 0,65 46,65 5,75 0,35 2,30 0,50 8,80 0,65 0,50 0,05 0,50 0,05 1,00 7,30 0,40 0,10 0,10 1,20 10,00 0,50 1,10 1,40 1,20 0,20 8,70 0,05 100
Moldavian_S3 0,48 1,04 36,88 2,78 0,15 0,28 0,11 17,38 0,37 0,69 0,48 0,54 0,00 0,98 7,30 1,00 0,32 0,16 0,54 17,76 0,07 2,23 0,38 1,09 0,54 5,82 0,63 100
Nogay_D 0,50 0,60 14,35 3,60 0,10 9,50 6,00 22,00 8,50 0,20 0,10 0,25 0,50 0,25 20,40 0,80 0,05 0,05 0,70 4,50 0,25 1,10 1,20 1,50 0,90 2,00 0,10 100
Norwegian_R4 0,06 0,19 35,63 2,46 0,40 0,00 0,00 4,71 0,00 0,11 0,13 0,32 0,13 0,76 9,22 0,00 0,00 0,04 0,12 30,67 0,13 0,07 0,35 2,40 0,35 11,58 0,17 100
Permyak_D 0,00 1,00 38,55 19,20 0,25 6,20 1,05 5,50 0,35 0,54 0,04 0,04 0,04 0,55 6,65 0,00 0,00 0,00 0,75 6,60 0,75 1,28 2,15 1,10 0,03 7,38 0,03 100
Polish_German_R1 0,35 1,24 37,15 2,15 0,35 0,14 0,14 8,55 0,65 0,25 0,14 0,14 0,14 0,14 9,45 0,14 0,14 0,35 0,25 25,05 0,40 1,15 0,70 1,15 0,14 9,41 0,14 100
Polish_S13 0,23 0,43 51,03 2,58 0,22 0,06 0,01 10,53 0,15 0,12 0,09 0,18 0,26 0,45 4,83 0,19 0,05 0,18 0,57 16,29 0,27 1,16 0,10 1,49 0,23 8,29 0,01 100
Romanian_D 0,00 3,00 28,20 1,35 0,35 0,30 0,00 26,00 0,25 0,25 0,00 0,30 0,10 2,00 9,80 0,90 0,10 0,00 0,20 17,10 0,40 4,10 0,40 1,30 0,30 3,30 0,00 100
Russian_Center 0,18 1,09 50,23 4,19 0,58 0,76 0,15 9,34 0,15 0,14 0,14 0,21 0,15 0,70 4,56 0,14 0,18 0,14 0,51 12,11 0,51 1,29 0,18 1,54 0,18 10,52 0,13 100
Russian_Ladoga_D 0,20 1,40 44,00 6,00 0,90 1,10 0,30 4,90 0,15 0,30 0,15 0,15 0,15 0,15 4,95 0,15 0,15 0,15 0,15 9,50 0,70 1,00 1,10 1,00 0,15 21,00 0,15 100
Russian_Meshtchyora_R5 0,10 1,72 49,50 4,95 0,35 0,60 0,70 8,70 0,25 0,20 0,10 0,10 0,10 0,80 4,85 0,50 0,10 0,10 0,40 11,20 0,60 1,29 0,37 1,54 0,30 10,58 0,00 100
Russian_North_R8 0,02 0,70 46,00 6,75 0,17 2,45 0,38 6,60 0,25 0,50 0,10 0,10 0,00 0,50 4,35 0,60 0,00 0,00 0,09 10,40 0,40 1,00 0,80 1,60 0,20 16,04 0,00 100
Russian_Perm_R3 0,00 2,00 42,00 8,90 0,35 4,15 0,00 5,70 0,50 0,00 0,20 0,00 0,00 0,55 5,65 0,30 0,00 0,00 0,00 10,50 0,90 0,70 0,90 1,70 0,00 15,00 0,00 100
Russian_Pskov_R3 0,18 1,09 55,50 4,20 0,37 0,00 0,00 6,60 0,00 0,14 0,14 0,21 0,15 0,70 2,85 0,14 0,18 0,14 0,20 11,00 0,70 1,29 0,00 1,54 0,18 12,50 0,00 100
Russian_South_R3 0,00 0,50 51,30 2,80 0,30 0,80 0,00 13,00 0,10 0,10 0,00 0,05 0,00 0,70 3,80 0,10 0,10 0,01 0,10 13,50 0,25 1,63 0,18 2,00 0,18 8,50 0,00 100
Russian_South_West_R7 0,24 1,24 49,64 3,64 0,74 0,14 0,14 10,06 0,14 0,14 0,14 0,14 0,14 0,84 4,54 0,44 0,14 0,14 0,44 13,04 0,14 1,34 0,44 1,94 0,14 9,74 0,14 100
Russian_Vyatka_R2 0,15 1,00 46,00 7,80 0,35 4,20 0,20 8,00 0,30 0,00 0,25 0,20 0,20 1,00 3,75 0,15 0,10 0,00 0,00 9,50 1,50 0,50 0,20 1,70 0,05 12,90 0,00 100
Russian_Yaroslavl_R2 0,00 1,10 49,70 5,50 0,20 1,35 0,00 8,35 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,50 5,50 0,00 0,00 0,00 0,40 10,15 0,60 1,50 0,50 0,65 0,00 14,00 0,00 100
Selkup_P_R1 0,10 0,10 17,20 26,10 0,50 28,10 1,00 0,30 5,80 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 2,95 0,05 0,00 0,00 3,75 0,00 0,40 0,00 4,75 1,90 0,30 6,70 0,00 100
Selkup_S2 0,00 1,39 5,76 35,47 0,88 41,94 0,00 0,00 2,66 0,14 0,00 0,00 0,00 0,00 1,37 0,28 0,10 0,00 0,86 0,00 2,08 0,00 3,41 1,04 0,60 2,03 0,00 100
Serbian_R1 0,00 0,00 32,60 1,70 0,10 0,00 0,00 25,25 0,07 0,00 0,00 0,00 0,00 1,00 8,60 0,90 0,00 0,00 0,00 20,50 0,00 4,52 0,25 0,76 0,00 3,75 0,00 100
Sicilian_R2 0,25 0,22 10,94 0,00 0,03 0,00 0,00 31,52 0,00 0,50 0,54 0,40 0,00 5,46 12,53 2,70 0,00 0,00 0,00 22,51 0,26 9,98 0,00 1,50 0,32 0,36 0,00 100
Slovak_D 0,15 0,95 42,00 2,00 0,50 0,10 0,10 13,00 0,20 0,20 0,05 0,20 0,05 1,30 6,50 0,50 0,20 0,20 0,20 20,00 0,40 3,00 0,30 1,30 0,20 6,30 0,10 100
Tatar_Bashkiria_R3 0,10 1,07 35,61 7,90 0,00 6,60 0,75 10,60 4,45 0,80 0,00 0,13 0,10 0,66 8,72 0,15 0,10 0,10 0,55 9,86 1,20 1,00 0,20 1,50 0,10 7,75 0,00 100
Tatar_R5 0,10 1,30 35,50 8,60 0,25 7,10 2,00 9,60 3,85 0,70 0,00 0,20 0,00 1,00 8,70 0,25 0,25 0,10 0,30 7,70 1,00 2,10 1,00 0,90 0,55 6,95 0,00 100
Udmurt_R1 0,00 1,00 36,00 22,00 0,00 4,80 2,10 5,00 0,70 0,07 0,07 0,07 0,07 0,70 7,80 0,00 0,00 0,00 1,50 7,70 0,50 1,00 2,30 1,50 0,06 5,00 0,06 100
Ukrainian_East_R4 0,07 0,55 50,95 2,70 0,25 0,60 0,20 11,75 0,15 0,25 0,05 0,20 0,05 0,75 4,10 0,15 0,07 0,05 0,15 14,40 0,15 2,10 0,15 1,85 0,20 8,10 0,01 100
Ukrainian_R2 0,18 0,40 48,00 3,00 0,10 0,50 0,50 12,60 0,20 0,20 0,10 0,10 0,10 1,00 5,30 0,20 0,20 0,05 0,20 15,50 0,40 1,70 0,30 1,60 0,05 7,50 0,02 100
Ukrainian_West_R2 0,25 0,50 45,50 2,60 0,25 0,20 0,20 12,90 0,20 0,15 0,15 0,20 0,25 1,10 6,30 0,20 0,15 0,20 0,55 15,90 0,25 1,40 0,15 1,55 0,25 8,50 0,15 100

Оффлайн ladybel

  • Сообщений: 207
  • Страна: be
  • Рейтинг +7/-0
  • мтДНК: Т2
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #677 : 24 Март 2014, 16:35:09 »
скачать Оракул можно по ссылке в первом сообщении этой темы
нужного оракула в этой теме нет, был бы не спрашивала бы. Может ссылку прямо на него дадите?
если нет то помучаюсь, сделаю как вы описали

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #678 : 24 Март 2014, 16:45:33 »
скачать Оракул можно по ссылке в первом сообщении этой темы
нужного оракула в этой теме нет, был бы не спрашивала бы. Может ссылку прямо на него дадите?
если нет то помучаюсь, сделаю как вы описали
сама програма "оракула четырех предков" там есть (в том числе, вместе с расчетом по двум популяциям), вот прямая ссылка на скачивание.
там "работы" буквально минуты на 3 =) или просто скопируйте в блокнот то, что запостил я, сохраните, запустите Admix4_097, он Вам предложит открыть исходный .txt (в нашем случае для k27), который Вы будете использовать, потом задайте значения по компонентам, нажмите "Go!" и в файле Output будут Ваши результаты.
ЗЫ я не знаю, работали ли Вы раньше с Оракулом "вручную", поэтому описал  все шаги)

Оффлайн ladybel

  • Сообщений: 207
  • Страна: be
  • Рейтинг +7/-0
  • мтДНК: Т2
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #679 : 24 Март 2014, 16:51:34 »
сама програма "оракула четырех предков" там есть (в том числе, вместе с расчетом по двум популяциям), вот прямая ссылка на скачивание.
там "работы" буквально минуты на 3 =) или просто скопируйте в блокнот то, что запостил я, сохраните, запустите Admix4_097, он Вам предложит открыть исходный .txt (в нашем случае для k27), который Вы будете использовать, потом задайте значения по компонентам, нажмите "Go!" и в файле Output будут Ваши результаты.
ЗЫ я не знаю, работали ли Вы раньше с Оракулом "вручную", поэтому описал  все шаги)
та программа что вы дали у меня не открывается(( winzip не имеется, может она у вас есть в WinRAR? 
Я работаю в R, текстовый файл уже сделала, как его теперь занести в R?
кстати у вашего оракула всего 27 популяций а то что я ищу содержит 250))
теперь понятно почему последний настолко маленькие дистанции имеет
« Последнее редактирование: 24 Март 2014, 16:58:18 от ladybel »

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #680 : 24 Март 2014, 17:00:21 »
та программа что вы дали у меня не открывается(( это какое расширение?
Я работаю в R, текстовый файл уже сделала, как его теперь занести в R?
Файл самой программы, что в архиве, Admix4_097.ехе.
Поработать с оракулом через R я не пробывал)) там, по идее, нужно самому код написать, хотя, не уверен)

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #681 : 24 Март 2014, 17:04:19 »
кстати у вашего оракула всего 27 популяций а то что я ищу содержит 250))
теперь понятно почему последний настолко маленькие дистанции имеет
кликните в excel снизу на "Verenich", там за 400 популяций будет=)
27 - это количество предковых компонентов

Оффлайн ladybel

  • Сообщений: 207
  • Страна: be
  • Рейтинг +7/-0
  • мтДНК: Т2
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #682 : 24 Март 2014, 17:33:26 »
потом задайте значения по компонентам, нажмите "Go!" и в файле Output будут Ваши результаты.


не работает хотя я все ввела
а как мне без R получить мои значения по компонентам в К27? На ссылке в самой первой теме, где калькулятор Вадима Веренича Бета К27, нет расширения .par
цитирую "Для других калькуляторов название командного файла .par будет, соответственно, другим"
и вообще, первая тема была почти полностью разобрана для случая с R, так почему же я не могу найти ни файлы .par ни оракулы с расширением .Rdata?
« Последнее редактирование: 24 Март 2014, 17:42:13 от ladybel »

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #683 : 24 Март 2014, 17:51:28 »
не работает хотя я все ввела
а как мне без R получить мои значения по компонентам в К27? На ссылке в самой первой теме, где калькулятор Вадима Веренича Бета К27, нет расширения .par
цитирую "Для других калькуляторов название командного файла .par будет, соответственно, другим"
и вообще, первая тема была почти полностью разобрана для случая с R, так почему же я не могу найти ни файлы .par ни оракулы с расширением .Rdata?
не работает, а что пишет? я проверил то, что запостил выше для k27, все считает.
по компонентам, в отсутствии gedmatch, только через R, но я говорил о программе "Оракул", да и той теме не только об R - разбирается и собственно Оракул четырех предков, коим я и пользовался:
Цитировать
Кстати, долгожданный графический интерфейс готов. Сделал его отдельной программой. При запуске нужно выбрать используемый калькулятор (путем указания файла с данными популяций) и потом ввести значения для конкретного человека.
После нажатия на кнопку "Go!" будет сгенерирован input.txt и запустится внешняя программа расчетов.
Можно одновременно запускать несколько для разных данных одного калькулятора (так как input.txt читается только в момент начала расчетов). Естественно, выходные файлы указывать разными. Смотреть их все так же -блокнотом.

ЗЫ чтобы не мучиться с Оракулом через R, можете скинуть мне Ваши значения по компонентам для k27, я попробую прогнать их у себя)

Оффлайн ladybel

  • Сообщений: 207
  • Страна: be
  • Рейтинг +7/-0
  • мтДНК: Т2
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #684 : 24 Март 2014, 17:55:47 »


ЗЫ чтобы не мучиться с Оракулом через R, можете скинуть мне Ваши значения по компонентам для k27, я попробую прогнать их у себя)
а где я возму эти значения?? Мне бы их сначала посчитать, но я умею только через R

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #685 : 24 Март 2014, 18:01:26 »


ЗЫ чтобы не мучиться с Оракулом через R, можете скинуть мне Ваши значения по компонентам для k27, я попробую прогнать их у себя)
а где я возму эти значения?? Мне бы их сначала посчитать, но я умею только через R
Я так понял, что значения для предковых компонентов Вы уже посчитали в R)
не работает хотя я все ввела
вот то, что вводили (для Nilotic-Omotic, Ancestral-South-Indian, North-European-Baltic, Uralic, Australo-Melanesian,East-Siberean etc.) мне и скиньте=)

Оффлайн ladybel

  • Сообщений: 207
  • Страна: be
  • Рейтинг +7/-0
  • мтДНК: Т2
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #686 : 24 Март 2014, 18:12:53 »



Я так понял, что значения для предковых компонентов Вы уже посчитали в R)
вот то, что вводили (для Nilotic-Omotic, Ancestral-South-Indian, North-European-Baltic, Uralic, Australo-Melanesian,East-Siberean etc.) мне и скиньте=)
То что я посчитала в R были результаты Dodecad World9, а для него нет оракула, а только текст файл что я составила по вашему методу, но программа не работает, она просто останавливается;
потом, я решила проверить по МЛДП К27, но тут у меня самого калькулятора нет. Потому и спрашиваю, где взять файл .par для R

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6130
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2778/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #687 : 24 Март 2014, 18:16:33 »
цитирую "Для других калькуляторов название командного файла .par будет, соответственно, другим"
и вообще, первая тема была почти полностью разобрана для случая с R, так почему же я не могу найти ни файлы .par ни оракулы с расширением .Rdata?
Файл test.par должен быть в архиве по ссылке, я проверил. Исходный оракул действительно не добавлял, так как он будет выдавать заведомо неверный результат.

Оффлайн ladybel

  • Сообщений: 207
  • Страна: be
  • Рейтинг +7/-0
  • мтДНК: Т2
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #688 : 24 Март 2014, 18:26:31 »
цитирую "Для других калькуляторов название командного файла .par будет, соответственно, другим"
и вообще, первая тема была почти полностью разобрана для случая с R, так почему же я не могу найти ни файлы .par ни оракулы с расширением .Rdata?
Файл test.par должен быть в архиве по ссылке, я проверил. Исходный оракул действительно не добавлял, так как он будет выдавать заведомо неверный результат.
я нашла этот файл, не знала что он относится к К27, но все, равно -
system('DIYDodecadWin test.par') выдает
At line 113 of file DIYDodecad.f90 file: "test.txt"
Traceback: not available, compile with -ftrace=frame or -ftrace=full
Fortran runtime error: The system cannot find the file specified.


Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Dodecad Ancestry Project
« Ответ #689 : 24 Март 2014, 23:01:18 »
я нашла этот файл, не знала что он относится к К27, но все, равно -
system('DIYDodecadWin test.par') выдает
At line 113 of file DIYDodecad.f90 file: "test.txt"
Traceback: not available, compile with -ftrace=frame or -ftrace=full
Fortran runtime error: The system cannot find the file specified.
когда запускал на Висте, у меня с этим кальком была та же ошибка, что и у Вас, сейчас попробывал на Windows 7, все работает - попробуйте запустить на другой системе (проблема может быть не только в самой ОС).

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100