The Y-chromosome landscape of the Philippines: extensive heterogeneity and varyi

[mouglley]

The Y-chromosome landscape of the Philippines: extensive heterogeneity and varying genetic affinities of Negrito and non-Negrito groups Frederick Delfin, Jazelyn M Salvador, Gayvelline C Calacal, Henry B Perdigon, Kristina A Tabbada, Lilian P Villamor, Saturnina C Halos, Ellen Gunnarsd?ttir, Sean Myles, David A Hughes, Shuhua Xu, Li Jin, Oscar Lao, Manfred Kayser, Matthew E Hurles, Mark Stoneking and Maria Corazon A De Ungria

Abstract

The Philippines exhibits a rich diversity of people, languages, and culture, including so-called ‘Negrito’ groups that have for long fascinated anthropologists, yet little is known about their genetic diversity. We report here, a survey of Y-chromosome variation in 390 individuals from 16 Filipino ethnolinguistic groups, including six Negrito groups, from across the archipelago. We find extreme diversity in the Y-chromosome lineages of Filipino groups with heterogeneity seen in both Negrito and non-Negrito groups, which does not support a simple dichotomy of Filipino groups as Negrito vs non-Negrito. Filipino non-recombining region of the human Y chromosome lineages reflect a chronology that extends from after the initial colonization of the Asia-Pacific region, to the time frame of the Austronesian expansion. Filipino groups appear to have diverse genetic affinities with different populations in the Asia-Pacific region. In particular, some Negrito groups are associated with indigenous Australians, with a potential time for the association ranging from the initial colonization of the region to more recent (after colonization) times. Overall, our results indicate extensive heterogeneity contributing to a complex genetic history for Filipino groups, with varying roles for migrations from outside the Philippines, genetic drift, and admixture among neighboring groups.

Есть гаплогруппа NO

[Centurion]

Есть гаплогруппа NO

Кажется это просто NO(xO). Значит может быть и NO и N.

[Asmat headhunter]

Кажется это просто NO(xO). Значит может быть и NO и N.

Как отличить парагруппу от недотипа?

[Centurion]

Кажется это просто NO(xO). Значит может быть и NO и N.

Как отличить парагруппу от недотипа?

По набору типированных маркеров. Если бы они типировали N-M231 наряду с O-M175, тогда это была бы NO(xN,O)-M214.

[mouglley]

Есть гаплогруппа NO

Кажется это просто NO(xO). Значит может быть и NO и N.

Скорее всего, да.
Причём туда подсунуть могли и недотипованных O.

[Centurion]

Причём туда подсунуть могли и недотипованных O.

Нет, не могли. M175 как раз "на входе" маркирует O.

[wertner]

K-M9 похоже тут xNOP, т.е. включает не только K*, K1-4 но и L, M, S, T.

[mouglley]

Нет, не могли. M175 как раз "на входе" маркирует O.

Насколько я понимаю, на данный момент  входных 4 снипа M175, P186, P191, P196
http://ytree.ftdna.com/index.php?name=Draft
http://isogg.org/tree/ISOGG_YDNATreeTrunk09.html

Тестиповали по одному.

Неужели уже появилась информация, что самым входным является M175?
А остальные - более поздние.
Пока об этом не слышал.

Аналогично по NO - 6 снипов: M214, P188, P192, P193, P194, P195.

В качестве анекдота:
Посмотрите на мою подпись и увидете: P188(rs16980610)-
Абсолютно также у каждого N1 (N1*, N1b, N1c1*)  в 23andMe. У нас, как и у всех, кроме O там G, а у O - A.

Значит, P188 - уже маркер гаплогруппы O.

Отсюда вывод: пока гаплогруппу O не привяжут только к M175, мы можем иметь в данной работе как недотипованные O на промежутке между M214 и M175 носителей следующих снипов:
P188, P192, P193, P194, P195 (из NO)
P186, P191, P196 (из O)