АвторТема: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы  (Прочитано 10251 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн MikSa

  • Сообщений: 234
  • Страна: by
  • Рейтинг +46/-1
  • Соколовские герба Холева
  • Y-ДНК: I-А2423
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #15 : 01 Октябрь 2014, 14:36:42 »
Подскажите, насколько достоверным можно считать результат калькулятора на предмет, что именно Н2, а не другие варианты Н:
1) H2a2a1

Defining Markers for haplogroup H2a2a1:
HVR2:
CR:
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ (309.1C) (315.1C) 325T 522.1A 522.2C 16320T

Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Extras(4): (309.1C) (315.1C) 325T 522.1A 522.2C 16320T

В фак на сайте указано, что наличие "экстра" маркеров "имеет сильное отрицательное влияние на результат".
« Последнее редактирование: 01 Октябрь 2014, 21:48:46 от MikSa »

Оффлайн rodoslov

  • rodoslov
  • Сообщений: 11
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Экзамен для меня всегда праздник, профессор!
    • сайт Мурманского родословного общества
  • Y-ДНК: R1a-CTS3402+
  • мтДНК: C4a1
Друзья, подскажите: у меня Haplogroup C, kit # 229583
HVR1: 16129A, 16213A, 16223T, 16298C, 16327T
HVR2: 73G, 195C, 249-, 309.1C, 309.2C, 315.1C, 489C
Малороссы юга Острогожского уезда Воронежской губернии.
- - - - - - - - - - - - -
- Калькулятор выдал, что у меня C4a1.
Посоветуйте, что ещё можно сделать (или проанализировать)?

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2040
  • Страна: ru
  • Рейтинг +412/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Поясните, пожалуйста.
Прокрутил через утилиту 5 результатов. По 4 получил конкретные результаты с указанием подгрупп: U3b1, H5a, H1c и еще одна U3b1. А вот пятый результат неопределенный. Митогруппа H без указания подгруппы. Вот что выдала утилита. Это не полная информация там под номером 1) еще 12 вариантов:

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 4769G 8860G 11665T
HVR1: 16354T (16519C)

IMPORTANT NOTE: The above marker list is almost certainly incomplete due to limitations of genotyping technology and is not comparable to mtDNA sequencing results. It should not be used with services or tools that expect sequencing results, such as mitosearch.


Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H

Defining Markers for haplogroup H:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 4769G 8860G 15326G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 11665T 16354T (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(5): 263G 750G 1438G 4769G 8860G
Extras(2): 11665T 16354T (16519C)
Untested(1): 15326


1) H50

Defining Markers for haplogroup H50:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 4769G 8860G 14831A 15326G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H50 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 14831A ⇨ H50 ⇨ 11665T 16354T (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(5): 263G 750G 1438G 4769G 8860G
Extras(2): 11665T 16354T (16519C)
Untested(2): 14831 15326

и т.д.
Все результаты из 23andme. И везде Found 3270 markers at 3268 positions covering 19.7% of mtDNA. Получается с пятым результатом не повезло, и по имеющимся данным точно установить подгруппу нельзя?

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1978
  • Страна: ru
  • Рейтинг +345/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Обратите внимание, James Lick апгрейдил свою утилиту.

http://vps1.jameslick.com/dna/mthap/

Ссылка не работает?

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 797
  • Страна: ru
  • Рейтинг +252/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
AlexanderK, попробуйте эту:
https://dna.jameslick.com/mthap/

Оффлайн Ustimov

  • Сообщений: 154
  • Страна: ru
  • Рейтинг +17/-1
  • Y-ДНК: I2a1b2a1
  • мтДНК: V1a
AlexanderK, попробуйте эту:
https://dna.jameslick.com/mthap/
Загружаю митогеном от 23иЯ. Выдает ошибку.

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 797
  • Страна: ru
  • Рейтинг +252/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Ustimov, какого рода ошибку? Вы предварительно распаковали файл с данными mtDNA из архива?

Оффлайн Ustimov

  • Сообщений: 154
  • Страна: ru
  • Рейтинг +17/-1
  • Y-ДНК: I2a1b2a1
  • мтДНК: V1a
 ::) нет конечно. Пардон.

И как же правильно прочесть?
HVR2: 73G 263G 489C
CR: 750G 1438G 2706G 3010A 4769G 4883T 5178A 6962A 7028T 8414T 8860G 9540C 10398G 10400T 10873C 11719A 12705T 14668T 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G
HVR1: 16223T 16278T 16295T 16362C

IMPORTANT NOTE: The above marker list is almost certainly incomplete due to limitations of genotyping technology and is not comparable to mtDNA sequencing results. It should not be used with services or tools that expect sequencing results, such as mitosearch.


Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) D4g1

Defining Markers for haplogroup D4g1:
HVR2: 73G 263G 489C 573.1C
CR: 750G 1438G 2706G 3010A 4343G 4769G 4883T 5178A 7028T 8414T 8860G 9540C 10398G 10400T 10873C 11719A 12705T 13104G 14668T 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 15518T
HVR1: 16223T 16278T 16362C

Marker path from rCRS to haplogroup D4g1 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 8701G 9540C 10398G 10873C 15301A ⇨ L3 ⇨ 489C 10400T 14783C 15043A ⇨ M ⇨ 4883T ⇨ M80'D ⇨ 5178A 16362C ⇨ D ⇨ 3010A 8414T 14668T ⇨ D4 ⇨ 13104G ⇨ D4g ⇨ 573.1C 4343G 8701A 15518T 16278T ⇨ D4g1 ⇨ 6962A 16295T

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(29): 73G 263G 489C 750G 1438G 2706G 3010A 4769G 4883T 5178A 7028T 8414T 8701A 8860G 9540C 10398G 10400T 10873C 11719A 12705T 14668T 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 16223T 16278T 16362C
Extras(2): 6962A 16295T
No-Calls(1): 13104G
Untested(3): 573.1 4343 15518


2) D4g1b

Defining Markers for haplogroup D4g1b:
HVR2: 73G 263G 489C 573.1C
CR: 750G 1438G 2706G 3010A 4343G 4769G 4883T 5178A 7028T 8414T 8860G 9004T 9540C 10398G 10400T 10873C 11719A 12705T 13104G 13512G 14668T 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 15518T
HVR1: 16223T 16278T 16362C

Marker path from rCRS to haplogroup D4g1b (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 8701G 9540C 10398G 10873C 15301A ⇨ L3 ⇨ 489C 10400T 14783C 15043A ⇨ M ⇨ 4883T ⇨ M80'D ⇨ 5178A 16362C ⇨ D ⇨ 3010A 8414T 14668T ⇨ D4 ⇨ 13104G ⇨ D4g ⇨ 573.1C 4343G 8701A 15518T 16278T ⇨ D4g1 ⇨ 9004T 13512G ⇨ D4g1b ⇨ 6962A 16295T

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(29): 73G 263G 489C 750G 1438G 2706G 3010A 4769G 4883T 5178A 7028T 8414T 8701A 8860G 9540C 10398G 10400T 10873C 11719A 12705T 14668T 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 16223T 16278T 16362C
Extras(2): 6962A 16295T
No-Calls(1): 13104G
Untested(5): 573.1 4343 9004 13512 15518


3) D4g1c

Defining Markers for haplogroup D4g1c:
HVR2: 73G 263G 489C 573.1C
CR: 709A 750G 1438G 2706G 3010A 4343G 4769G 4883T 5178A 7028T 8414T 8860G 9540C 10398G 10400T 10873C 11719A 12705T 13104G 14668T 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 15518T
HVR1: 16223T 16278T 16362C

Marker path from rCRS to haplogroup D4g1c (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 8701G 9540C 10398G 10873C 15301A ⇨ L3 ⇨ 489C 10400T 14783C 15043A ⇨ M ⇨ 4883T ⇨ M80'D ⇨ 5178A 16362C ⇨ D ⇨ 3010A 8414T 14668T ⇨ D4 ⇨ 13104G ⇨ D4g ⇨ 573.1C 4343G 8701A 15518T 16278T ⇨ D4g1 ⇨ 709A ⇨ D4g1c ⇨ 6962A 16295T

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(29): 73G 263G 489C 750G 1438G 2706G 3010A 4769G 4883T 5178A 7028T 8414T 8701A 8860G 9540C 10398G 10400T 10873C 11719A 12705T 14668T 14766T 14783C 15043A 15301A 15326G 16223T 16278T 16362C
Mismatches(1): 709G
Extras(2): 6962A 16295T
No-Calls(1): 13104G
Untested(3): 573.1 4343 15518

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1978
  • Страна: ru
  • Рейтинг +345/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
AlexanderK, попробуйте эту:
https://dna.jameslick.com/mthap/

Да, спасибо, все работает. Я правда загружал файл FASTA из FTDNA но сейчас попробую что он скажет про файл из 23andMe

Оффлайн rpolonskiy

  • Сообщений: 265
  • Страна: ua
  • Рейтинг +106/-2
  • Y-ДНК: I2a1b2a1b (CTS10228+ Y4460+ A6106+)
  • мтДНК: С5с1
Узнать свою Mt-гаплогруппу (и Y-гаплогруппу тоже) можно на этом сайте: https://www.wegene.com/en/.
Raw-data скачивать и загружать не нужно. Достаточно просто ввести свои логин и пароль с 23&Me или Ancestry.com

P.S. В отличии от 23&Me, где моя гаплогруппа указана как: "C5b", на вышеуказанном сайте моя гаплогруппа указана правильно: "C5c1".

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 30280
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2197/-36
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
У меня срывает закачку данных на сайт с 23эндМи.      :(

Надеюсь, что просто перегрузка трафика и и позже всё получится.

Цитировать
Message
Error when connecting to 23andme API. If no further error message, please try again, URI: /haplogroups/05613dc087534b94/, Error message: -

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 30280
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2197/-36
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Загрузил один гаплотип с четвёртого раза!
Советуют теперь подождать 3 рабочих дня.
Радует, что информация на китайском языке.   :)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 30280
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2197/-36
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Никакой детализации не добавилось:


Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 30280
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2197/-36
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Дело в том, что снипов не прибавилось. Просто 23эндМи использует какую-то древнюю нотацию ИСОГГ. Если не ошибаюсь, 8-летней давности.
Поэтому по отдельным снипам дают современное обозначение субклада.
Если же наименование субклада не изменилось, то и нового ничего не получите.
Посмотрим, что китайские ребята добавят в интерпретации.


:)

Оффлайн rpolonskiy

  • Сообщений: 265
  • Страна: ua
  • Рейтинг +106/-2
  • Y-ДНК: I2a1b2a1b (CTS10228+ Y4460+ A6106+)
  • мтДНК: С5с1
Этот сайт удобен лишь как альтернатива по определению MT-Dna гаплогруппы.
Интерпретация тоже очень "информативная". Ясно, что европеец :-)


wegene.jpg

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100