АвторТема: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы  (Прочитано 10797 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 7935
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Обновлённая утилита по последнему дереву.
Цитировать
I have developed a tool to analyze mtDNA test results and predict a  haplogroup match. It uses the latest Phylotree standard reference  instead of the 1-3 years old references used by some testing services.  This allows one to get an up to date and accurate haplogroup assignment.  You can find mthap at this link:
 
 http://vps1.jameslick.com/dna/mthap/
 
 mthap currently supports the following formats:
 - 23andMe raw data files (may not have relevant markers for some haplogroups)
 - deCODEme raw data files (has very limited markers tested)
 - Differences to CRS for sequencing services like FTDNA and others (supports HVR1, HVR1+HVR2 and FGS)
 - FASTA files containing complete sequences from FTDNA, public genomes  from Genbank, and others (supports HVR1, HVR1+HVR2 and FGS but must  contain a complete sequence with CRS used for untested regions)
 
 The FASTA support is new to this version, so there may be some remaining issues with how the alignment is determined.
 
 As always, I'm eager to hear any suggestions and feedback.                                      
Обсуждение на http://dna-forums.com/index.php?/topic/13047-mthap-an-mtdna-haplogroup-analysis-tool/page__pid__212293__st__0&#entry212293

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 7935
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #1 : 16 Февраль 2011, 09:20:25 »
Обратите внимание, James Lick апгрейдил свою утилиту.

http://vps1.jameslick.com/dna/mthap/

Оффлайн Yulita

  • Сообщений: 890
  • Страна: ua
  • Рейтинг +146/-0
  • Стоя в кругу ко всем лицом не будешь...
  • Y-ДНК: R1a1a* (M17) - дедушка по папе
  • мтДНК: U5a1 - я; K1a1b1a - бабушка по папе; H1c - прабабушка по папе
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #2 : 16 Февраль 2011, 11:29:35 »
Предиктор выдает по маме U5a1d с вероятностью U5a1d2.
Интересно, изменится ли в 23иЯ ее U5a1 на более расширенное после абгрейда митогрупп под третью платформу 17 февраля?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31571
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2370/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #3 : 16 Февраль 2011, 19:40:05 »
Интересно, изменится ли в 23иЯ ее U5a1 на более расширенное после абгрейда митогрупп под третью платформу 17 февраля?
У меня изменилась на правильную. До этого одна буковка отсутствовала, несмотря на то, что нужный снип тестировался. Просто для второй панели использовали старую номенклатуру.

Оффлайн Tanasquel

  • всё светло
  • Сообщений: 806
  • Страна: ru
  • Рейтинг +31/-0
  • казакую :)
  • Y-ДНК: G2a1c2a1(L140+ U1-)
  • мтДНК: U5a1
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #4 : 18 Сентябрь 2011, 23:26:23 »
сделал для себя и жены, как интерпретировать рез-ты? что отмечается красным?

Оффлайн андрей443

  • Сообщений: 18
  • Страна: ua
  • Рейтинг +0/-0
  • Ysearch и mitosearch: WUJ8C
подскажите как правильно загрузить результаты
а они у меня вот такие

16183C  16189C  16193.1C  16217C  16362C

73G  152C  195C  263G  315.1C

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6013
  • Страна: ru
  • Рейтинг +949/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Надо скачать FASTA-файл (в нем зашифрован результат теста митоДНК). Если Вы делали тест в FTDNA он находится на страничке с результатами теста митоДНК. Именно его и нужно загружать в утилиту.

Оффлайн андрей443

  • Сообщений: 18
  • Страна: ua
  • Рейтинг +0/-0
  • Ysearch и mitosearch: WUJ8C
делал в гентисе
фаста файла там не было

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 517
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Загружаете сюда обычный текстовый файл со строкой отличий от референса, и получаете:

mthap version 0.18pre3 (2012-04-14); haplogroup data version PhyloTree Build 14 (2012-04-05) +mods
raw data source mthap-test (63B)

rCRSdiff format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR1 (16001~16569) HVR2 (1~574).

Found 1153 markers at 1153 positions covering 7.0% of mtDNA.


Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 73G 152C 195C 263G (315.1C)
CR:
HVR1: (16183C) 16189C (16193.1C) 16217C 16362C


Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) HV2

Defining Markers for haplogroup HV2:
HVR2: 73G 152C 195C 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 7193C 8860G 9336G 11935C 12061T 15326G
HVR1: 16217C

Marker path from rCRS to haplogroup HV2 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 73G ⇨ HV(A73G) ⇨ 152C 195C 7193C 9336G 11935C 12061T 16217C ⇨ HV2 ⇨ (315.1C) (16183C) 16189C (16193.1C) 16362C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(5): 73G 152C 195C 263G 16217C
Extras(2): (315.1C) (16183C) 16189C (16193.1C) 16362C
Untested(11): 750 1438 2706 4769 7028 7193 8860 9336 11935 12061 15326


2) B4

Defining Markers for haplogroup B4:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8281- 8282- 8283- 8284- 8285- 8286- 8287- 8288- 8289- 8860G 11719A 14766T 15326G
HVR1: 16189C 16217C

Marker path from rCRS to haplogroup B4 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 16189C ⇨ R(T16189C) ⇨ 8281- 8282- 8283- 8284- 8285- 8286- 8287- 8288- 8289- ⇨ B4'5 ⇨ 16217C ⇨ B4 ⇨ 152C 195C (315.1C) (16183C) (16193.1C) 16362C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(4): 73G 263G 16189C 16217C
Extras(3): 152C 195C (315.1C) (16183C) (16193.1C) 16362C
Untested(18): 750 1438 2706 4769 7028 8281 8282 8283 8284 8285 8286 8287 8288 8289 8860 11719 14766 15326


3) B4c

Defining Markers for haplogroup B4c:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1119C 1438G 2706G 4769G 7028T 8281- 8282- 8283- 8284- 8285- 8286- 8287- 8288- 8289- 8860G 11719A 14766T 15326G 15346A
HVR1: 16189C 16217C

Marker path from rCRS to haplogroup B4c (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 16189C ⇨ R(T16189C) ⇨ 8281- 8282- 8283- 8284- 8285- 8286- 8287- 8288- 8289- ⇨ B4'5 ⇨ 16217C ⇨ B4 ⇨ 1119C 15346A ⇨ B4c ⇨ 152C 195C (315.1C) (16183C) (16193.1C) 16362C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(4): 73G 263G 16189C 16217C
Extras(3): 152C 195C (315.1C) (16183C) (16193.1C) 16362C
Untested(20): 750 1119 1438 2706 4769 7028 8281 8282 8283 8284 8285 8286 8287 8288 8289 8860 11719 14766 15326 15346


3) B4b'd'e

Defining Markers for haplogroup B4b'd'e:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 827G 1438G 2706G 4769G 7028T 8281- 8282- 8283- 8284- 8285- 8286- 8287- 8288- 8289- 8860G 11719A 14766T 15326G 15535T
HVR1: 16189C 16217C

Marker path from rCRS to haplogroup B4b'd'e (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 16189C ⇨ R(T16189C) ⇨ 8281- 8282- 8283- 8284- 8285- 8286- 8287- 8288- 8289- ⇨ B4'5 ⇨ 16217C ⇨ B4 ⇨ 827G 15535T ⇨ B4b'd'e ⇨ 152C 195C (315.1C) (16183C) (16193.1C) 16362C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(4): 73G 263G 16189C 16217C
Extras(3): 152C 195C (315.1C) (16183C) (16193.1C) 16362C
Untested(20): 750 827 1438 2706 4769 7028 8281 8282 8283 8284 8285 8286 8287 8288 8289 8860 11719 14766 15326 15535


3) H32

Defining Markers for haplogroup H32:
HVR2: 73G 152C 263G
CR: 750G 1438G 4769G 8557A 8860G 15326G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H32 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 152C ⇨ H(T152C) ⇨ 73G 8557A ⇨ H32 ⇨ 195C (315.1C) (16183C) 16189C (16193.1C) 16217C 16362C

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(3): 73G 152C 263G
Extras(4): 195C (315.1C) (16183C) 16189C (16193.1C) 16217C 16362C
Untested(6): 750 1438 4769 8557 8860 15326

Оффлайн gaivans

  • Сообщений: 8
  • Страна: de
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-DNA: I2a2-DinN
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #9 : 05 Октябрь 2012, 00:22:41 »
Здравствуйте!

Мне, к сожалению, конкретного ответа программа не выдает ??? Хотя в FTDNA находится более 200 точных совпаденцев по HVR1+HVR2. Есть еще какая-то возможность уточнить подгруппу по HVR1+HVR2, или нужен полный анализ мтДНК? Результаты сейчас такие:

HVR1:    16311C    16519C
HVR2:    263G       315.1C

mitosearch.org account: YSQYA


Оффлайн Rasul

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #10 : 14 Октябрь 2012, 12:27:31 »
Решил копнуть по материнской тем что есть.
Загрузил сюда http://dna.jameslick.com/mthap-new/ файлие следующего содержания: 16256T 16270T 16399G 73G 152C 263G 309.1C 315.1C
                                                                                         
Получил ответ:

Found 1151 markers at 1151 positions covering 6.9% of mtDNA.

                    Markers found (shown as differences to rCRS):
HVR2: 73G 152C 263G (309.1C) (315.1C)
CR:
HVR1: 16256T 16270T 16399G

                     Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) U5a1a1(T152C)

Defining Markers for haplogroup U5a1a1(T152C):
HVR2: 73G 152C 263G
CR: 750G 1438G 1700C 2706G 3197C 4769G 5495C 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 15924G
HVR1: 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1a1(T152C) (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 16192C ⇨ U5a1(T16192C) ⇨ 1700C ⇨ U5a1a ⇨ 5495C 15924G ⇨ U5a1a1 ⇨ 152C ⇨ U5a1a1(T152C) ⇨ (309.1C) (315.1C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 73G 152C 263G 16192C 16256T 16270T 16399G
Extras(0): (309.1C) (315.1C)
Untested(20): 750 1438 1700 2706 3197 4769 5495 7028 8860 9477 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15218 15326 15924


2) U5a1a1a

Defining Markers for haplogroup U5a1a1a:
HVR2: 73G 152C 263G
CR: 750G 1438G 1700C 2706G 3197C 3816G 4769G 5495C 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 15924G
HVR1: 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1a1a (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 16192C ⇨ U5a1(T16192C) ⇨ 1700C ⇨ U5a1a ⇨ 5495C 15924G ⇨ U5a1a1 ⇨ 152C ⇨ U5a1a1(T152C) ⇨ 3816G ⇨ U5a1a1a ⇨ (309.1C) (315.1C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 73G 152C 263G 16192C 16256T 16270T 16399G
Extras(0): (309.1C) (315.1C)
Untested(21): 750 1438 1700 2706 3197 3816 4769 5495 7028 8860 9477 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15218 15326 15924


2) U5a1a1b

Defining Markers for haplogroup U5a1a1b:
HVR2: 73G 152C 263G
CR: 750G 1438G 1700C 2706G 3197C 4769G 5495C 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15110A 15218G 15326G 15924G
HVR1: 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1a1b (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 16192C ⇨ U5a1(T16192C) ⇨ 1700C ⇨ U5a1a ⇨ 5495C 15924G ⇨ U5a1a1 ⇨ 152C ⇨ U5a1a1(T152C) ⇨ 15110A ⇨ U5a1a1b ⇨ (309.1C) (315.1C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(7): 73G 152C 263G 16192C 16256T 16270T 16399G
Extras(0): (309.1C) (315.1C)
Untested(21): 750 1438 1700 2706 3197 4769 5495 7028 8860 9477 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15110 15218 15326 15924


3) U5a1(T16192C)

Defining Markers for haplogroup U5a1(T16192C):
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1(T16192C) (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 16192C ⇨ U5a1(T16192C) ⇨ 152C (309.1C) (315.1C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192C 16256T 16270T 16399G
Extras(1): 152C (309.1C) (315.1C)
Untested(17): 750 1438 2706 3197 4769 7028 8860 9477 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15218 15326


3) U5a1a

Defining Markers for haplogroup U5a1a:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 1700C 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1a (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 16192C ⇨ U5a1(T16192C) ⇨ 1700C ⇨ U5a1a ⇨ 152C (309.1C) (315.1C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192C 16256T 16270T 16399G
Extras(1): 152C (309.1C) (315.1C)
Untested(18): 750 1438 1700 2706 3197 4769 7028 8860 9477 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15218 15326


3) U5a1g

Defining Markers for haplogroup U5a1g:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 7792T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1g (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 16192C ⇨ U5a1(T16192C) ⇨ 7792T ⇨ U5a1g ⇨ 152C (309.1C) (315.1C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192C 16256T 16270T 16399G
Extras(1): 152C (309.1C) (315.1C)
Untested(18): 750 1438 2706 3197 4769 7028 7792 8860 9477 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15218 15326

----------------------------------------------------------------------------------
Помогите пожалуйста перевести на человеческий язык

Оффлайн kirroid

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1022
  • Страна: by
  • Рейтинг +296/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #11 : 29 Октябрь 2012, 02:10:13 »
Решил копнуть по материнской тем что есть.
Загрузил сюда http://dna.jameslick.com/mthap-new/ файлие следующего содержания: 16256T 16270T 16399G 73G 152C 263G 309.1C 315.1C
                                                                                         
...

Помогите пожалуйста перевести на человеческий язык

Переводить особо и нечего, там несколько раз написано, что Ваша гаплогруппа - U5a1a1.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 859
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-2
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-Y18348
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите: какая-то странность получается. Выложили результаты полного тестирования по Мт-ДНК тёти моего отца, но гаплогруппа в аккаунте не отображается, хотя и есть результаты. Это сбой по?


HVR1 DIFFERENCES FROM RSRS

    A16129G
    T16187C
    C16189T
    T16223C
    G16230A
    T16278C
    C16311T
    C16519T

   
HVR2 DIFFERENCES FROM RSRS

    G73A
    C146T
    C152T
    C195T
    A247G
    G263A
    522.1A
    522.2C

   
CODING REGION DIFFERENCES FROM RSRS

    G750A
    A769G
    A825t
    A1018G
    G1438A
    G2706A
    A2758G
    C2885T
    T3594C
    G4104A
    T4312C
    G4769A
    T7028C
    G7146A
    T7256C
    A7521G
    T8468C
    T8655C
    G8701A
    G8860A
    C9540T
    G10398A
    T10664C
    A10688G
    C10810T
    C10873T
    C10915T
    A11719G
    A11914G
    T12705C
    G13105A
    G13276A
    T13506C
    T13650C
    T14766C
    G15326A

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 859
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-2
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-Y18348
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите: а как уточнить митогруппу, если в аккаунте на фтдна митогаплогруппа не выложена?

См. http://forum.molgen.org/index.php/topic,1856.0.html

Точно гаплогруппу не определить?
Получился такой результат:



(BACK)

mthap version 0.19a (2013-04-08); haplogroup data version PhyloTree Build 16 (2014-02-19)
raw data source 324996-FASTA.fasta (16KB)

FASTA format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR2 (1~574) CR (575~16000).

Found 16000 markers at 16000 positions covering 96.6% of mtDNA.

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2:
CR:
HVR1:

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H2a2a1

Defining Markers for haplogroup H2a2a1:
HVR2:
CR:
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1:
H2a2a1(rCRS)

Perfect Match! Your results are an exact match to this haplogroup.

2) H2a2a1g

Defining Markers for haplogroup H2a2a1g:
HVR2:
CR:
HVR1: 16189C

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1g:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 16189C ⇨ H2a2a1g

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Untested(1): 16189

2) H2a2a1d

Defining Markers for haplogroup H2a2a1d:
HVR2:
CR:
HVR1: 16172C

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1d:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 16172C ⇨ H2a2a1d

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Untested(1): 16172

3) H2a2a1e

Defining Markers for haplogroup H2a2a1e:
HVR2:
CR: 8182T
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1e:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 8182T ⇨ H2a2a1e

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 8182C

3) H2a2a

Defining Markers for haplogroup H2a2a:
HVR2: 263G
CR:
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 263A

3) H2a2a1f

Defining Markers for haplogroup H2a2a1f:
HVR2: 93G
CR:
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1f:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 93G ⇨ H2a2a1f

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 93A

3) H2a2a1a

Defining Markers for haplogroup H2a2a1a:
HVR2:
CR: 15314A
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1a:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 15314A ⇨ H2a2a1a

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 15314G

3) H2a2a1b

Defining Markers for haplogroup H2a2a1b:
HVR2:
CR: 9299G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1b:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 9299G ⇨ H2a2a1b

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 9299A


Need help?

First, please check the Frequently Asked Questions for guidance on how to read this report. If you still have questions, there is a discussion about mthap on eng.molgen.org. You can also email your questions to me at james.lick@jameslick.com. So that I can best help you, please include a copy of the complete mthap report and/or your mtDNA data file in your email.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6013
  • Страна: ru
  • Рейтинг +949/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Утилита для определения своей Mt гаплогруппы
« Ответ #14 : 26 Сентябрь 2014, 12:48:53 »
А предиктор регулярно обновляют
Цитировать
Haplogroup Data Change History
Data Version 16.0 (2014-02-19) - Data updated to PhyloTree Build 16.
...
Ссылка на сам 16 билд PhyloTree - http://www.phylotree.org/tree/main.htm

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100