АвторТема: Статья Ж.Сабитова "Этногенез калмыков с точки зрения популяционной генетики"  (Прочитано 7840 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1404
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Спасибо, а ссылочку на ваш предиктор где можно увидеть?
Это тот самый предиктор, про который Вы спрашивали будут ли там O1, O2, O3, С3, С3с. В тестовом режиме субклады O1, O2, O3, С3 я добавил. Они пока откалиброваны только по 67-маркерным гаплотипам, но предсказывать более короткие тоже можно.
Думаю, на 17 (и 16) маркерах Y-Filer он работает неплохо, а вот более короткие гаплотипы привирает.
Вот ссылка на последнюю версию 1.0.2: http://ifolder.ru/19335948
Ее же Вы всегда можете найти в моей подписи.
По сравнению с предиктором Атея есть несомненное удобство: можно предсказывать до 200 гаплотипов за один раз.
В тоже время есть и несомненный недостаток: существует только offline-версия в виде отдельной программы, а online-версии пока нет.

2. У гаплотипов 39 и 56 - совпадение с гаплотипом N1b калмыка из работы Derenko et al. (2007).
Гаплотип 38 не совсем обычный для N1c. В статье Nasidze et al. (2005) упоминается единственный гаплотип N1c. Других кандидатур, кроме 38, не оказалось. По совокупности 17 локусов номер 38 - несомненно N1c.

3. Гаплотип 66 (19,389I,389II,390,391,392,393,385a,b,438,439,437,448,456,458,635,GATAH4(-1):
17-13-29-24-10-13-13-14,20-10-11-16-20-15-17-20-10.
Для сравнения гаплотипы корейцев О3-М122 (Kim et al., 2010):
17-13-29-24-10-13-13-15,20-10-13-15-20-15-15-21-10, разница 7 шагов,
17-13-29-24-10-13-13-14,20-10-13-15-20-15-15-21-10, разница 6 шагов,
17-12-30-24-10-13-12-14,20-10-11-15-20-15-16-21-11, разница 8 шагов.
Вполне возможно. Мой предиктор пока не откалиброван точно предсказывать по 17-маркерным гаплотипам гаплогруппы N1b, N1c, O3. Иногда он их видит, но в других случаях не решается предсказать, как с этими гаплотипами, останавливаясь на N и O.
Заметьте, именно N, а не N*(xN1b, xN1c) и O, а не O*(xO1, xO2, xO3).
То есть, он тут не спорит с Вами, а показывает более осторожное заключение.

4. Гаплотип 60 - согласен, что он относится к парагруппе L. Как я уже указывал, L включается в парагруппу К.
Отлично. Значит у меня с Вами осталось только одно расхождение.


5. Гаплотип 40:
13-13-28-23-10-16-13-13,18-11-11-14-22-16-16-23-8.
Нашел в YHRD.org 12-маркерный гаплотип сибо (Ляонин, КНР):
13-13-28-23-10-16-13-13,17-11-12-14-Х-Х-Х-Х-Х.
Но у него нет снипа. До статьи на китайском языке добраться не смог. Пришлось просмотреть более куцые гаплотипы сибо (Синьцзян, КНР) из статьи Xue et al. (2006). Нашел один гаплотип:
14-14-30-23-11-16-13-Х,Х-11-11-14-Х-Х-Х-Х-Х.
Отличие на 10 маркерах - 4 шага. Вот этот гаплотип и оказался N1*(xN1a,N1b,N1c).

Ваше мнение, Вадим?
Мне кажется, что эти 10 маркеров не такие показательные.
N есть даже на расстоянии 2 мутаций:
13-13-28-23-10-15-13-Х,Х-10-11-14-Х-Х-Х-Х-Х
К сожалению, не знаю его источника. Мне прислали в частном сообщении, без ссылки на источник.

Но и Q встречается на расстоянии 2 мутаций:
13-13-28-24-10-16-13-Х,Х-11-12-14-Х-Х-Х-Х-Х   180029
13-12-28-23-10-16-13-Х,Х-11-10-14-Х-Х-Х-Х-Х   68313
13-13-28-24-10-17-13-Х,Х-11-11-14-Х-Х-Х-Х-Х   79135
в гаплогруппном проекте Q на FTDNA

Еще я обратил внимание, что у всех N близких к гаплотипу 40, DYS19=14 (кроме приведенного мной, может он тоже Q?). В тоже время, указанные мной гаплотипы Q не имеют характерные отличительные мутации и как бы образуют облако вокруг гаплотипа 40. Что косвенно указывает на принадлежность гаплотипа 40 к гаплогруппе Q.

Поэтому относить гаплотип 40 к N мне кажется несколько поспешным. На мой взгляд, вариант с Q более вероятен, но тоже преждевременен.
« Последнее редактирование: 16 Сентябрь 2010, 14:12:50 от wertner »

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8249
  • Страна: kz
  • Рейтинг +743/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Спасибо Вадим, понял.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2129
  • Рейтинг +581/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Поэтому относить гаплотип 40 к N мне кажется несколько поспешным. На мой взгляд, вариант с Q более вероятен, но тоже преждевременен.
Давайте еще покопаем. Попытаемся зацепиться за маркеры 448, 456, 458, 635, и особенно за GATA H4, у которого редкое значение 8.

Оффлайн R2am124

  • Сообщений: 20
  • Рейтинг +2/-0
уважаемый автор статьи!

если можно, объясните как Вы определили возраст кластера  R2 a m124 как 343 года?

и нет ли информации о происхождении кластера?

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8249
  • Страна: kz
  • Рейтинг +743/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
В общем тут был TMRCA по 15 представителям данного кластера(7 мутаций на 15 человек), что дало 13,72 поколений до общего предка, Дальше умножим на 25 лет.


Оффлайн R2am124

  • Сообщений: 20
  • Рейтинг +2/-0
Уважаемый Аsan-kaygy!

а нет ли информации о времени существования общего предка прочих R2 a m 124 из Калмыкии, которые не вошли в т.н. Калмыцкий модальный кластер?

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8249
  • Страна: kz
  • Рейтинг +743/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
ЕМНИП: А там прочих вроде и не было.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100