АвторТема: Гаплогруппа H1  (Прочитано 11095 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Гаплогруппа H1
« : 24 Август 2010, 12:08:20 »
Мито моей бабушки по отцу H1. Что за зверь? У меня в 23иЯ много с такой гг.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #1 : 25 Август 2010, 22:33:27 »
Мито моей бабушки по отцу H1. Что за зверь? У меня в 23иЯ много с такой гг.

Сань, ФТДНА меня и Славу (Lesla) тоже определяет как H1. Просто у нас есть некоторые мутации, которые не укладываются в H1b. Вероятно, у нас какая-то ветвь H1b, но ещё не выделенная официально.

Саш, а у твоей бабушки по отцу какие результаты? Может сравним?  ;)

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #2 : 25 Август 2010, 23:04:05 »
Давай сравним:

данные 23иЯ

H1 defining mutations
rCRS=3010  rs3928306 
 
H defining mutations
rCRS=2706  rs2854128 
rCRS=7028  rs2015062 
 
HV defining mutations
rCRS=14766  rs3135031 
 
R0 defining mutations
rCRS=11719  rs2853495
rCRS=11719  i3001044 
 
R defining mutations
rCRS=12705  rs2854122 
rCRS=16223  rs2853513 
 
N defining mutations
rCRS=8701  i3000759 
rCRS=9540  rs2248727 
rCRS=9540  i3001497 
rCRS=10398  rs2853826 
rCRS=10873  rs2857284 
rCRS=15301  rs28573847 
rCRS=15301  i3001523 
 
L3 defining mutations
rCRS=769  rs2853519 
rCRS=769  i3001949 
rCRS=1018  rs2856982
rCRS=1018  i3001452 
 
L3'4 defining mutations
rCRS=182  rs41473347
rCRS=182  i3001445 
rCRS=3594  rs2854134 
rCRS=7256  rs28625947 
rCRS=13650  rs2854123 
rCRS=16278  rs41458645
rCRS=16278  i3001790 
 
L3'4'6 defining mutations
rCRS=4104  rs1117205 
rCRS=7521  i1000010 
rCRS=7521  i3001488 
 
L2'3'4'6 defining mutations
rCRS=195  rs2857291
rCRS=195  i3002066
rCRS=247  rs41334645
rCRS=247  i3001448 
rCRS=825  rs2853520 
rCRS=8655  rs2853822 
rCRS=8655  i3002650 
rCRS=10688  rs2853488 
rCRS=10810  rs28358282 
rCRS=10810  i3000954 
rCRS=13105  rs2853501 
rCRS=13506  rs2857287 
rCRS=15301  rs28573847 
rCRS=15301  i3001523 
rCRS=16129  rs5005270 
rCRS=16129  i3001531
rCRS=16129  i3001605
rCRS=16187  i4000590
rCRS=16187  i4000591
rCRS=16189  rs28693675
rCRS=16189  i4000587
 
L2-6 defining mutations
rCRS=152  i3001922 
rCRS=2758  rs2856980 
rCRS=2885  rs2854130 
rCRS=7146  rs28546855 
rCRS=8468  rs1116907 
rCRS=8468  i3000730 
 
L1-6 defining mutations
rCRS=146  i3001869 
rCRS=182  rs41473347
rCRS=182  i3001445 
rCRS=4312  i3002160 
rCRS=10664  rs2854121 
rCRS=10915  rs2857285 
rCRS=11914  rs2853496 
rCRS=13276  rs2853502 
rCRS=16230  rs2853514 

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #3 : 25 Август 2010, 23:22:15 »
Саш, у тебя в другом формате, чем у меня.
У меня указаны отличительные мутации от гаплогруппы H (Cambridge Reference Sequence), а тебя, как я понимаю, указаны отличительные мутации от гаплогруппы L.
Надо их как-то привести к одному из вариантов.

Мои вот:
HVR1 differences from CRS:
16189C
16356C
16519C

HVR2 differences from CRS:
263G
315.1C

CR differences from CRS:
750G
1438G
3010A
4769G
8860G
12192A
15326G
15617A

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #4 : 25 Август 2010, 23:27:21 »
Как я понял перевод мито данных из формата 23иЯ на данном этапе проблематичен. Столкнулся с этим по своей мито.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #5 : 25 Август 2010, 23:38:11 »
Как я понял перевод мито данных из формата 23иЯ на данном этапе проблематичен. Столкнулся с этим по своей мито.
В смысле, "на данном этапе"?

У меня у Матвея есть ФГС в ФТДНА и миторезультат от 23иЯ. Алекс Лешок переводил ему митоданные от 23иЯ в CRS-формат. В целом % несовпадения результатов около 15%. Некоторые мутации есть у одних, но отсутствуют у других и наоборот, и это при том, что у 23иЯ не полный ФГС делается.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #6 : 26 Август 2010, 00:14:34 »
Значит надо Алекса попросить, я в митокухне мало что понимаю.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7935
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #7 : 26 Август 2010, 10:33:21 »
Как я понял перевод мито данных из формата 23иЯ на данном этапе проблематичен. Столкнулся с этим по своей мито.
Попробуй, закинь свою сырую миту с 23ия в http://vps1.jameslick.com/dna/mthap/
Получишь в читабельном виде.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #8 : 26 Август 2010, 10:50:06 »
Спс, попробую.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #9 : 26 Август 2010, 22:50:25 »
И чего это означает  :o ???


mthap version 0.05 (2010-08-24); haplogroup data version Phylotree Build 10 (2010-08-10)
raw data source genome_Gennady_Shtrunov_Mito_20100826114838.txt (44KB)

Found 2130 markers at 2007 positions covering 12.1% of mtDNA.

Your rCRS differences found:

HVR2: 146C 152C 199C 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 15326G
HVR1: 16239T (16519C)

IMPORTANT NOTE: The above rCRS differences are almost certainly incomplete due to limitations of genotyping technology and are not comparable to mtDNA sequencing results. They should not be used with services or tools that expect sequencing results (e.g. mitosearch).

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H1

Defining Mutations for haplogroup H1:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 15326G
HVR1:

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(1): 8860G

2) H1p

Defining Mutations for haplogroup H1p:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 13470G 15326G
HVR1:

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(2): 8860G 13470G

2) H1t

Defining Mutations for haplogroup H1t:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 9986A 15326G
HVR1:

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(2): 8860G 9986A

2) H1i

Defining Mutations for haplogroup H1i:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 6237A 8860G 15326G
HVR1:

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(2): 6237A 8860G

2) H1(16189)

Defining Mutations for haplogroup H1(16189):
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 15326G
HVR1: 16189C

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(2): 8860G 16189C

2) H1j

Defining Mutations for haplogroup H1j:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4733C 4769G 8860G 15326G
HVR1:

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(2): 4733C 8860G

2) H1r

Defining Mutations for haplogroup H1r:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 9356T 15326G
HVR1:

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(2): 8860G 9356T

2) H1u

Defining Mutations for haplogroup H1u:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 9923T 15326G
HVR1:

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(2): 8860G 9923T

3) H1q

Defining Mutations for haplogroup H1q:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 4859C 8860G 15326G
HVR1: 16189C

Imperfect Match. Your results contained these differences with this haplogroup:
Extras(4): 146C 152C 199C 16239T (16519C)
Untested(3): 4859C 8860G 16189C

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #10 : 27 Август 2010, 10:57:09 »
Мои: ........ Твои:
HVR1 differences from CRS:
16189C .... Untested
- .............. 16239T
16356C .... -
16519C .... (16519C)

HVR2 differences from CRS:
- ............. 146C
- ............. 152C
- ............. 199C
263G ....... 263G
315.1C ..... -

CR differences from CRS:
750G ....... 750G
1438G ..... 1438G
3010A ..... 3010A
4769G ..... 4769G
8860G ..... Untested
12192A .... -
15326G .... 15326G
15617A .... -


Да, Саш, многовато различий - минимум 8 на FGS.
И ещё у твоего папы не мутации 16356C, характерной для H1b.
Получается, что это какая-то другая ветвь H1, иная, чем у меня и Lesl'ы.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #11 : 27 Август 2010, 11:05:14 »
Да уж, далековато.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #12 : 23 Сентябрь 2010, 20:52:50 »

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8400
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1898/-8
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #13 : 23 Сентябрь 2010, 20:56:47 »
Спасибо!

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1335/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Гаплогруппа H1
« Ответ #14 : 23 Сентябрь 2010, 21:00:38 »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100