Наверное, афразийцы к моменту прихода в Палестину были генетически неоднородны.
Мне представляется, что J в целом (без учёта субкладов) относится к древнейшему населению севера Африки и Палестины, которое до поры до времени было отделено от Е пересохшей Сахарой (до её последнего "позеленения"). Но после "позеленения" носители Е стали активно смешиваться с носителями J, о чём говорит, например, смешанный в антропологическом плане характер капсийской культуры. Однако в Палестине носители новой волны афразийских языков, где были и J (о субкладах пока не рискну говорить). и Е, наверняка застали носителей "старых" субкладов J, не успевших ещё получить примесь Е - это, видимо, и были библейские "рефаим". Северокавказские J1, вероятно, с семитами не связаны, а являются потомками тех самых "старых J". Что же касается J2, то потенциальные носители данной гаплогруппы в неолите (Мурейбет, Амук, Самарра) антропологически настолько были неотличимы от современных берберов, что, думаю, среди них была немалая доля носителей гаплогруппы Е.