Реликтовые ветви R1a*, R1a1*, R1a1а*

[Lesla]

А есть у них обозначение "rs..."?

M417 - rs17316771
Page07 - rs34297606

[VVR]

Вот роспись Page07. Page -название полиморфизмов по имени ученного D.Page, открывшего их.
Это SNP в экзоне  Y-хромосомного гена ARSDY+1089 (позиции BV678986|809979). У R и выше по "дереву" предковое значение C, у R1a в снипе прозошла субституция С на T

По новой классификации эта мутация прошла у R1a1a1. У R1a1a* её ещё нет.

[I2a1a]

Вот роспись Page07. Page -название полиморфизмов по имени ученного D.Page, открывшего их.
Это SNP в экзоне  Y-хромосомного гена ARSDY+1089 (позиции BV678986|809979). У R и выше по "дереву" предковое значение C, у R1a в снипе прозошла субституция С на T

По новой классификации эта мутация прошла у R1a1a1. У R1a1a* её ещё нет.

Верно и это.

[VVR]

Странно, не может быть чтобы из-за одного человека поменяли номенклатуру R1a1a* и R1a1a1. Это ведь может быть и приватной мутациейю. Значит, нашли не только у Волка?

Вероятно,отсутствие этой мутации нашли ещё у кого-то. Скорее всего у всей этой ветви должна быть.

[I2a1a]

Между прочим, статья Реппинга и др. (2006) - весьма толковая.
В сапплементе нашел матрицу дистанций Санкхоффа между элайнментами Y-сиквенса шимпанзе и Y-сиквенсов 47 основных гаплогрупп (по состоянию номенклатуры на 2006 год).
Построил по этой матрице дерево в TNT и, используя данные о скорости SNP cубституций, примерно оценил возраст рассхождения основных ветвей, а также время выделения ветви гомо сапиенса из общей ветви с шимпанзе.

Смотри вложенный файл.

[I2a1a]

К чести создателей TNT software, необходимо сказать, что дерево минимальных мутаций, найденное в TNT практически идентично деревьям из оригинальной статьи Реппинга и алиа (2006, сапплемент)

Для сравнения, оригинальные деревья

[Аббат Бузони]

А есть у них обозначение "rs..."?

M417 - rs17316771
Page07 - rs34297606

У меня вот что:

intergenic  8593735  rs17316771 A or G
A Aleksandr Sergachev
A Nickolay Mochalov

ARSDP  13008998  rs34297606 C or T
T Aleksandr Sergachev
T Nickolay Mochalov

Я так подозреваю, что у меня этих снипов нет.

[Lesla]

У меня вот что:

intergenic  8593735  rs17316771 A or G
A Aleksandr Sergachev
A Nickolay Mochalov

ARSDP  13008998  rs34297606 C or T
T Aleksandr Sergachev
T Nickolay Mochalov

Я так подозреваю, что у меня этих снипов нет.

Вообще-то наоборот, должны быть почти у всех R1a1a1*.

[Аббат Бузони]

Еще лучше.

[I2a1a]

Еще лучше.

ARSDP  13008998  rs34297606 C or T
T Aleksandr Sergachev
T Nickolay Mochalov

Cнип-полиморфизм Page07(rs34297606) как раз и означает, что вместо предкового значения C должно быть T.
По данным 23ия, видно что и у Сергачева, и у Мочалова такие снипы имеются, как и положено.

[Аббат Бузони]

Нашел, теперь все ясно

[wertner]

Если это предположение является верным, то ветвь, которую мы обсуждаем действительно является древней и должна быть в основании дерева R1a1.

Пару месяцев назад принял это за рабочую гипотезу и пока противоречий не вижу.
Конечно, если гипотеза Майки действительно подтвердилась снипом, то это очень интересно.

[VVR]

Если это предположение является верным, то ветвь, которую мы обсуждаем действительно является древней и должна быть в основании дерева R1a1.

Пару месяцев назад принял это за рабочую гипотезу и пока противоречий не вижу.
Конечно, если гипотеза Майки действительно подтвердилась снипом, то это очень интересно.

Судя по всему, все кого Вы перечислили - R1a1a* по новой классификации. А вот предковый гаплотип R1a1 - вопрос сложный. Надо думать.

[VVR]

Л.Майка подсказал ещё одного 67м R1a1*(предположительно), похожего на Шпаковски. Shive(USA)-M6UZH
Хотя  теоретически может быть и индейцем(Q) и R1b.

[wertner]

Ага, спасибо. Интересный гаплотип. Он слишком близко лежит к Шпаковски. Несомненно у него те же снипы, что и у Шпаковски.

Что характерно, маркеры DYS 641, DYS 557, DYS 534, DYS 444  у него тоже имеют значения ближе к предковому R1, чем у R1a*.
То есть, не зная, что Шпаковски R1a1 я бы их, по-прежнему, отнес к R1a*


На всякий случай, упомяну еще Badakhshani N63448(M124- M173- M207+)
Думаю, он ближе к R2. Может даже M479(xM124).