АвторТема: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS  (Прочитано 22499 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5523
  • Страна: 00
  • Рейтинг +445/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS
« Ответ #105 : 17 Февраль 2011, 12:39:18 »
Не могу ответить на Ваш вопрос, ув. Михаил.

16249-16311 весьма частая линия. полных сиквенсов нет.

16261-16311 очень редкая, только восточная европа и балканы. полных сиквенсов нет.

16311 16249 16261 может происходить от любой из предыдущих а может быть самостоятельной. Есть полные сиквенсы: один русский и второй такой же от tubalar - это тофалары я так понимаю? Все ГВС - только русские и украинцы. Частота у русских и украинцев в сумме 13/4200 то есть треть процента. На самом деле еще меньше из-за того что у меня в базе многовато сибирских старожилов реальная доля которых ничтожна. Правильная частота где-то 6/3000, то есть пятая часть процента. Триста тысяч человек короче. Сколько это семей кстати? Каково среднее количество родственникво по прямой женской знакомое среднестатистическому человеку?

Учитывая географию, разумно предположить что она происходит от 16261-16311.

Вариация в ней нулевая, все сиквенсы идентичны. Скажем, в неолите попала линия с Балкан и здесь вскочила мутация 16249. Но когда это было? Если в недавнем прошлом то как за это время линия попала в Восточную Сибирь?

Загадки одни.
« Последнее редактирование: 17 Февраль 2011, 12:51:18 от Valery »

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1543
  • Страна: ru
  • Рейтинг +102/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS
« Ответ #106 : 18 Февраль 2011, 05:27:54 »
Учитывая географию, разумно предположить что она происходит от 16261-16311.
Так и примем в качестве рабочей гипотезы. Теперь интересна судьба 16311 16249 16261. То, что она попала к  тофаларам (запад Иркутской области) - вполне объяснмо, через Андроновскую культуру и ее наследников.
Но возможно ли, что эта линия побывала в Азии и потом частично вернулась в Европу?
Согласитесь, что внешне моя мама не очень типична для русских из Тверской области. Впрочем, во второй половине июня я планирую взять у нее тест для FF, может быть найдем что-то интересное.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5523
  • Страна: 00
  • Рейтинг +445/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS
« Ответ #107 : 18 Февраль 2011, 09:26:30 »
Я ошибался: тофалары это тофалары а тубалары - тубалары и живут на Алтае.


Цитировать
Но возможно ли, что эта линия побывала в Азии и потом частично вернулась в Европу?

Конечно возможно. Только вот странно: для всех линий заимствованных в Азии находится источник более чем в одном месте. А здесь как-то очень глухо: один случайный тубаларский сиквенс и все. Аналогий короче нет. Я не могу обосновать теоретически что обязательно нужно 2 или 3 или больше источников, в теории можно и 0 - скажем в Сибири вымерли а у русских остались. Но на практике я с аналогичными вещами не сталкивался.


Цитировать
мама не очень типична для русских из Тверской области

В смысле, Вы пытаетесь оспорить что она из Тверской области, использую  молекулярные данные? Я не вижу противоречия, вероятность что из ~300000 16311 16249 16261 в Тверской области нет ни одного - пренебрежимо мала.

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1543
  • Страна: ru
  • Рейтинг +102/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS
« Ответ #108 : 18 Февраль 2011, 10:34:34 »
В смысле, Вы пытаетесь оспорить что она из Тверской области, использую  молекулярные данные? Я не вижу противоречия, вероятность что из ~300000 16311 16249 16261 в Тверской области нет ни одного - пренебрежимо мала.
Нет, оспорить не пытаюсь и то, что ее мать и отец родом из одной и той же деревни Тверской области, а родители родителей тоже местные - это не подлежит сомнению. Просто место довольно глухое, не на торговых путях, поэтому возможно сохранение какого-то дославянского генофонда в неразмытом виде. Само сочетание 16311 16249 16261 вполне местное, оно встречается как южнее (Клин, Тула, даже Белгород, хотя там вероятно новосёлы), северо-западнее (Волот), северо-восточнее (поморы). Так что восточно-евразийское происхождение может обнаружиться у некоторых аутосомных маркеров, а FGS о путешествии митохондриальной хромосомы вряд ли расскажет.

Оффлайн МашкИн

  • Сообщений: 741
  • Страна: ru
  • Рейтинг +87/-3
  • МашкИн Михаил Николаевич
    • Личный сайт
  • Y-ДНК: 112 R1a [Y2609*], FTDNA 219850, YSEQ 347, 6KEAB; FF; GEDMATCH T861056
  • мтДНК: FGS H* , H96, GenBank KC810015
Re: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS
« Ответ #109 : 04 Апрель 2013, 21:59:58 »
В Генбанке сравнил свою FGS. Получил девять различий с FGS одного результата

Query  181    ACAGACGAGCATACTTACTAAAGCGTGTTAATTAATTAATGCTTGTAGGacataataata  240
              |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181    ACAGGCGAACATACTTACTAAAGTGTGTTAATTAATTAATGCTTGTAGGACATAATAATA  240

Query  241    acaattgAATGTCTGCACAGCCGCTTTCCACACAGACATCATAACAAAAAATTTCCACCA  300
              |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241    ACAATTGAATGTCTGCACAGCCACTTTCCACACAGACATCATAACAAAAAATTTCCACCA  300
Query  301    aacccccccctccccccgctTCTGGCCACAGCACTTAAACACATCTCTGCCAAACCCCAA  360
              || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301    AA-CCCCCCCT-CCCCCGCTTCTGGCCACAGCACTTAAACACATCTCTGCCAAACCCCAA  358

Query  16141  ATACTTGACCACCTGTAGTACATAAAAACCCAATCCACATCaaaaccccccccccatgcT  16200
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  16139  ATACTTGACCACCTGTAGTACATAAAAACCCAATCCACATCAAAACCCCCTCCCCATGCT  16198

Query  16381  CCTCAGATAGGGGTCCCTTGGCCACCATCCTCCGTGAAATCAATATCCCGCACAAGAGTG  16440
              |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  16379  CCTCAGATAGGGGTCCCTTGACCACCATCCTCCGTGAAATCAATATCCCGCACAAGAGTG  16438

Query  16501  ATCTGGTTCCTACTTCAGGGCCATAAAGCCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAG  16560
              |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  16499  ATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAAGCCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAG  16558

Остальное всё совпадает.

Что можно сказать об удаленности моего результата со сравниваемым?
« Последнее редактирование: 04 Апрель 2013, 22:15:38 от МашкИн »

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1048
  • Рейтинг +142/-1
Re: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS
« Ответ #110 : 05 Апрель 2013, 07:42:37 »

Цитировать
Что можно сказать об удаленности моего результата со сравниваемым?
Не сосчитать... Писала о своем случае - по V1a у моего отца 9 полных совпаденцев. Расчитанное время жизни общего предка (по администратору проекта) - до 8000 лет.

Оффлайн МашкИн

  • Сообщений: 741
  • Страна: ru
  • Рейтинг +87/-3
  • МашкИн Михаил Николаевич
    • Личный сайт
  • Y-ДНК: 112 R1a [Y2609*], FTDNA 219850, YSEQ 347, 6KEAB; FF; GEDMATCH T861056
  • мтДНК: FGS H* , H96, GenBank KC810015
Re: Расчёт времени жизни MRCA по результатам FGS
« Ответ #111 : 06 Апрель 2013, 17:22:53 »

Цитировать
Что можно сказать об удаленности моего результата со сравниваемым?
Не сосчитать... Писала о своем случае - по V1a у моего отца 9 полных совпаденцев. Расчитанное время жизни общего предка (по администратору проекта) - до 8000 лет.

Если считать на одну мутацию мтДНК 3000 лет, то на девять мутаций поучается около 30000 лет. Многовато.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100