АвторТема: Люди носят гены неандертальцев  (Прочитано 13626 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #15 : 08 Май 2010, 13:49:16 »
Из обсуждаемой работы
Цитировать
We identified no fixed, non-synonymous changes in start codons where
Neandertal shows the ancestral allele. Just one non-synonymous change which is not
fixed in modern humans was identified in the melastatin gene (TRPM1). Functional
variants of the TRPM1 (CCDS10024) that use alternative start positions have been
described in human tissues and may be able to compensate for the loss of the specific
transcript variant (S42). TRPM1 encodes an ion channel with the function of
maintaining normal melanocyte pigmentation.

Оффлайн Nycticorax

  • Сообщений: 1570
  • Рейтинг +284/-35
  • Y - R1a1, mtDNA - D5a3
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #16 : 08 Май 2010, 15:03:14 »
Цитировать
Кто у нас самый рыжий? Удмурты, кажется, на первом месте, на втором - ирландцы?
Про удмуртов не знаю. Ирландцы в основном темные. Самый высокий в Европе процент рыжих это северная Англия и южная Шотландия.


Цитировать
Откуда думают, что скифы были рыжие? (или я не прав?)
Подозреваю потому что у мумий волосы выцветают до рыжего цвета (у замерзших в мерзлоте мамонтов, кстати, тоже). Поэтому пазырыкцев сначала записали в рыжих.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #17 : 08 Май 2010, 16:14:57 »
Хотя в  обсуждаемой работе и сопоставляются гаплотипы пигментации (локализованные на 17 хромосме), например,H6 и H2, однако убедительных выводов о происхождении эти гаплотипов и наличии у неандеров сделано не было.

Весьма неубедительны и 8 моделей (4 типов)  обмена генетической информацией между сапиенсами cовременного вида и неандерами (Homo sapiens neanderthalensis). Вообще-то в первоначальном манускрипте слишком много оговорок - предположительно, возможно, статистически вероятно, теоретически может быть объясненно. Однако в масс-медиа эти факты были изложены уже без всяких сослогательных наклонений-конъюктивов. Так рождаются благодаря масс-медиа  городские легенды о рыжих и светлопигментированных неандерах и прочее.
« Последнее редактирование: 11 Май 2010, 15:43:03 от Vadim Verenich »

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #18 : 08 Май 2010, 16:33:00 »
Я "пробластил" в Генбанке (то есть запустил BLAST search) по неандертальскому митосиквенсу, чтобы посмотреть, насколько далеко он расположен от человеческого





Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #19 : 08 Май 2010, 16:43:39 »
Интересно также, что в Генбанке в новую таксономию Homininae в Homo уже включен третий тип  Homo sapiens -Homo sapiens Altai (Denisova hominin). По митохондриальному геному он очень далеко отстоит и от сапиенса современного вида, и от неандера


Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #20 : 10 Май 2010, 19:08:12 »
Как отмечается в статье, выявленное в 748 фрагментах митохондриальное ДНК неандертальца El Sidr?n 1253 отличается от человеческого на 130 позиций. Это подверждает приличную филогенетическую дистанцию между неандерталской митоДНК и митоДНК современного человека (см. наглядную иллюстрацию по моим построениям).
Исследование Burbano et al. 2010 (Targeted Investigation of the Neandertal Genome by Array-Based
Sequence Capture) выявило, что в в выявленных фрагментах мтДНК из El Sidron полностью практически полностью отсутствует следы контоминации генным материалом человека.

О чем это нам говорит?

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10300
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1730/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #21 : 10 Май 2010, 19:14:23 »
О чем это нам говорит?
О дешевой сенсации.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #22 : 10 Май 2010, 19:23:13 »
О чем это нам говорит?
О дешевой сенсации.

Бинго. :)

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #23 : 10 Май 2010, 19:40:25 »
Самое неубедительное в обеих работах это

1)отбор снипов для анализа (перекрестное сравнение снипов орангутанга, человека и шимпанзе - выбрали те, которые у человека являются, как считается, потомковыми).
2) по отобранным снипами произвели выравнивание (alignment) сиквенсов шимпанзе, человека и неандертальца фазирование предкового генотипа общего предка человека, неандертальца и современного человека (т.е говоря проще, реконструировали (предсказали) гипотетический генотип по методу Байесовской апостериорной вероятности)
3) затем разбили фрагменты генома неандертала по снипами по признаку совпадения или несовпадения с предковыми значения гипотетического сиквенса общего предка шимпанзе и гомо, на три группы -гомозиготные с предковым значением снипа, гомозиготные  с потомковым значением и просто гетерозиготы.

Про исключения более половины мутаций (пусть и синонимических), я вообще молчу.

Но кто может гарантировать, что предковый генотип реконструирован верно, и, что самое главное - где доказательство того, что у неандертала должно быть именно предковое значение снипа, а не мутировавшее параллельно с человеком.

Наконец, на приведенном выше графике, разброс участков генома совпадающих у человека и неандертальца по X хромосоме, находится в меньшем диапозоне SD (стандартного отклонения), эти участки небольшие, но по структуре более дивергентные.
Из чего следует 2 вывода:
a) основное генное вливание шло через X хромосому и b) поскольку около 2/3 генетической информации X хромосомы аккумулируется в женских линиях, то направление вливания шло через самок неандертальцев и мужчин-сапиенсов, что несколько противроечит картине изображенной в первой статье.
« Последнее редактирование: 10 Май 2010, 20:24:14 от Vadim Verenich »

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #24 : 10 Май 2010, 21:13:41 »
Цитировать
то направление вливания шло через самок неандертальцев и мужчин-сапиенсов, что несколько противроечит картине изображенной в первой статье.
А что же тогда с митохондрией?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #25 : 10 Май 2010, 21:15:11 »
Цитировать
то направление вливания шло через самок неандертальцев и мужчин-сапиенсов, что несколько противроечит картине изображенной в первой статье.
А что же тогда с митохондрией?

У гибридов, митохондрии от самок неандерталов, так же как и X.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #26 : 10 Май 2010, 21:40:11 »
Цитировать
то направление вливания шло через самок неандертальцев и мужчин-сапиенсов, что несколько противроечит картине изображенной в первой статье.
А что же тогда с митохондрией?

У гибридов, митохондрии от самок неандерталов, так же как и X.
я имел ввиду у сапиенсов их нет в настоящем времени, и похоже не было

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #27 : 10 Май 2010, 21:59:20 »
Цитировать
то направление вливания шло через самок неандертальцев и мужчин-сапиенсов, что несколько противроечит картине изображенной в первой статье.
А что же тогда с митохондрией?

У гибридов, митохондрии от самок неандерталов, так же как и X.
я имел ввиду у сапиенсов их нет в настоящем времени, и похоже не было

Не было и нет,  разумеется. :) Об этом никто и не спорит.
Речь шла, образно говоря, об аутосомном генетическом бульоне человека, в котором якобы варятся ингредиенты от неандера. Но я убежден, что сходство обратное, т.е ряд наших генов перешел к ним.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #28 : 16 Май 2010, 22:11:17 »
АК
Цитировать
А поскольку статья заключает, что потомство (возможное) было не в Африке, то речь уже о последних 70-60 тысячах лет назад, причем скорее в Азии. Либо азиатские люди, имевшие потомство с неандерами, не вышли из Африки, и тогда срок опять расширяется. Именно потому статья может рассматриваться как намек на пересмотр гипотезы "из Африки".

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1544
  • Страна: ru
  • Рейтинг +103/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Люди носят гены неандертальцев
« Ответ #29 : 22 Июнь 2010, 05:31:12 »
В очередном популярном пересказе новостей от Сванте Паабо
http://www.rg.ru/2010/06/02/geny.html
названы конкретные датировки:
Цитировать
ученые дали сенсационное заключение: homo sapiens и неандертальцы скрещивались около 60 тысяч лет назад и около 45 тысяч лет назад.
Цитировать
По мнению специалистов, потомки первого скрещивания мигрировали в Европу, Азию и Северную Америку, а потомки второго - в страны Океании.
Каким образом это увязать с 48 хромосомами неандертальца? Его гибриды с неандером должны иметь 47 хромосом и быть бесплодны, как мулы?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100