АвторТема: R1a1 в Азии  (Прочитано 121429 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12665
  • Страна: az
  • Рейтинг +2800/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #570 : 14 Август 2012, 11:46:05 »
Цитировать
Большая часть гуджаратских R1a1 из проекта 1000 геномов L657+.
Это 11 из 14 гуджаратских образцов (R-L342). Но в целом по Индии R-L342* больше, чем R-L657.
Юрган, где можно глянуть результаты тысяча и одного генома по Индии?

Как я понимаю, в Индии - все только Z93 и ниже (L342, L657), и никакого "наивысшего разнообразия индийских R1a", о котором писал П-тр П-трович Андерхилл, не выявилось?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8766
  • Страна: gt
  • Рейтинг +742/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #571 : 14 Август 2012, 12:32:27 »
Цитировать
Большая часть гуджаратских R1a1 из проекта 1000 геномов L657+.
Это 11 из 14 гуджаратских образцов (R-L342). Но в целом по Индии R-L342* больше, чем R-L657.
Юрган, где можно глянуть результаты тысяча и одного генома по Индии?

Как я понимаю, в Индии - все только Z93 и ниже (L342, L657), и никакого "наивысшего разнообразия индийских R1a", о котором писал П-тр П-трович Андерхилл, не выявилось?
Здесь сложно говорить, так как нет научных выборок с проверенными Z93, L342 и L657.
А по коммерческим выборками Z93* хоть редко, но встречается.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5504
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2901/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #572 : 14 Август 2012, 14:04:45 »
Юрган, где можно глянуть результаты тысяча и одного генома по Индии?
Не Юрган, но возьму на себя смелость ответить :)
Тут несколько табличек с результатами.
Последняя схемка.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12665
  • Страна: az
  • Рейтинг +2800/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #573 : 14 Август 2012, 15:06:33 »
Спасибо, Семаргл. Всё равно, ожидалось куда более высокое разнообразие R1a в Индии, а оно там всё сводится к одному единственному глобальному субкладу Z93...

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5504
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2901/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #574 : 02 Сентябрь 2012, 11:49:33 »
Еще один новый 111-ти маркерный гаплотип: #M7832 Al Hassan

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8766
  • Страна: gt
  • Рейтинг +742/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #575 : 03 Сентябрь 2012, 07:01:30 »
Еще один новый 111-ти маркерный гаплотип: #M7832 Al Hassan
Наверняка - L342.
По некоторым редким показателям сближается башкирской ветвью.

Оффлайн KHAN

  • Сообщений: 290
  • Страна: kz
  • Рейтинг +70/-0
  • Y-ДНК: R-S3373*, J-ZS2366*, R-S1327*, R-YP1137*, R-YP4078*, I-Y3118*, I-Y10622*
  • мтДНК: U5b1a1b, N1b1a8a, H7c1, H1c
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #576 : 12 Сентябрь 2012, 10:17:26 »
Владимир,
Прошу включить в базу новый 67 маркерный гаплотип kit# M6843, возможно даже он L657+ :)

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9168
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2353/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #577 : 14 Сентябрь 2012, 00:22:22 »
Владимир,
Прошу включить в базу новый 67 маркерный гаплотип kit# M6843, возможно даже он L657+ :)
M6843 - http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/48428/
Очень может быть, что и L657+

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12665
  • Страна: az
  • Рейтинг +2800/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #578 : 06 Октябрь 2012, 17:12:34 »
Интересно, чем можно объяснить высокое STR-разнообразие индийских R1a (Андерхилл датировал их ВБОП около 15 тыс. лет) при условии, что там, судя по всему, всего один глобальный субклад L657? Ну неужели в разных популяциях или субкладах разные скорости?

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8729
  • Страна: kz
  • Рейтинг +843/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #579 : 06 Октябрь 2012, 18:04:38 »
Там не только L657
Z1223+ был найден у двух индусов из штата Гуджарат:
http://forum.molgen.org/index.php/topic,4352.0.html

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8729
  • Страна: kz
  • Рейтинг +843/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #580 : 06 Октябрь 2012, 18:06:12 »
Ну неужели в разных популяциях или субкладах разные скорости?
Я думаю тут больше связи с демографией, насколько быстро росла численность популяции. При малом росте или сохранении численности будет одна "скорость" при взрывном росте другая.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2214
  • Рейтинг +649/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #581 : 07 Октябрь 2012, 06:39:04 »
Интересно, чем можно объяснить высокое STR-разнообразие индийских R1a (Андерхилл датировал их ВБОП около 15 тыс. лет) при условии, что там, судя по всему, всего один глобальный субклад L657? Ну неужели в разных популяциях или субкладах разные скорости?
Полученные TMRCA надо делить на 3, т.к. авторы использовали "эволюционную" скорость мутаций 0.00069. Статистика по популяциям маленькая, гаплотипы короткие. Разделения на ветви отсутствует. Поэтому насчет разнообразия индийских R1a вопрос дискуссионный.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12665
  • Страна: az
  • Рейтинг +2800/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #582 : 07 Октябрь 2012, 07:18:12 »
Да, более точно было бы утверждать, что глобальным субкладом является Z93. Тем не менее, речь не о количественном, а о качественном разнообразии. Дело не в росте численности - недавние родственники, даже в милионном количестве являлись бы носителями сходных гаплотипов. А по расчётам Андерхилла выходит, что самые разнообразные, или иначе говоря - древние R1a в Индии.

Тут возможны два сценария:
 1) в Индии больше одного глобального субклада уровня Z93 - невероятно, его бы нашли бы
 2) в огромнной популяции становится возможным вылавливать  самые немыслимые мутации, которые фантомно удревняют возраст.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8729
  • Страна: kz
  • Рейтинг +843/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #583 : 07 Октябрь 2012, 07:42:56 »
Дело не в росте численности - недавние родственники, даже в милионном количестве являлись бы носителями сходных гаплотипов.
Сколько миллионов мужчин-R1a в Индии живет? Сотни миллионов, сколько из них протестировалось? Я сам не знаю, ну думаю в ФТДНА и 100 не будет. У Андерхилла не помню сколько но не очень много и не по большому количеству маркеров.
Можно ли на основе такой малой выборки что-либо утверждать? Думаю нет.
Кроме того есть случаи (например мой) когда в одном роде две ветви на 12 маркерах отличаются тройной мутацией в одном маркере. Если бы строили филогенетические деревья мы бы наверное подумали что это разные ветви разделенные  более чем 1000-2000 лет. Хотя по истории разделение было около 400 лет назад. А если учесть что таких веток будет очень много к какому эффекту это может привести? Наверное к тому что некоторые разные ветви на малых маркерах будут похожи друг на друга, а их младшие ветки наоборот не похожи. Так что будущее не за СТР-разнообразием (хотя оно иногда и полезно) а за СНИПами.

Оффлайн Каржавин

  • ...
  • Сообщений: 1842
  • Рейтинг +144/-2
Re: R1a1 в Азии
« Ответ #584 : 07 Октябрь 2012, 12:49:02 »
С первым утверждением
Можно ли на основе такой малой выборки что-либо утверждать? Думаю нет.
действительно можно согласиться. А вот далее
Кроме того есть случаи (например мой) когда в одном роде две ветви на 12 маркерах отличаются тройной мутацией в одном маркере. Если бы строили филогенетические деревья мы бы наверное подумали что это разные ветви разделенные  более чем 1000-2000 лет. Хотя по истории разделение было около 400 лет назад. А если учесть что таких веток будет очень много к какому эффекту это может привести? Наверное к тому что некоторые разные ветви на малых маркерах будут похожи друг на друга, а их младшие ветки наоборот не похожи. Так что будущее не за СТР-разнообразием (хотя оно иногда и полезно) а за СНИПами.
не совсем верно.
Если выборка большая, то в силу вступают все следствия закона больших чисел. В частности, суммарная частота появления тройных мутаций на коротких интервалах времени будет примерно соответствовать оценке теоретически предполагаемой вероятности. ОТдельные аномалии типа Вашего случая утонут в общей массе статистических данных и их влияние будет ровно таким, какого требует теория. Так что СТР-разнообразие и при наличии снипов еще послужит.
Кроме того, снипы, как мне кажется, дадут структуру дерева, но не дадут взаимных масштабов длин ветвей во времени. К тому же пресечение множества ветвей на разных стадиях эволюции генеалогических деревьев даже при наличии снипов не позволят точно восстановить длины ветвей (измеряемые в кол-ве поколений), а ведь это то, чего мы постоянно пытаемся вычислить.
« Последнее редактирование: 07 Октябрь 2012, 14:03:06 от Каржавин »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100