АвторТема: GenBank  (Прочитано 26167 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: GenBank
« Ответ #45 : 30 Июнь 2010, 01:39:57 »
    " Ко всем, прошедшим мито-ДНК FGS тест, большая просьба - закинуть свои результаты в ГенБанк.
Это очень просто - благодаря добровольческой деятельности Айана Логана."

   Сейчас попробовал сделать это, следуя нижеуказанным рекомендациям. А как я узнаю, что эти данные дошли куда надо? Мне сертификат пришел три месяца назад,  а про GenBank
я только сейчас прочитал.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: GenBank
« Ответ #46 : 30 Июнь 2010, 06:31:46 »
    " Ко всем, прошедшим мито-ДНК FGS тест, большая просьба - закинуть свои результаты в ГенБанк.
Это очень просто - благодаря добровольческой деятельности Айана Логана."

   Сейчас попробовал сделать это, следуя нижеуказанным рекомендациям. А как я узнаю, что эти данные дошли куда надо?
...
Кирилл, вы получите два подтверждающих письма, сначала, от Ian Logan (типа: ... Thank you for your email and for sight of your sequence...), а потом из ГенБанка - от Susan Schafer PhD (типа: ... Thank you for your direct submission of sequence data to GenBank...).

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: GenBank
« Ответ #47 : 30 Июнь 2010, 22:56:28 »
     Привет, Сергей! Спасибо за ответ. Я получил письмо от Логана - сразу же. Только меня сильно подводит непривычка общаться по-английски. Я несколько раз прочитал это письмо, но пока не понял, что делать дальше. Я понимаю так, что я должен не просто ждать, когда мне придет письмо из этого банка, а написать этой Сьюзан что-то сам. Они всегда упоминают о конфиденциальности - лично меня это не волнует. Могу дать согласие на все что угодно. И еще он упоминает какую-то якобы важную деталь. Какую -  я пока не понял. И еще я понял, что какие-то мои данные будут записаны не под именем "попов", а под другим.  А страна-origin - Россия. Хотя логичнее было бы - Британские острова. Россия  здесь - только location. Так что, пока я в некоторой заминке.. И отвечать ему не спешу. Если можно, поделитесь опытом. Вы туда писали?
   В прошлый четверг надеялся застать вас на этом собрании в "Авангарде". Звонил вам весь день на мобильный, но ответа нет - только музыка играет. Это вы что поставили? Я все время прислушивался, стараясь угадать, на каком языке она поет. Что-то среднее между английским и испанским.
   

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: GenBank
« Ответ #48 : 01 Июль 2010, 16:33:48 »
Я понимаю так, что я должен не просто ждать, когда мне придет письмо из этого банка, а написать этой Сьюзан что-то сам.
Да, Кирилл. Вы должны отправить Сюзане письмо и приложить к нему те файлы (кажется их три), которые вы получили (уже обработанные) от Яна Логана.
Я написал ей так:

Hello Susan Schafer!
I attach my submission file for GenBank, named 'ваше название.sqn'.
It is my mitochondrial DNA sequence and has not been published anywhere.
Thank you
Sergey Vasilyevich Lutak

...
И еще я понял, что какие-то мои данные будут записаны не под именем "попов", а под другим.  А страна-origin - Россия. Хотя логичнее было бы - Британские острова. Россия  здесь - только location.
...
Ну это вы, вероятно, сами указали "Russia". Надо было написать "British Islands".
Может ещё можно подкорректировать в отправляемых файлах. Но я точно не знаю.
А фамилия должна быть ваша - Попов. Это же ваша митоДНК.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: GenBank
« Ответ #49 : 01 Июль 2010, 16:40:07 »
...
   В прошлый четверг надеялся застать вас на этом собрании в "Авангарде". Звонил вам весь день на мобильный, но ответа нет - только музыка играет. Это вы что поставили? Я все время прислушивался, стараясь угадать, на каком языке она поет. Что-то среднее между английским и испанским.

Нет, Кирилл, я ничего "не ставил". Может это "происки" БиЛайна?  :)

Кирилл, если не трудно, скиньте мне ещё раз в личку свои номера (дом. и моб.). Может, у меня в телефоне что-то сбилось и ваш номер не определился. Проверю.

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: GenBank
« Ответ #50 : 04 Сентябрь 2010, 01:24:18 »
     Действительно,нашел в ГенБанке свои данные. Они были опубликованы еще месяц назад. Подскажите, пожалуйста, как можно ими пользоваться? Вадим пишет, что может поvестить их на древо. Буду весьма признателен. Мой код HM776018. К сожалению, как я уже писал, полное секвенирование никаких совпадений не обнаружило.

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 11074
  • Страна: ee
  • Рейтинг +754/-8
Re: GenBank
« Ответ #51 : 04 Сентябрь 2010, 15:02:26 »
     Действительно,нашел в ГенБанке свои данные. Они были опубликованы еще месяц назад. Подскажите, пожалуйста, как можно ими пользоваться? Вадим пишет, что может поvестить их на древо. Буду весьма признателен. Мой код HM776018. К сожалению, как я уже писал, полное секвенирование никаких совпадений не обнаружило.

Сделано.Сиквенс помещен на дереве.

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: GenBank
« Ответ #52 : 05 Сентябрь 2010, 23:06:30 »
     Вадим! Подсажи, пожалуйста, где можно найти это древо. Сергей написал мне, что он не нашел. Я тоже не знаю. Видел только какой-то небольшой кусочек в теме. И как я там найду себя?

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8505
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1951/-8
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: GenBank
« Ответ #53 : 14 Сентябрь 2010, 13:19:58 »
Мою учетную запись HQ184065 наконец активировали!
Вадим, внесите и меня пожалуйста на Ваше древо!

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +60/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a* (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: GenBank
« Ответ #54 : 14 Сентябрь 2010, 23:47:43 »
Мою учетную запись HQ184065 наконец активировали!
Вадим, внесите и меня пожалуйста на Ваше древо!
Присоединяюсь к просьбе Вячеслава.

Вадим, внесите, пожалуйста Вячеслава на древо митогруппы H!
У нас с Славой один кластер. Было бы интересно увидить наш TMRCA на вашем древе.
Заранее благодарю.

Оффлайн arbuz

  • Сообщений: 139
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: N1c1d
  • мтДНК: J1c2c2a
Re: GenBank
« Ответ #55 : 19 Октябрь 2010, 13:03:36 »
Дабавили и меня GenBank HQ336424

Хочу на дерево  ;D

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: GenBank
« Ответ #56 : 23 Октябрь 2010, 22:32:26 »
     Месяц назад посмотрел себя на древе. Удивился, что значит такое местоположение. Почему так? Задал вопрос, но никто не ответил. Потом снова пытался заглянуть на это древо и опять его не нашел. Может, кто подскажет, на какой части форума оно расположено. Постараюсь запомнить.

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 11074
  • Страна: ee
  • Рейтинг +754/-8
Re: GenBank
« Ответ #57 : 23 Октябрь 2010, 22:46:04 »
     Месяц назад посмотрел себя на древе. Удивился, что значит такое местоположение. Почему так? Задал вопрос, но никто не ответил. Потом снова пытался заглянуть на это древо и опять его не нашел. Может, кто подскажет, на какой части форума оно расположено. Постараюсь запомнить.

http://forum.molgen.org/index.php/topic,64.msg56839.html#msg56839

Я вроде бы ответил на Ваш вопрос.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1049
  • Рейтинг +140/-1
Re: GenBank
« Ответ #58 : 27 Октябрь 2010, 23:05:10 »
Не поняла, строится Древо или уже нет? На случай, если возобновится эта тема, номера в GenBankе отца, мамы, мужа:
HQ405767
HQ405756
HQ405768

Оффлайн I2a1aАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 11074
  • Страна: ee
  • Рейтинг +754/-8
Re: GenBank
« Ответ #59 : 27 Октябрь 2010, 23:11:28 »
Я думаю, что теперь, после возвращения на форум главного митоспециалиста Valery, Вашу просьбу насчет реконструкции митодеревьев можно смело переадресовывать ему.

Ибо как говорится в Евангелии (Лука 3:16-17): "я крещу вас водою, но идёт Сильнейший меня, у Которого я недостоин развязать ремень обуви; Он будет крестить вас Духом Святым и огнем. "

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100