АвторТема: GenBank  (Прочитано 40486 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн df27

  • Сообщений: 480
  • Страна: am
  • Рейтинг +35/-5
  • Y-ДНК: R1b>P312>df27>A431>Y7363
  • мтДНК: X1
Re: GenBank
« Ответ #105 : 28 Ноябрь 2015, 19:10:42 »

Оффлайн df27

  • Сообщений: 480
  • Страна: am
  • Рейтинг +35/-5
  • Y-ДНК: R1b>P312>df27>A431>Y7363
  • мтДНК: X1
Re: GenBank
« Ответ #106 : 28 Ноябрь 2015, 19:19:58 »
http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/k1b_genbank_sequences.htm Ярослав я тебя тут не вижу давай сюда  ;)

О! Спасибо, сейчас зальюсь :)
a kak ?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: GenBank
« Ответ #107 : 28 Ноябрь 2015, 20:03:46 »

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GenBank
« Ответ #108 : 17 Декабрь 2015, 21:37:46 »
Прикольно. Кто-нибудь может объяснить как мои результаты в эту базу попали? Я не возражаю против этого. Но я вроде сам не заливал их сюда. http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/u3b_genbank_sequences.htm

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: GenBank
« Ответ #109 : 17 Декабрь 2015, 22:15:24 »
Прикольно. Кто-нибудь может объяснить как мои результаты в эту базу попали? Я не возражаю против этого. Но я вроде сам не заливал их сюда. http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/u3b_genbank_sequences.htm

А Вы вспомните, когда полный митосиквенс получили, спрашивали - не возражаете ли против занесения данных.    :)

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GenBank
« Ответ #110 : 17 Декабрь 2015, 22:40:19 »
Прикольно. Кто-нибудь может объяснить как мои результаты в эту базу попали? Я не возражаю против этого. Но я вроде сам не заливал их сюда. http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/u3b_genbank_sequences.htm

А Вы вспомните, когда полный митосиквенс получили, спрашивали - не возражаете ли против занесения данных.    :)
это данные 23andme. Есть подозрение что отсюда слизали https://opensnp.org/genotypes. Но мне нечего скрывать. Я не в розыске. Только эти данные надо обновлять. Вчера результаты full mito получил. Кстати, кто-нибудь подскажет, как это сделать?
« Последнее редактирование: 17 Декабрь 2015, 22:46:34 от ankr21 »

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 4079
  • Страна: rw
  • Рейтинг +1584/-8
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: GenBank
« Ответ #111 : 17 Декабрь 2015, 22:55:16 »
Вкладка результаты, справа внизу: Download FASTA File

И в ручном режиме в Genbank)))

http://www.ianlogan.co.uk/Submission.htm

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GenBank
« Ответ #112 : 18 Декабрь 2015, 10:07:26 »
Прикольно. Кто-нибудь может объяснить как мои результаты в эту базу попали? Я не возражаю против этого. Но я вроде сам не заливал их сюда. http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/u3b_genbank_sequences.htm

А Вы вспомните, когда полный митосиквенс получили, спрашивали - не возражаете ли против занесения данных.    :)
это данные 23andme. Есть подозрение что отсюда слизали https://opensnp.org/genotypes. Но мне нечего скрывать. Я не в розыске. Только эти данные надо обновлять. Вчера результаты full mito получил. Кстати, кто-нибудь подскажет, как это сделать?
Моя версия подтвердилась. http://www.ianlogan.co.uk/23andme/23andme_opensnp.htm
Получается, кто хочет в этой базе засветится, может залить данные в https://opensnp.org/
Примечательно, что я свои данные залил на этой неделе. И уже в базе! Попробую тоже самое проделать с данными отца.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GenBank
« Ответ #113 : 18 Декабрь 2015, 10:13:39 »
Вкладка результаты, справа внизу: Download FASTA File

И в ручном режиме в Genbank)))

http://www.ianlogan.co.uk/Submission.htm
Отправил письмо со сформированным программой файлом *.sqn Susan Schafer. Надеюсь ничего не перепутал. А то я в английском не силен.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GenBank
« Ответ #114 : 21 Декабрь 2015, 22:50:57 »
Ну вот. Номер присвоили. Пришло сообщение на почту. Но пока в банке себя не нахожу. KU318667. Не подскажите, как долго грузят данные в банк?

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GenBank
« Ответ #115 : 23 Декабрь 2015, 10:47:42 »
Ну вот. Номер присвоили. Пришло сообщение на почту. Но пока в банке себя не нахожу. KU318667. Не подскажите, как долго грузят данные в банк?
Обещают опубликовать данные 27 декабря. Надеюсь так и будет. Вообщем не так уж и сложно оказалось залить свои данные в GenBank.  Правда на дереве я себя вряд ли увижу. Поэтому пока не представляю что мне это все дает.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GenBank
« Ответ #116 : 28 Декабрь 2015, 16:51:22 »
Ну вот. Номер присвоили. Пришло сообщение на почту. Но пока в банке себя не нахожу. KU318667. Не подскажите, как долго грузят данные в банк?
Обещают опубликовать данные 27 декабря. Надеюсь так и будет. Вообщем не так уж и сложно оказалось залить свои данные в GenBank.  Правда на дереве я себя вряд ли увижу. Поэтому пока не представляю что мне это все дает.
Увидел себя в GenBank. KU318667. Группа U3b1b. Сделал вывод, что это все таки не цыганский субклад. Цыганский - U3b1c. Хотя цыгане тоже разные. Кто-нибудь коллекционирует файлы FASTA и строит деревце для группы U?

Оффлайн semen0753

  • Сообщений: 290
  • Страна: by
  • Рейтинг +145/-0
  • Y-DNA:R-Y42738 R1a1a1b1a2a2a1a2~(ISOGG)mtDNA:T2b4a
Re: GenBank
« Ответ #117 : 15 Февраль 2017, 23:23:52 »
Присвоили номер в GenBank: KY573997. Обещают опубликовать 18 февраля. Жду. :D
« Последнее редактирование: 16 Февраль 2017, 11:56:02 от semen0753 »

Оффлайн DocSVX

  • H48 R-M198
  • Сообщений: 25
  • Страна: ua
  • Рейтинг +1/-0
Re: GenBank
« Ответ #118 : 16 Февраль 2017, 13:48:34 »
а где посмотреть свои данные что то я никак не могу их найти хоть ответ давно пришел

Оффлайн semen0753

  • Сообщений: 290
  • Страна: by
  • Рейтинг +145/-0
  • Y-DNA:R-Y42738 R1a1a1b1a2a2a1a2~(ISOGG)mtDNA:T2b4a
Re: GenBank
« Ответ #119 : 16 Февраль 2017, 17:21:02 »
а где посмотреть свои данные что то я никак не могу их найти хоть ответ давно пришел

Заходишь на сайт https://www.ncbi.nlm.nih.gov/.Выбираешь Nucleotide левее поискового поля, в пустое поле вводишь свой номер и жмешь кнопку Search. Появятся данные.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.